【精彩回顾】空间多组学研究培训班

2023-05-20 15:49:14, Alma 丹纳赫生命科学



多层次、多角度的多组学整合研究思路为精准医学研究提供了从基因型到表型的完整互联的系统生物学信息。丹纳赫生命科学提供的多元化创新技术覆盖基因组、转录组到蛋白质组、代谢/脂质组的全视角,并为组学研究涉及的样本获取、前处理、数据采集到分析的各个环节提供自动化、高通量、可靠的产品和方案。丹纳赫生命科学整合旗下各知名品牌的优势技术,为用户提供空间组学研究的多维度解决方案。


2023年5月9日,丹纳赫生命科学携手旗下LEICA、SCIEX和IDT举办空间多组学研究培训班。培训班围绕显微切割的精准组织捕获、IDT二代测序(NGS)技术介绍、激光显微切割质谱联用技术助力组织微区研究、多色荧光成像技术在多组学中的应用等主题展开,进行了理论与实践于一体的讲解和操作演示。本次培训班吸引了近50位来自于中科院、著名高校和知名医院老师的热情参与。


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徕卡显微系统提供显微成像产品以及配套分析软件,从THUNDER多色荧光成像技术到Cell DIVE超多色循环染色成像分析技术,从Aivia人工智能软件精准识别细胞到LMD激光显微切割的精确分割,为生命科学领域的客户提供完整的空间组织多标和多组学技术方案,助力精准医学研究。培训开始,徕卡显微系统的高级应用专家高天龙博士,为大家介绍了显微切割的精准组织捕获。对于结构复杂和异质性高的生物组织或器官中的生物分子分析,样品的精确捕获至关重要,传统的组织匀浆、生物分子提取、纯化和富集等前处理过程可能丢失了分子水平在组织中的空间分布信息。激光显微切割技术(Laser Microdissection, LMD) 可以将样品组织或细胞样品进行精确切割,从而分离获得特定位点多细胞/单细胞水平且纯化、均一的样品。






IDT埃德特生物科技公司致力于面向生命科学界开发、生产并销售核酸产品,为学术与商业研究、农业、医疗诊断和药物开发等领域提供支持。来自于IDT的应用科学家林萌萌女士,分享了关于“IDT的二代测序(NGS)技术”。


IDT可提供针对靶向捕获完整的工作流,IDT oligo合成耦合效率高达99.6%,远超行业标准98.5%,可得到纯度更高的产物。相较于传统的芯片合成结合PCR扩增的探针合成方法,IDT独特的单条合成单条质检的探针合成工艺在减少批次间差异,提高探针性能稳定性方面具有明显优势。 






SCIEX致力提供精准检测和化合物定量的解决方案,在质谱技术领域拥有50年创新经验,一直致力开发突破性技术和解决方案,从而影响和推进可以改善人们生活的科学研究和成果。来自于SCIEX中国的应用技术工程师肖梦晴分享了“激光显微切割质谱联用技术助力组织微区研究”。


将徕卡激光切割显微镜获取微量样本技术与SCIEX液质联用系统高灵敏度检测相结合,可以实现组织微区广靶脂质组学分析检测。SCIEX液质联用系统优异的灵敏度保证痕量化合物的良好检出,同时高扫描速度使得一针分析能覆盖尽量多的检测通道,保证珍贵的微量样品靶向组学分析成为可能。






肿瘤微环境是肿瘤细胞赖以生存和发展的复杂环境,而这微环境内的免疫细胞及其调节方式对肿瘤的发生和发展起着重要的作用。来自于徕卡显微系统的产品经理童昕给大家分享了“多色荧光成像技术在多组学中的应用”。


传统的免疫荧光技术一般只能标记三种蛋白,且要求一抗抗体种属来源不能相同,TSA技术利用循环染色加单次成像的方式实现大于3种的荧光标记,但是仍然受限于单次成像的光谱重叠和串色现象,很难突破大于10色的标记与成像。此外Cell DIVE超多重免疫荧光成像技术利用经典的免疫荧光技术,实现大于60个生物标记物。无需引入其他引物,与传统免疫荧光实验基本一致;开放、开源性实验方案,可根据实验目的设计实验方案;通过采集染色前的组织自发荧光,展现生物标记物真实的信号。


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徕卡还致力于提供精准的空间组织多标和空间组学研究方案,助力生物标志物空间原位检测。来自于徕卡生物系统的王永彬博士,给大家带来“多色荧光染色技术在生命科学研究中的应用”。


通过多重免疫荧光(mIF)方法标记不同的蛋白标记物,实现对多种细胞类型的标记,可以帮助研究者更好的了解不同癌种的肿瘤微环境组成和变化,寻找与癌种预后相关的组织或细胞标记物,从而更好的预测患者的用药效果和评估预后。






理论培训结束后,参加培训的老师们参观了丹纳赫中国生命科学研究院上海应用研发中心。丹纳赫生命科学技术应用团队的科学家们展示了LEICA激光显微切割、SCIEX高分辨质谱和LEICA多色免疫荧光成像及软件的实际操作使用。


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通过本次的理论结合仪器实践操作演示的线下综合性培训课程,每一位到场的老师都收获满满。丹纳赫生命科学提供的多元化创新技术覆盖基因组、转录组到蛋白质组、代谢/脂质组的全视角,并为组学研究涉及的样本获取、前处理、数据采集到分析的各个环节提供自动化、高通量、可靠的产品和方案。多层次、多角度的多组学整合研究思路为精准医学研究提供了从基因型到表型的完整互联的系统生物学信息。


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