NanoTemper Panta及Monolith助力转运体PHT1招募TASL的研究

2024-04-22 11:24:55, NanoTemper 诺坦普科技(北京)有限公司



01

研究背景


PHT1是一种组氨酸/寡肽转运蛋白,作为受体,通过募集接头蛋白TASL,在先天免疫应答中起重要作用。这种信号通路的异常激活被认为与系统性红斑狼疮(SLE)的发病机制有关。因此,了解PHT1如何在分子水平上招募TASL,对于开发针对SLE和其他自身免疫性疾病的治疗方法具有重要的临床意义。


2023年德国汉堡欧洲分子生物学实验室发表在Nature Communication上“Molecular basis of TASL recruitment by the peptide/histidine transporter 1, PHT1”,解析了PHT1冷冻电镜结构,提出了PHT1-TASL复合物的模型,为PHT1/TASL介导的I型干扰素产生的分子基础提供了重要的见解。

https://doi.org/10.1038/s41467-023-41420-5


02

NanoTemper技术应用


TSA筛选蛋白和多肽的互作

之前的细胞测定方法表明,PHT1可以运输多肽和肽聚糖等分子。为了更好的了解PHT1的转运特征,作者在体外对PHT1的底物特异性/偏好性进行检测。


PHT1为膜蛋白,溶液中含有0.02%DDM 去垢剂。膜蛋白提取量不高,并且重组表达的PHT1的糖基化严重。此外,研究中涉及到65种底物。因此,需要一种高通量的检测方法,兼容去垢剂,不受糖基化影响,并且对蛋白起始量要求低。通过nanoDSF技术进行TSA(Thermal shift assay)实验,可通过查看加入配体后靶蛋白Tm变化,快速鉴定筛选结合配体。nanoDSF技术基于蛋白内源荧光对其热变性过程中进行检测,不受糖基化修饰影响,无需染料,兼容去垢剂。蛋白样品的起始量要求低,可低至5μg/ml(以IgG为例),并且一次可完成48个样品的检测。


作者向PHT1中加入不同的底物,使用nanoDSF进行ΔTm检测。结果显示PHT1具有相当广泛的底物特异性,并且该转运体能够结合二肽和三肽(图1)。


图1:nanoDSF筛选在5mM配体存在时PHT1的ΔTm变化


PHT1和TASL亲和力检测

作者通过pull down检测到PHT1和TASL之间存在相互作用。通过比较不同种类的TASL序列,发现前10个残基保守。作者设计了一个包含TASL(TASL1-13)个残基的肽段,并利用nanoDSF和MST技术对PHT1和TASL1-13亲和力进行了研究。


结合TASL1-13肽对PHT1热变性过程具有的稳定作用,并且ΔTm与结合的比例相关。用TASL1-13滴定PHT1蛋白,并使用nanoDSF检测ΔTm变化,测定得到表观KD(362nM)。


图2:nanoDSF检测TASL1-13滴定PHT1的热稳定性


此外,使用MST技术检测TASL1-13肽和PHT1获得非常相似的KD结果。


图3:MST检测TASL与PHT1亲和力


03

技术优势


在这篇工作中,通过nanoDSF技术探究了PHT1和65种底物的相互作用,快速确定了其底物结合特异性和偏好性。nanoDSF技术兼容去垢剂,检测蛋白浓度宽泛,通量高,在配体筛选上具有显著优势。


此外,通过MST进行PHT1和多肽片段亲和力检测,无需固定分子,避免固定过程对膜蛋白的影响,获得准确的亲和力。


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