Nature Immunology | CD8+T细胞通过尿素和瓜氨酸循环解氨毒以促进自身记忆发育

2023-03-17 12:16:40, 麦特绘谱 麦特绘谱生物科技(上海)有限公司



在ATP生成过程中,副产物活性氧(ROS)和氨(NH3)凭借细胞毒性影响细胞寿命。因此,长寿的细胞需要清除ROS和NH3。作为长寿细胞,CD8+记忆T(TM)细胞已被证实可生成NADPH和清除ROS,但CD8+TM细胞解毒氨的方式还不清楚。深入解析CD8+TM细胞NH3解毒机制,有助于改善基于T细胞的癌症免疫疗法。


2022年12月05日,华中科技大学基础医学院黄波教授课题组在Nature Immunology上发表了题为“Ammonia detoxification promotes CD8+T cell memory development by urea and citrulline cycles”的研究成果。该研究证实尿素循环不只发生在肝脏,CD8+TM细胞动员氨基甲酰磷酸(CP)代谢途径来解毒氨,以维持其长期生存——利用β-羟基丁酰化上调CP1并触发CP代谢级联,精氨酸在细胞膜上形成后被转移到线粒体被分解成尿素和鸟氨酸,尿素被转运蛋白运出至胞质溶胶;胞内精氨酸被一氧化氮合酶 (NOS) 分解为一氧化氮 (NO) 和瓜氨酸并沿尿素循环再次产生精氨酸(瓜氨酸循环)。



图1. 记忆T细胞通过氨解毒促进记忆形成的机制


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CD8+TM细胞中存在尿素循环


研究人员将CD45.1+ OT-I T细胞转移到CD45.2+ C57BL/6小鼠身上并用表达卵白质(Lm-OVA)的李斯特菌感染,在第7天和第30天分别用CD45.1+CD8+进行OVA特异性效应T(Teff)细胞和TM细胞分类。基于液质联用的代谢组学检测表明氨基甲酰磷酸盐(CP)、中间产物氨基酸和尿素在TM细胞中含量丰富;在转移OT-II T细胞和OVA蛋白免疫的小鼠模型中,CD4+ TM细胞也显示出较高的中间代谢物水平。与之一致的是,体外将CD8+ OT-I细胞分化为TM或Teff细胞后,CP和其他代谢物也高度累积于白细胞介素(IL)-15诱导的TM细胞而不是IL-2刺激的Teff细胞中。代谢流实验中,15N标记的NH4Cl体外处理CD8+ Teff和TM细胞后,CD8+TM细胞(IL-15诱导)中CP(m+1)和其余中间物质的相对丰度显著高于CD8+Teff细胞(IL-2诱导)。此外,另一氨内源性供体(谷氨酰胺)的15N标记代谢流实验得到的结果与NH4Cl一致。使用谷氨酰胺酶特异性抑制剂BEPTS阻断谷氨酰胺→氨过程,导致CD8+TM细胞尿素循环中的15N-同位素减少。这些结果表明,CD8+TM细胞中存在活跃的尿素循环。



图2. CD8+TM细胞中存在活跃的尿素循环


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尿素循环是CD8+T细胞记忆发展所必需的


与Teff细胞相比,TM细胞中的铵较少;CD8+TM细胞而非Teff细胞对NH4Cl诱导的细胞死亡表现出抵抗力。Teff细胞中氧化Bodipy染色和RIP3磷酸化没有改变,caspase-3被诱导裂解,表明细胞凋亡(而非铁死亡或坏死性凋亡)可能参与了死亡过程。尽管NH4Cl促进自噬,使用3-MA抑制自噬后并不影响NH4Cl对T细胞死亡的影响,表明自噬对T细胞死亡的影响很小。使用CPS1特异性抑制剂阻断尿素循环或CPS1异生激活剂N-乙酰谷氨酸(NAG)被shRNAs干扰后,伴随TM细胞中的氨含量增加、TM细胞的数量减少,表明α-酮戊二酸和氨由谷氨酸脱氢酶催化,产生谷氨酸用于生产NAG。NAG类似物N-氨基甲酰谷氨酸(NCG)处理CD8+TM细胞后TM细胞中的氨减少,同时增强对NH4Cl的抵抗力,TM细胞的体外形成增多(可被CPS1 shRNA废除)。小鼠经NCG处理后,在淋巴结(LNs)、外周血单核细胞(PBMCs)和脾脏中检测到更高比例Lm-OVA诱导的CD8+TM细胞。CPS1敲除后,小鼠TM细胞的频率受损且不被NCG恢复。此外,初始T细胞中氨和NAG的15N流量很小。这些结果表明,尿素循环是CD8+T细胞记忆发展所必需的。



图3. 尿素循环为CD8+T细胞记忆发展所必需


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CD8+ TM细胞动员精氨酸酶2形成尿素


WB结果显示催化尿素循环最后一步的精氨酸酶1(ARG1)并不在 OT-I 或 IL-15 诱导的 TM 细胞表达;而位于肾脏线粒体中的精氨酸同工酶2(ARG2) 在 CD8+ TM细胞中上调,并通过免疫印迹选择性地存在于线粒体中。共聚焦显微镜结果也证实了这一点,提示CD8+ TM细胞可能使用精氨酸酶2催化精氨酸产生尿素。研究人员使用 Arg2 shRNA或抑制剂 nor-NOHA 处理IL-15诱导的TM 细胞,发现 CD8+TM细胞中氨增加、尿素减少、CD8+TM细胞数量减少;此外与验证结果一致,在 Lm-OVA 感染的小鼠中,nor-NOHA 对 ARG2 活性的抑制导致氨增加、尿素和 OT- I TM 细胞减少。敲低Arg2减少了尿素、鸟氨酸含量,提高了 IL-15 诱导的 TM 细胞中 CP、瓜氨酸、精氨基琥珀酸和精氨酸含量,体内 TM 细胞形成受损。这些结果证实 CD8+TM细胞动员线粒体ARG2催化精氨酸以产生尿素。



