2023-12-23 10:05:17, 沃特世 沃特世科技(上海)有限公司
为了让广大用户更好地使用沃特世高分辨质谱、提升工作效率,沃特世一直致力于高分辨质谱配套的“软实力”开发,且其中很多可以免费提供给客户。今年,小编陆续对这些免费数据库、免费小软件进行了介绍,吸引了众多客户的关注。这篇文章将这些免费资源进行统一盘点,方便您一网打尽!不要错过啦!
天然产物图集涵盖了同行评审的主要科学文献中发表的所有微生物衍生的天然产物,包括来自细菌、真菌、蓝藻、地衣和蘑菇的化合物(25,500+微生物天然产物的结构信息)。通过Progenesis QI和UNIFI均可在数据库检索过程中生成理论碎片。
本数据库覆盖800多个广泛但多样的植物天然产物、衍生物和药物,包含来自主要生物合成群体的化合物、许多药理活性的生物碱、几类萜类化合物和酚类,以及一些次要的次生代谢物。此数据库适用于waters_connect/UNIFI平台。
密西西比大学天然产物数据库包含用于膳食补充剂和传统药物的植物中提取的天然产物。包括来自四个属(Hoodia、Eleutherococcus、Matricaria和Huperzia)的约400个条目。所有条目都包含结构信息、原产植物以及相关的化学类别,如生物碱、黄酮类、类固醇和三萜类等。此数据库适用于waters_connect/UNIFI平台。
天然产物微生物库包含与西蒙菲莎大学Roger Linington教授实验室合作策划的微生物源天然产物化合物,包括细菌、真菌和蓝藻化合物。该库的第一个版本包含439个化合物。库中每个化合物条目都包含结构信息、化学类别和来源微生物的信息。此数据库适用于waters_connect/UNIFI平台。
天然产物CCS库包含399个正离子模式下的碰撞截面(CCS)测量和299个负离子模式下的CCS测量。这些条目属于各种化合物类别,包括生物碱、香豆素、黄酮、异黄酮、大环内酯、肽类、合成衍生物和萜类化合物。此数据库为实际测定的数据库。
此数据库中的信息均为LC/HRMS实测值。包含了经FDA批准通过的1,450多种药物的保留时间、结构式、母离子信息、二级碎片信息和碰撞横截面积(CCS值)等信息, waters_connect/UNIFI平台上均可使用。
沃特世与Merck、以及西班牙萨拉戈萨大学(Zaragoza University)的Cristina Nerin教授课题组合作,共同整理出不同类别的聚合物,其可能涉及到的萃取物和可浸出物,使用实际标准品进行测试。数据库包含600多个E&L及食品接触性材料相关的化合物,包含保留时间、化合物结构信息、类别、m/z、二级碎片、碰撞横截面积(CCS)值等信息。可用于沃特世高分辨质谱waters_connect/UNIFI E&L筛查平台。
针对一些非法操作,如在保健品或中药中非法添加一些违禁药品或具有相应功效的化学药品,沃特世也有相应的非法添加数据库和相应的筛查流程供高分辨客户使用。沃特世非法添加数据库中包含了262个化合物,为实测库,包含二级碎片,并有推荐的碰撞能量。其中122个化合物有保留时间数据,并有推荐的色谱条件。同时数据库根据功效分类,方便检索,减少数据处理的假阳性。
代谢组学用户看过来~
【Progenesis QI SDF 数据库】
包含人体内发现的小分子代谢物的详细信息。它旨在用于代谢组学,临床化学和生物标志物发现应用。该数据库包含或链接了三种数据:1)化学数据,2)临床数据和3)分子生物学/生物化学数据。该数据库涵盖了220,945个代谢物条目,包括水溶性和脂溶性代谢物。
由美国国立卫生研究院(NIH) 创立的脂质数据库,是目前最权威的脂质数据库,收录了超过4万种脂质的结构、谱图和分类信息。
由阿尔伯塔大学计算科学与生物科学系的David Wishart提供支持。数据库集成到人类代谢组数据库(HMDB)中,允许用户以不同的视图、代谢物、浓度和疾病浏览数据。用户可以看到化合物的基本信息、化合物的浓度以及与这些浓度相关的条件。目前包括了25,411种化合物。
除了以上免费数据库外,沃特世也有几个体系非常完整的付费数据库,配合沃特世提供的硬件、软件流程、相关耗材、及专业化的培训支持,可实现更高效的化合物筛查确认。
全新中药数据库
农药残留数据库
毒物数据库
RFMS多糖库、2AA糖数据库、2AB糖数据库
细胞培养基库
聚合物得到的质谱图往往非常复杂:不同种类、不同加合离子、不同电荷状态、分子量分布、Mn、Mw、Mz…… 此时,对质谱图的解析,非常依赖于分析工作者的经验。沃特世作为高分辨质谱供应商,致力于为客户提供完备的整体解决方案,针对此类难题,专门推出了一款简单的小软件(microAPP) — Pattern Targeter,来帮助客户自动化快速解析聚合物质谱图。
为了让成像客户查看数据更简便,成像数据更易直接在发表文章中使用,近期,沃特世特别推出了两款简单易用的成像MicroAPP。
可进行归类,查看切片空间的差异情况。自动选择样品区域,排除实现快速对化合物背景,加速处理速度;根据谱图相似程度在成像图上进行归类,直观看到切片空间的差异情况;可选择目标像素质谱图,并以此为基准,根据谱图相关性生成空间分布图。
快速批量查看成像图、匹配数据库并导出。像放电影一样快速批量查看质谱数据对应的成像图,对比其与总谱图差异,去除同位素干扰,并进行自动的数据库匹配,使可视化效果更佳。通过High Definition imaging(HDI)软件采集的MS成像数据可直接导入其中。
此十一大数据库均为沃特世高分辨质谱、 waters_connect/UNIFI或Progenesis QI平台上可使用的数据库,软件也是针对沃特世高分辨质谱平台。如有需要的小伙伴,可扫描下方二维码,选择您想要的数据库或软件,小编会将下载链接发送至您的邮箱。
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希望这份新年小礼物能为您的分析工作带来帮助,也祝您在新的一年内工作顺利、成果多多!
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