客户案例 | Science风湿免疫领域原创性突破-代谢物3-HPA修饰ITGA2B激活生成新抗原诱导HLA限制性自身免疫疾病

2023-03-28 13:16:42, 麦特绘谱 麦特绘谱生物科技(上海)有限公司



强直性脊柱炎(Ankylosing spondylitis,AS)是由人体内出现的新生自身抗原破坏免疫耐受,引发抗原特异性免疫反应,进而造成多器官损伤的疾病。目前该领域对自身抗原的系统筛查尚处空白。

2023年3月17日,空军军医大学朱平教授团队(第一作者翟月博士)、郑州大学第一附属医院杨静华教授、上海大学医学院陈亮教授等在国际顶刊Science(IF=63.714)发表题为“Cysteine carboxyethylation generates neoantigens to induce HLA-restricted autoimmunity”的长篇研究论文,首次发现并鉴定出一种全新的蛋白翻译后修饰(Post-translational modifications,PTMs)——半胱氨酸羧乙基化修饰。作者开创性地发现代谢物3-HPA引起整合素蛋白ITGA2B上半胱氨酸羧乙基化修饰,该修饰能够诱导AS产生修饰型新生抗原,发生特异性自身免疫反应,为攻克重大自身免疫病提供了“差异修饰蛋白—修饰型新生抗原”的系统方法策略,是该领域具有重大突破的原创性理论创新。并对建立AS等免疫病自身抗原特异性筛查和针对性治疗策略具有重大意义。(麦特绘谱为本研究提供Q300全定量代谢组学检测服务)



研究

概要


文章阐述了整合素蛋白ITGA2B的第96位半胱氨酸与3-羟基丙酸(3-HPA)在胱硫醚β合酶(cystathionine-β-synthase,CBS)催化下形成羧乙基化修饰(ITGA2B@96Cys+72.021),该修饰引发了溶酶体降解程序产生羧乙基化修饰肽ITGA2BceC96,这些修饰肽通过HLA-DRB1*04刺激CD4+T细胞反应并诱导自身抗体的产生。经TCR克隆验证等多种方法证实,该修饰肽是CD4+T细胞反应敏感的新生抗原,可引起HLA限制性自身免疫反应



图1. 半胱氨酸羧乙基化修饰生成新生抗原诱导HLA限制性自身免疫反应


研究

思路


本研究采用泛蛋白修饰组学搜索引擎,测定了强直性脊柱炎患者外周单核细胞的泛蛋白修饰图谱,发现了一系列非编码氨基酸(如图2所示)。



图2:强直性脊柱炎PBMC的泛蛋白翻译修饰图谱及ITGA2B@96Cys+72.021的确证

(图示来源Fig.1)


通过质谱和修饰特异抗体的验证,研究发现具有72.021Da质量偏移为半胱氨酸的羧乙基化修饰(Cys+72.021,与赖氨酸乳酸化修饰(Lys+72.021)不同),且此非编码氨基酸主要发生在AS患者整合素蛋白的第96位半胱氨酸上(ITGA2B@96Cys+72.021)(如图2所示)。体内外实验表明,半胱氨酸羧乙基化修饰需要代谢物3-羟基丙酸(3-hydroxypropionate,3-HPA)作为反应底物,在CBS催化下,通过与半胱氨酸羧侧链巯基的脱水反应生成羧乙基硫醚(如图3所示)。



图3. 半胱氨酸羧基乙基化修饰需要3-HPA作为底物

(图示来源Fig.2, Fig.3)


整合素蛋白的第96位半胱氨酸上(ITGA2B@96Cys+72.021)的羧乙基化修饰,引发了溶酶体降解程序产生羧乙基化修饰肽,这些修饰肽通过HLA-DRB1*04刺激CD4+T细胞反应并诱导自身抗体的产生。用ITGA2B-ceC96修饰肽免疫HLA-DR4转基因小鼠可促进结肠炎和椎体骨侵蚀(见文章补充资料)。因此,代谢物3-HPA诱导的ITGA2B@96位半胱氨酸羧乙基化可以产生致病的新抗原,导致自身免疫疾病中CD4+T细胞的自反应性反应和自身抗体的产生(如图4所示)。



图4. 溶酶体降解后的ITGA2B-ceC96修饰肽介导强直性脊柱炎

(图示来源Fig.4,Fig.6,Fig. S4,Fig.S8)


综上所述,该研究开创性地发现代谢物3-HPA引起半胱氨酸羧乙基化修饰,该修饰的ITGA2B能够诱导AS产生修饰型新生抗原,发生特异性自身免疫反应,为攻克重大自身免疫病提供了“差异修饰蛋白—修饰型新生抗原”的系统方法策略,是该领域具有重大突破的原创性理论创新。


麦特绘谱有幸为这一原创性研究提供了Q300全定量代谢组学检测服务,助力关键代谢物3-HPA的发现及其功能探索。因为72.021 Da质量偏移作者对29例强直性脊柱炎病人(AS,n=29), 20例类风湿性关节炎病人 (RA,n=20),13例系统性红斑狼疮病人(SLE ,n=13),15例健康对照(HC, n=15),20例HLA-DRB1*04+ AS病人及16例HLA-DRB1*04− AS病人血浆样本进行了Q300全定量代谢组学检测,发现代谢物3-HPA在AS病人血浆中发生显著变化,这一发现为ITGA2B羧乙基化修饰提供了客观依据(如图5所示)。



图5. 3-HPA是CBS催化ITGA2B羧乙基化修饰的的代谢底物

(图示来源:Fig. S15,Fig. S4)


参考文献


Zhai Y, Chen L, Yang JH, Zhu P, et al. Cysteine carboxyethylation generates neoantigens to induce HLA-restricted autoimmunity. Science. 2023



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