2024-06-25 19:12:56 北京青莲百奥生物科技有限公司
生信分析员的日常
一台高配电脑
配置操作环境
安装分析软件
下载专业数据库
然后......
努力做只万能的程序猿,写得了代码,改得起BUG,忍得住黑白屏。
您能欣然接受并胜任这样的生活吗?
如果不,那就毫不犹豫的吃下这颗安利吧。
这可是生信分析界的惊天秘密,一般人我不告诉他!!!
青莲百奥BioLadder生信分析云平台见刊iMet(IF=23.7)
驾着七彩祥云而来
带着生信分析不求人的使命
与您携手开启轻松加愉快的生信分析之旅
下面就和小青莲一起看看这份发表在顶刊的“生信宝典”
助力您实现“分析自由”的灵魂
01
BioLadder概述
BioLadder是北京青莲百奥生物科技有限公司自主研发的为蛋白质组学研究设计的在线数据分析平台,包括3类实验数据分析模块和4类常规数据分析模块,为客户提供一站式数据可视化分析、生物学意义挖掘服务。平台提供多款一键化生信分析流程和超实用的分析工具。
噔噔噔
截至2024年6月20日,青莲百奥BioLadder云平台使用人次突破100w啦!!!
02
蛋白质组数据流程化分析工具上线
BioLadder中包含的分析模块可以分为两大类(图1):
实验数据分析:涉及蛋白质组学实验数据的分析,包括实验数据分析、表达矩阵数据分析等(图1:C1-C3);
常规数据分析:不依赖于蛋白质组学实验数据的分析,包括蛋白质序列分析以及一些通用的分类和功能分析等(图1:C4-C7)。
这些分析模块可以满足蛋白质组学领域研究人员的大部分数据分析需求。
图 1. BioLadder在蛋白质组数据分析框架中的模块类别
03
数据可视化模块满足蛋白质组学研究需求
为了满足蛋白质组学研究的需求,BioLadder开发了几种蛋白质组数据可视化模块:
表1:每个新开发模块应用范畴
青莲百奥相信这些蛋白质组数据可视化模块将满足蛋白质组学研究的需求,并为研究人员提供有价值的见解,帮助使用者分析数据更easy!
04
方便且人性化的设计满足使用者多样性需求
为了让组学研究的用户能够以最方便、最高效的方式使用我们的在线分析平台,BioLadder对各个环节进行了精心设计,包括输入文件格式(图2A)、参数设置(图2B)、配色方案(图2C),同时提供帮助文档、微信客服和实时工具提示,方便客户访问相关帮助信息(图2D)。
图2 BioLadder 中的四种方便且人性化的设计
降低使用门槛,优化数据上传方式
BioLadder为不同类型的数据提供了转换模块(例如,长格式和宽格式之间的转换),并设计了一些模块直接支持常见的蛋白质组学格式。此外,它还可以过滤掉某些最小定量值以下的数据,这有助于消除可能由噪声引起的结果。
设置针对蛋白质组学的专门默认参数
为了满足蛋白质组学数据分析的特定要求,BioLadder基于算法、数据预处理、数据展示过程中根据蛋白质组数据的特点为一些模块建立了合适的默认参数,以尽可能减少参数调整的需求,同时为了满足用户偏好,BioLadder也选择性的在部分个性化模块中加入了易于调整的参数,使用户能够自定义他们的展示结果。
强大的配色方案,提升图片颜值
对于分析图片有颜值追求的朋友来说,不当的颜色组合可能会显著降低可视化的有效性。BioLadder融合了来自R包或ggplot2(https://github.com/tidyverse/ggplot2)的默认配色方案、Nature、Science和Lancet等文献或期刊中常用的优秀配色方案(ggsci: https://github.com/nanxstats/ggsci),满足各种用户需求,并允许用户根据他们的偏好快速完成颜色自定义。
全面的帮助信息,便捷的实时协助
除以上人性化设计外,BioLadder还为使用者提供了部分额外的支撑服务。
用户指南模块为用户带来了包括“网站及功能概述”“常见问题解答”“各模块详细解析”“24H微信客服咨询解答”服务
工具提示模块使用户可以随时访问有关参数设置的帮助信息,以帮助准确配置相应的参数。
例:在热图模块中,提供了四种类型工具提示:
输入文件详细信息的工具提示,包括文件内容解释、最大文件限制和文件格式;
下拉选择框的工具提示,解释每个选项的含义;
下载格式的工具提示,提供下载说明和下载设置的图形解释;
在大多数模块的结果图中的左上角,提供了一个“文本教程”链接,以及解释图表的工具提示,使用户能够快速理解图表的重要性。
这些工具提示使用户能够轻松获取帮助信息,并无缝地继续配置和数据分析。
OK,现在我们来简单总结一下,与目前市面上的在线云平台相比,BioLadder到底有多全面,能让您实现实现“分析自由”灵魂的。
表2 BioLadder与不同云平台基于便利和个性化的设计比较
当然,除了以上展示的功能外
BioLadder云平台还有更多便捷实用的分析模块等待大家亲自探索
动动手指
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