Platinum SuperFi II 高保真酶：为 NGS 精准测序保驾护航

2025-05-29 12:26:54, 赛默飞生命科学赛默飞世尔科技生命科学产品

在基因组学、精准医疗和生命科学研究快速发展的今天，下一代测序技术 (NGS) 已成为探索生命奥秘、推动临床诊断和药物研发的核心工具。从癌症早筛到病原体检测，从遗传病研究到农业育种，NGS 的高通量、高灵敏度特性正在重塑科研与医疗的边界。测序数据的准确性始终是 NGS 应用的基石——若在文库构建和扩增阶段引入错误，轻则增加数据分析负担，重则导致错误结论，影响科研可信度或临床决策。

如何确保 NGS 数据从源头就精准可靠？

NGS 技术的核心挑战之一是如何在 PCR 扩增阶段尽可能减少错误碱基的引入。保真度较低的 PCR 酶导致的突变或偏向性扩增会显著增加测序数据的噪音，影响变异检测 (如 SNP、Indel) 的准确性，尤其在低频突变分析或肿瘤异质性研究中可能造成误判。

Invitrogen^™ Platinum^™ SuperFi II DNA聚合酶以其卓越的保真性能、强大的扩增能力和广泛的模板适应性，成为 NGS 全流程中不可或缺的“精准引擎”。它不仅能够尽可能减少扩增错误，还能高效攻克复杂模板，为科研与临床提供值得信赖的测序基础。

卓越的准确度：经 NGS 测序鉴定，其保真度高出 Taq 保真度 300 倍以上
扩增效率高：高效扩增困难样本，如高 GC 含量、长片段、纯度不佳的样本
简化实验流程：60°C通用引物退火温度，无需计算 T_m，不同 PCR 反应可同时扩增
特异性强：抗体热启动技术，确保高特异性扩增，更适用于高通量自动化和多重 PCR

Platinum SuperFi II 在 NGS 中的广泛应用

CHO 细胞的单细胞线粒体测序

研究开发了中国仓鼠卵巢细胞 (CHO 细胞) 的单细胞线粒体 DNA 测序 (scmtDNAseq) 完整工作流程，为解析线粒体异质性对细胞表型的影响及优化生物制药细胞株提供了新工具。本文中使用 Platinum SuperFi II 高保真酶进行长距离 PCR (LrPCR)，扩增 mtDNA 两个片段 (8.5kb)。

经客户测试验证，使用 Platinum SuperFi II 高保真酶可以扩增大于 16 kb 的全长线粒体序列，而无需进行分段扩增。

非洲猪瘟病毒的快速溯源和监测

非洲猪瘟病毒 (ASFV) 对养猪业威胁巨大，传统全基因组测序成本高、耗时长。本文开发了一种多重 PCR 结合纳米孔测序的分型方法。该方法可在5 小时内处理 48 个样本，成本低且适用于血液、血清、肝脏等多种生物基质，为 ASFV 疫情中的快速溯源和监测提供了高效工具。

HIV 治疗研究

SIV/HIV 病毒储存库是治愈 HIV 的主要障碍，因为潜伏感染的细胞在抗逆转录病毒治疗 (ART) 后仍然存在，并在治疗中断后引起病毒反弹。在 PacBio 测序之前，使用 Platinum SuperFi II 预混液进行 SHIV 预扩增。通过近全长测序研究接受 ART 治疗的 SHIV 感染猕猴从血液、淋巴结和结肠中提取的 SHIV 病毒的遗传完整性和克隆性。研究结果提示淋巴结可能是病毒反弹的主要来源, 为靶向淋巴组织的 HIV 治愈策略提供依据。

环境 DNA 宏条形码研究

针对深海鱼类环境 DNA (eDNA) 宏条形码分析中传统方法提取 DNA 量少、PCR 扩增效果差的问题，提出改良的 eDNA 提取和 PCR 扩增方法：通过切碎滤膜并在微管中孵育以提高裂解效率，使总 eDNA 产量约为传统方法的 6 倍；采用 Platinum SuperFi II DNA 聚合酶有效抑制非特异性扩增，使二代测序中约 93% 的序列 reads 来自鱼类，显著提升了深海鱼类 eDNA 宏条形码分析的效率和准确性。

微生物组研究

小亚基（SSU）核糖体 RNA（rRNA）基因扩增子测序是微生物生态学中的一种基础方法。本文介绍了一种名为 ssUMI 的测序工作流程，实现了高通量近全长 16S rRNA 扩增子测序。该方法生成平均99.99% 准确率的共识序列，优于 Illumina 短读长测序，并在微生物群落标准样本中实现了无假阳性的从头序列特征生成。Platinum SuperFi II 绿色 PCR 预混液用于 UMI 标记和 PCR 扩增反应，在整个实验流程中发挥了关键作用。

HLA 分型

本文介绍一项利用长读长 RNA 测序结合独特分子标识符 (UMI) 的研究，实现快速高分辨率 HLA 分型及等位基因特异性转录本定量。研究使用 Oxford Nanopore 技术，通过 UMI 标记和生物信息学分析，在7-8 小时内完成检测，一致性达 99.7%，为器官移植和疾病诊断提供新工具。

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参考文献 (向上滑动查看更多)：

1. Foley, A., Lao, N., Clarke, C., & Barron, N. A complete workflow for single cell mtDNAseq in CHO cells, from cell culture to bioinformatic analysis. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 12, 1304951. (2024)

2. Licheri, M., Licheri, M. F., Mehinagic, K., et al. Multiplex PCR approach for rapid African swine fever virus genotyping. Viruses, 16 (9), 1460 (2024)

3. Trifone, C., Richard, C., Pagliuzza, A., et al. Contribution of intact viral genomes persisting in blood and tissues during ART to plasma viral rebound in SHIV-infected rhesus macaques. iScience, 28, 111998 (2025)

4. Kawatoa M., Yoshida T., Miya M., et al. Optimization of environmental DNA extraction and amplification methods for metabarcoding of deep-sea fish. MethodsX 8 (2021)

5. Lin, X., Waring, K., Ghezzi, H., et al. High accuracy meets high throughput for near full-length 16S ribosomal RNA amplicon sequencing on the Nanopore platform. PNAS Nexus, 3, 411 (2024)

6. Cornaby, C., Montgomery, M. C., Liu, C., & Weimer, E. T. Unique Molecular Identifier-Based High-Resolution HLA Typing and Transcript Quantitation Using Long-Read Sequencing. Frontiers in Genetics, 13, 901377 (2022)