稀土分离,Nature!| 前沿用户报道

2023-09-27 14:14:23, Chan HORIBA科学仪器事业部




01 研究背景


稀土元素在现代技术中有着不可替代的作用,如永磁体、发光二极管和荧光粉等都离不开稀土元素。高效分离稀土元素是分离科学的重大挑战之一,因稀土元素主要的+III离子具有相似的物理化学性质。LaIII 和 LuIII 之间的离子半径仅相差 0.19 Å,这也导致这些金属在含稀土矿物中共存。传统的湿法冶金液液萃取稀土生产方法使用有机溶剂,如煤油和有毒的磷酸盐萃取剂,需要数十个甚至数百个过程才能获得高纯度的单组分稀土氧化物。稀土分离的低效和对环境的巨大影响促使人们努力研究在相邻稀土之间具有更大分离系数的替代配体和更绿色的工艺设计,以实现用更少的工艺过程来分离稀土。天然的与稀土元素结合的兰姆素二聚体(LanM)是传统溶剂萃取法分离的一种可持续替代方法。


▲第一作者:Joseph A. Mattocks
通讯作者:Dan M. Park,Amie K. Boal,Joseph A. Cotruvo Jr
通讯单位: 美国劳伦斯利弗莫尔国家实验室,美国帕克大学,美国宾夕法尼亚州立大学
DOI:https://doi.org/10.1038/s41586-023-05945-5



02 研究问题


本研究描述了一个新的 LanM,来自 Hansschlegelia quercus (Hans-LanM) ,具有对稀土离子半径敏感的低聚态,La(III) 诱导的二聚体比 Dy(III) 诱导的二聚体紧密 100 倍以上。X射线晶体结构说明了 La(III)和Dy(III) 之间在半径上的皮米级差异是如何通过重新排列第二球状氢键网络的羧酸盐位移传播到 Hans-LanM 的四元结构中的。与甲基紫罗兰的原型相比,本研究揭示了不同的金属配位策略,合理地解释了 Hans-LanM 在稀土元素中更大的选择性。最后,Hans-LanM 二聚体界面上关键残基的结构引导突变调节了溶液中的二聚作用,并使单级柱基分离钕(III)/镝(III)混合物达到>98% 的单元素纯度。这项工作展示了选择性稀土元素识别基序的自然多样性,并揭示了稀土敏感的二聚作用作为调节基于生物分子的分离过程的性能的生物学原理。


▲图1| Hans-LanM 与 Mex-LanM 在序列和 RE 与 RE 选择性上的差异

要点:

01

本研究使用两个标准和 <200 个残基的序列长度搜索序列数据库,鉴定出 696 个推测的 LanM。使用序列相似性网络对这些序列进行可视化,以鉴定与Mex-LanM 分开聚集的 LanM 序列。值得注意的是,在 65% 的同一性阈值下,形成了一小群远离642 个序列的主簇(图1a)。这个独有的簇( Hans 簇)包括来自几个属的细菌,包括汉氏杆菌和黄杆菌,所有这些细菌都是兼性甲基营养细菌

02

Hans-LanM 与 Mex-LanM 的序列同源性较低(33%),并且 EF-Hand 基序存在差异,特别是在第一、第二和第九位(图1b),这些位置是 Mex-LanM 和其他 EF-Hand 蛋白的重要位置。因此,Hans-LanM 提供了一个机会来确定在 LanM 中选择性识别稀土元素所必需的特征。

03

Hans-LanM 在大肠杆菌中表达为 110 个氨基酸的蛋白质。LaIII 和 NdIII 被选为具有代表性的 LRE,DyIII 被选为具有代表性的HRE进行络合研究。通过电感耦合等离子体质谱,该蛋白质与大约三个等量的LaIII 和 NdIII 结合,而 DyIII 略少),Mex-LanM 也是如此。同样与 Mex-LanM 一样,Hans-LanM 在没有金属的情况下表现出很少的螺旋含量,由  222 nm  处的圆二向色性信号判断(图1c)。出乎意料的是,只有两个 LaIII 或 DyIII 的等价物足以引起Hans-LanM 的完全构象变化,这表明第三个结合等价物是弱的,不会增加螺旋度。

04

本研究用圆二色谱测定的表观离解常数(Kd,app)反映了竞争稀土回收条件下 Mex-LanM 的 Re vs. RE,以及 RE vs. 非 RE 的选择性。因此,类似的Kd,app 的测定与由竞争性络合剂控制的游离金属浓度适用于 Hans-LanM,其结果(图1d)与 Mex-LanM 的结果不同。LaIII 和 NdIII 与 HANS-LAM 的结合使其在 222 nm 处的摩尔椭圆度增加了 2.3 倍,这一完全构象变化在化学计量滴定中很明显。构象变化是协同的, Kd,app 值相似,分别为 68 和 91 pm。


▲图2| 一个对 LRE 和 HRE 或非稀土配位敏感的二聚平衡

要点:
01

为了进一步支持在生理上相关的 LRE 存在下的优先二聚反应,本研究用多角度光散射分析了 Hans-LanM 的稀土配合物(MALS;图2a)。LaIII、NdIII和GdIII络合物的 MW 为 22-25 kDa,表明其是二聚体,但 MW 从 Tb III 开始下降,继续到 DyIII 和 HoIII,约为 15 kDa ,这与 SEC 的数据一致。与 CaII 结合的Hans-LanM 也表明 MW 为 14.7 kDa。

