呼吸道传染病核酸检测及耐药性检测方案

2023-12-14 15:23:05, 赛默飞生命科学 赛默飞世尔科技生命科学产品


今年冬天,新冠复阳、流感、支原体肺炎等呼吸道疾病接力,不少孩子纷纷中招肺炎支原体感染,出现发烧咳嗽的症状,甚至一家人都被感染。


为什么今年支原体肺炎特别厉害?

一方面,新冠感染后,新冠病毒会对人体免疫系统造成一定程度的损伤,导致免疫力下降。另一方面,支原体肺炎通常3到7年会发生一次地区性流行,今年正是支原体的流行大年


什么是肺炎支原体?

肺炎支原体 (MP) 是一种大小介于细胞和病毒之间的原核致病微生物,常规无菌过滤不能除掉支原体。支原体没有细胞壁,通过破坏细胞壁来杀死细菌的抗生素 (比如青霉素、头孢) 对支原体无效。


图1. 支原体的结构。图片来源: Designua / Shutterstock


核酸检测:多种病原体感染早期检测

根据《儿童肺炎支原体肺炎诊疗指南 (2023年版)》,符合临床和影像学表现,结合以下任何一项或两项,即可诊断为肺炎支原体肺炎:

  1. 抗体检测:单份血清 MP 抗体滴度≥1:160 (PA 法);病程中双份血清 MP 抗体滴度上升4倍及以上。

  2. 核酸检测:MP-DNA 或 RNA 阳性。


核酸检测,大家都很熟悉,相比抗体检测具有灵敏度和特异性更高的特点适用于多种病原体感染的早期诊断。MP 核酸检测方法,包括荧光定量 PCR、环介导等温扩增技术 (LAMP)、实时荧光等温扩增检测技术 (SAT)。


多位专家认为,今年新冠疫情后人群免疫力下降,肺炎支原体、细菌和病毒等病原体混合感染变得多发。在感染早期,采用鼻咽拭子核酸检测,能够一次性查出多种常见病原体感染情况,确定是否存在混合感染,有利于及时诊断和用药。


肺炎支原体耐药性形势严峻

治疗肺炎支原体肺炎常用抗菌药物包括大环内酯类、氟喹诺酮类、四环素类,其中大环内酯类药物是首选治疗药物,比如阿奇霉素、克拉霉素,其他两类都有副作用。但在中国,有报道住院儿童MP对大环内酯类抗生素耐药率>80%,有的耐药率高达90%-100%。


图2:按国家分类的耐大环内酯类肺炎支原体感染比例图,来自 JAMA Network 官网


肺炎支原体耐药性会延长症状持续时间和治疗时间,增加经济支出,甚至增加并发症和后遗症的发生风险。


肺炎支原体耐药检测方法

《儿童肺炎支原体肺炎诊疗指南 (2023年版)》中指出,MP对大环内酯类抗菌药物耐药机制主要为23S rRNA 基因2063、2064或2617位点等碱基突变,其中2063或2064位点突变可导致高水平耐药。临床上可以通过测定上述位点突变判断耐药与否。


荧光定量PCR是检测单碱基突变的常用方法,提取鼻咽拭子、痰液等样品核酸,对靶位点进行扩增,具有特异性强、准确、快速等优点。此外,也可以对靶位点PCR扩增后进行DNA测序。


肺炎支原体核酸检测及耐药性检测方案

采用荧光定量PCR技术,可以一步检测,同时解决两大问题,明确病原体的同时确定是否耐药,即时给出用药指导。


图3. 肺炎支原体核酸检测及耐药性检测方案。


核酸提取是核酸检测的关键步骤之一,PCR/qPCR 的灵敏度与生物样品中核酸的回收率呈正相关,同时也是核酸检测的限速步骤之一。


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图4. KingFisher 仪器的工作原理。


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