2023-12-02 15:28:41, 赛默飞基因科学 赛默飞世尔科技生命科学产品
2023年12月1日是第36个“世界艾滋病日”。今年中国“世界艾滋病日”主题是“凝聚社会力量,合力共抗艾滋”。让我们来具体了解一下艾滋病的有关知识。
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艾滋病的医学全称是"获得性免疫缺陷综合征"(英文名缩写AIDS)。它是由艾滋病病毒即人类免疫缺陷病毒(HIV)引起的一种病死率极高的恶性传染病。艾滋病病毒进入人体后,主要杀伤人体中的CD4+T淋巴细胞,使人的抵抗力逐渐下降,出现很难治愈的多种并发症,最后导致死亡。
“
联合国发布的 “到2030年终结艾滋病流行的政治宣言” 承诺
将预防作为优先事项,确保到2025年,有效的艾滋病综合预防方案涵盖95%的有HIV感染风险者;
承诺2030年前实现 “三个95%” 目标,即95%的HIV感染者能得到确诊,95%的确诊者能获得ART,以及95%的接受治疗者体内病毒得到抑制。
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全球流行的HIV根据血清学反应和病毒核酸序列测定,可分为HIV-1型和HIV-2型。HIV-1型的毒力和传播力都高于HIV-2型。HIV-1型可进一步分为M、N、O、P组。M组毒株是导致全球艾滋病流行的主要病毒株,至少包括11种亚型(A-K)以及各种流行重组型(CRF)。不同于美国HIV流行毒株主要是B亚型,中国HIV流行毒株主要是CRF01_AE和CRF07_BC重组亚型。
HIV耐药是指HIV病毒发生基因突变,而对某种药物的敏感性降低或不敏感的现象,是抗病毒治疗药物作用的病毒基因发生突变的结果。
斯坦福大学HIV耐药解释系统(HIVDB)将耐药程度分为五个水平。当耐药毒株在个体内病毒准种中的比例低于10~20%时,利用Sanger测序法通常检测不到其存在。如果未检出耐药突变时,只可报告本次实验结果为“未发现耐药”,不可报告为“敏感”,且不排除比例较低频的耐药毒株存在。但是,二代测序则可检测到“敏感”低频耐药突变。
HIV传播网络分析在艾滋病精准防控工作中发挥重要作用,主要基于社会网络和分子网络方法推断HIV传播网络。
社会网络:由社会成员及其之间的关系链组成。网络信息主要通过现场问卷调查或网络社交平台问卷调查收集。
分子网络:根据HIV序列的遗传学相似性构建。当HIV序列的基因距离小于设定阈值时,即可将宿主连接成网。
分子网络与社会网络分析可以互相补充。根据分子网络分析的结果指导社会网络分析及时发现新近的传播事件,并阻止预期的传播事件发生,将是精准防控艾滋病的全新思路。
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赛默飞秉承“在中国,为中国”的服务理念,基于中国流行毒株设计NGS检测试剂盒,整理收集中国流行毒株数据建立分析数据库,搭建易操作的HIV分型、耐药检测和分子网络数据分析流程,为中国艾滋病患者检测和传播风险判断保驾护航。
设计更适配中国
中国流行参考序列:HIV-1的pol基因和基因组全长检测试剂盒的设计都是基于645条中国流行HIV-1毒株参考序列。
丰富亚型:可检测HIV-1亚型包括CRF01_AE,CRF07_BC,CRF08_BC,B,B'',URF等。
完整覆盖:可获得完美覆盖HIV-1的pol基因和基因组全长的测序数据。
操作更简单易行
操作简单:支持Ion Torrent™自动化工作流程,手动操作时间都小于45分钟,节省人力资源,减少手动操作误差。
入门轻松:Ion Buffalo数据分析服务器支持图形化操作界面,没有生物信息背景客户也可玩转HIV-1检测分析。
报告周期短:从建库测序到数据分析,整体报告周期可低至16小时。
分析更全面多样
测序质控:满足HIV专家共识-Winnipeg共识要求。
精准分型:基于2种HIV-1核酸序列数据库分析,更精准全面地提高分型结果的准确性。
耐药分析:对不同突变频率的位点提供不同检测灵敏度的药物信息。高亮提示低频突变,用于HIV-1耐药早期发现。
检测报告:基于中国艾滋病检测技术指南2020版本推荐的HIV-1 耐药基因型检测报告。
进化树分析:支持3种基因距离算法构建进化树进行HIV-1溯源。
分子网络图:将基因序列和表型等数据结合一起构建分子网络图,研究HIV传播情况。
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