02

Hans-LanM 与 LaIII 络合物的 1.8 Å 分辨率X射线晶体结构证实了 LRE 诱导的二聚化。两个 LanM 单体头尾相互作用(图2b),通过疏水和极性接触掩埋了约600 Å的表面积(图2c,d)。这些相互作用主要发生在核心螺旋  α1 (EF1和EF2之间)和α2(EF3和EF4之间)贡献的侧链之间。二聚体界面上的残基只与四个金属结合位点中的一个 EF3 直接接触;每个单体中的三个 EF3 残基与另一个单体的 Arg100 形成氢键网络(图2c),这表明该位点的占位和配位几何可能控制低聚物的状态。


▲图3| Hans-LanM 使用扩展的氢键网络来控制镧系元素选择性

要点:

01

一个单齿 Asn(N1位)、四个双齿 Asp 或 Glu 残基(D3、D5、E9和E12)和一个主链羰基(T7或S7)形成了EF1-3(图3a)中的第一个配位球。没有观察到外源的溶剂配体;EuIII-Hans-LanM 的发光研究确定了配位的溶剂分子的数量(q),得到了 q = 0.11,这与 X 射线结构中没有溶剂配体是一致的。

02

Mex-LanM 和 Hans-LanM 的金属结合部位有很大不同。在 Mex-LanM,所有四个 EF 手形都被九坐标(EF1-3) 或十坐标 (EF4)NdIII 离子占据,每个离子都包括两个溶剂配体,在 Hans-LanM 中则不存在(图3b)。

 
▲图4|利用Hans-LanM在单步流程中分离Nd/Dy

要点:

01

Hans-LanM 的 LRE 和 HRE 络合物在稳定性和结构上的差异表明,Hans-LanM (野生型和/或R100K)在稀土/稀土分离方面将优于 Mex-LanM。本研究专注于分离用于永磁体的稀土对 NdIII 和 DyIII。首先分析了野生型 Hans-LanM 和 Hans-LanM(R100K) 稀土络合物对柠檬酸盐的稳定性,柠檬酸盐以前与 Mex-LanM 一起用作解吸剂。RE-Hans-LanM 络合物对柠檬酸盐的稳定性一般不如 Mex-LanM,这是在亲和力较低的基础上是可预期的(图1e),但 NdIII-Hans-LanM 和 DyIII-Hans-LanM 络合物之间的稳定性差异表示为每种金属([柠檬酸盐]1/2)解吸所需的柠檬酸盐浓度的比率,该数据由 Hans-LanM 的两个 Trp 残基的荧光结果报告,最终发现其比 Mex-LanM 络合物的稳定性大两倍(图4a)。

02

Mex-LanM 和 Hans-LanM 的金属结合部位有很大不同。在 Mex-LanM,所有四个 EF 手形都被九坐标(EF1-3)或十坐标 (EF4)NdIII 离子占据,每个离子都包括两个溶剂配体,在 Hans-LanM 中则不存在(图3b)。

03

Hans-LanM 和 R100K 在 La-Gd 范围内表现出类似的分离能力--尽管 R100K 在 Gd-Dy 范围内表现出更强的分离能力--这由混合稀土溶液在平衡时的柱上分配比(D)确定(图4c)。这些 Nd/Dy 分离因子几乎是Mex-LanM的两倍(Hans-LanM)和三倍(Hans-LanM(R100K))。固定化的 Hans-LanM 用5% 的镝和 95% 的钕的模型电子废物混合物加载到最大容量的 90%,并在图 4b 的指导下,用逐步的丙二酸梯度洗脱,然后用 pH 1.5 HCl 完全解吸。在单级提纯过程中,Dy 的纯度从5%提高到83%,而 Nd 的纯度达到99.8%(收率均>98%)。


03 结语


Hans-LanM 对金属敏感的二聚化机制的生化和结构表征为LRE和HRE在生物学上的选择性提供了一种新的变构机制,扩展了最近从合成的稀土络合物和工程的过渡金属结合蛋白中出现的依赖二聚体的金属识别的概念,并表明这些原理是自然界固有的。


本研究还表明二聚强度及金属的选择性可以合理地调控。Hans-LanM 在更接近本研究生化分析中的浓度(10-20 µM)而不是柱上的浓度(约3 mm)的条件下进行了低稀土选择性二聚反应。因此,通过将二聚敏感性转移到较高浓度区域,例如通过调节二聚界面上的疏水相互作用,将有助于在分离过程中利用二聚。


此外,本研究表明,低至33%同一性的LanM很容易预测,但在金属选择性方面有有用的差异;进一步挖掘这种多样性可能会揭示出调整稀土分离的额外机制。最后,不含溶剂的 Hans-LanM 配位球在稀土/锕系元素的分离、基于发光的传感和稳定易水解离子方面应该优于 Mex-LanM。对生物 f 元素识别的配位和超分子原理的持续表征将激励设计具有比 RE 更高选择性的配体,并将其应用于新的 RE 分离过程。





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