全流程自动化!睿科蛋白组学样本前处理解决方案

2024-02-20 16:50:14, 睿科集团 睿科集团股份有限公司


随着生物质谱技术迅速发展,质谱技术已经逐渐成为了蛋白质组学分析的主流技术。质谱仪器具有高灵敏度、高分辨率等特点,样本前处理的质量和可重复性显著影响质谱仪的分离和鉴定能力。

蛋白质组学样本前处理流程复杂、处理时间长(传统蛋白质组前处理需过夜),人工操作易失误,造成了样品前处理不稳定、重现性差等问题,急需一种操作简便、高效、安全性能强、抗干扰能力强的自动化解决方案,保证结果的准确性和可靠性。

睿科蛋白组学样本前处理

解决方案

睿科推出全新蛋白组学样本前处理工作站,配套睿科蛋白组学样本前处理试剂盒,为蛋白组学样本前处理提供全自动解决方案,高效地实现质谱蛋白样本前处理自动化和标准化操作。

蛋白组学样本前处理解决方案适用于血浆、血清、尿液、细胞、组织等类型样本从蛋白到多肽混合物的质谱检测前处理工作,试剂盒利用新型固相烷基化试剂SPA材料与蛋白的特异性共价反应,实现蛋白质的高效捕获,通过清洗磁珠表面,快速去除干扰物质,并进行原位固相酶解,获得蛋白酶解产物,仪器整合制冷模块、磁吸附模块、加热振荡模块、抓扳手,进而实现蛋白质组提取、还原、烷基化、酶解等流程自动化操作,提高蛋白质样品的处理效率和回收率。

蛋白组学样本前处理工作站

一款具备高通量、高回收率、安全性能强、抗干扰能力强,适用范围广等优势,适用大队列样本的高通量处理设备,可实现质谱蛋白样本前处理的全自动化和标准化操作。

蛋白组学样本前处理试剂盒

(新型固相烷基化试剂)

产品适用于处理各种来源的蛋白质组样品,如细胞、血浆、细菌、肿瘤组织等,采用新型固相烷基化试剂,蛋白质可与其它小分子(如糖、盐、表面活性剂、脂类等)实现快速分离,提高蛋白质的纯度,显著降低样本复杂程度。同时,试剂表面亲水性较好,可显著提高蛋白质或酶解产物的回收率。

方案优势

96通道移液模块

►高通量

96通道移液头,一次可处理最多96个样本,高效完成实验流程中吸废等步骤;

兼具8通道移液功能,可以实现试剂的精准分装;

全流程4-5小时可完成96个蛋白样本的前处理(具体时间根据具体实验流程);

►自动化程度高

整合抓板手,用于对标准SBS板子的转移;

整合蛋白前处理所需的试剂制冷模块、磁吸附模块、加热振荡模块等功能模块;

均一化操作,减少实验过程中的误差,提高准确性和稳定性;

仪器盘面设计

►灵活性强

盘面包含18个SBS标准盘位,除功能模块外,有15个盘位放置试剂和耗材;

开放式平台,配有多样化适配器,可适配多种不同品牌试剂耗材;

软件界面人性化设计,拖拽式布局,操作简单,每个步骤可独立进行参数设置,实验流程可进行存储,按键式启动运行;

仪器软件设计

►安全性

可配置避光外罩,搭配紫外消毒灯;

可根据实验需求选配正、负压HEPA过滤系统,有效避免交叉污染;

测试数据

■ Part 1:批内测试数据

材料:293T 细胞

实验方法:手工操作3 组,仪器操作3 组

Q Exactive质谱结果如下:

表1:手工操作和仪器操作后蛋白数及零漏切率对比

图1 Venn diagram(蓝色:手工;绿色:仪器)

试验总结

·手工操作和仪器操作蛋白样本预处理后可检测到的蛋白数及零漏切率基本一致,达到预期要求;

·手工操作与仪器操作蛋白种类皮尔斯相关系数大于0.97,与预期一致;

■ Part 2:样本批间测试数据

图2 96孔板检测示意图

如图2所示共处理96个样品,分三组进行实验,随机选取36个样品进行Q Exactive质谱检测,结果如下:

图3 36个样本检测蛋白数(个)

图4 36个样本零漏切率(%)

图5 随机样品日间比较

实验总结

·36个随机样本检测蛋白数3074±89个,零漏切率78.32±2.66%,样本预处理的结果正常且稳定;

·36个样品的皮尔斯相关系数及日间随机样品皮尔斯相关系数均介于0.955-0.989之间,达到指标要求,具有较好的均一性。

应用领域

临床诊断、用药指导、病理机制研究、疾病标志物的发现、药物机理研究

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