图4. CD8+TM细胞动员ARG2以产生尿素


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SLC25A29和SLC14A1推动尿素循环


胞质溶胶是尿素循环产生精氨酸的场所,SLC25A29介导精氨酸从胞质溶胶转运到线粒体中。与Teff细胞相比,SLC25A29 mRNA 在TM细胞中增加了四倍;免疫印迹和免疫荧光染色显示 该基因定位于TM细胞的线粒体膜。敲低 SLC25A29会减少尿素和鸟氨酸含量,增加瓜氨酸、精氨琥珀酸和精氨酸水平,阻碍了 IL-15 诱导的 CD8+TM细胞形成;添加SLC25A29抑制剂吡哆醛5-磷酸一水合物也可获得类似结果。


在线粒体中,精氨酸衍生的尿素可由SLC14A1运输,从线粒体转运到胞质溶胶,最后释放到胞外。与Teff细胞相比,SLC14A1的表达在CD8+TM细胞中上调;免疫荧光染色表明 SLC14A1 在 CD8+TM细胞的线粒体中高表达。敲除 SLC14A1使CD8+TM细胞形成减少,增加 CD8+TM细胞中线粒体尿素。这些结果表明SLC25A29和 SLC14A1 在CD8+TM细胞中分别负责将精氨酸输入、将尿素输出线粒体。



图5. SLC25A29和SLC14A1推动尿素循环


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CD8+TM细胞通过瓜氨酸循环处理氨


除了被精氨酸酶利用,精氨酸还可被NOS催化生成NO和瓜氨酸并沿尿素循环途径再次产生精氨酸(瓜氨酸循环)。研究人员释放CD8+TM细胞产生的 NO,发现TM细胞(而非Teff或Tn)中产生大量的 NO和较高的NOS 活性。添加细胞 NO 产生抑制剂(L-NMMA26)导致氨水平升高并抑制 CD8+TM 细胞诱导,NO产生受到抑制,表明瓜氨酸循环 参与氨的处理,是CD8+T细胞记忆发育所必需的。与 Teff细胞相比,eNOS(内皮型)、nNOS(神经元型)和 iNOS(诱导型)在 CD8+TM细胞中的水平显著更高且 iNOS 最高。使用选择性抑制剂(N-(3-(氨基甲基)苄基)乙脒 (1400W)、L-NAME(10μM 低剂量)和亚精胺抑制酶活后,研究人员发现添加 1400W 、L-NAME 的效果明显强于亚精胺——氨增加、 NO 减少和 CD8+TM形成受损;NOS shRNA 实验结果与之一致。因此,iNOS 和 eNOS 可被 CD8+TM细胞用于处理精氨酸氮。联合使用ARG2和NOS抑制剂处理IL-15诱导的CD8+T 细胞后记忆形成几乎完全被阻断,并伴随着尿素生成中断。15N-精氨酸追踪氮代谢流结果表明尿素循环和瓜氨酸循环可分别通过m+2鸟氨酸和m+3瓜氨酸表征,约40%的精氨酸被 ARG2 分解代谢,60% 被 NOS 分解代谢(可被 ARG2 抑制剂 nor-NOHA 或 NOS 抑制剂 L-NMMA 阻断)这些结果表明瓜氨酸循环与 CD8+TM细胞中的氮处理是互补的。



图6. CD8+TM细胞通过瓜氨酸循环处理氨


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CPS1对于氮处理和记忆发展至关重要


将shCPS1 OT-I CD45.1+T细胞转移到CD45.2+小鼠体内,与转移shNC(阴性对照)OT-I T细胞相比,Lm-OVA感染导致LNs、PBMCs和脾脏中CD8+TM细胞(而非Teff细胞)数量减少。相反,OT-I T细胞中过表达CPS1导致TM细胞数量增多,氨产生减少,尿素循环中间产物增加;并在15N-NH4Cl的代谢追踪得到证实。ki67表达和5-溴脱氧尿苷(BrdU)标记结果表明shCPS1不影响细胞增殖;Annexin V+ OT-I细胞增加表明CPS1的氨清除促进CD8+TM细胞的生存;研究人员构建过表达和沉默载体并转移到小鼠体内,验证了shCPS1和OE-CPS1对CD8+TM细胞的减少和增加作用。研究人员将细胞分选后注入小鼠体内,发现30天后shCPS1组TM细胞数量减少而OE-CPS1组增加,表明CPS1的调节可能是触发氮处理的一个关键分子事件。此外,研究人员采用GFP-shNC或GFP-shCPS1 OT-I细胞移植至小鼠并进行Lm-OVA感染,发现shCPS1并不改变IL-2、干扰素(IFN)-γ、肿瘤坏死因子(TNF)-α和颗粒酶B的产生并在GFP-OE-CPS1转移的小鼠上得到验证。然而,5天后重新实验导致Teff细胞数量减少(shCPS1组)或增加(OE-CPS1组),表明CPS1可能不影响早期召回,但对后期Teff细胞数量有影响



图7. CPS1对于氮处理和记忆发展至关重要


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CPS1的β-羟基丁酰化触发CP代谢级联反应


ChIP-qPCR分析表明更高水平的H3K9bhb与 CD8+TM(IL-15衍生)细胞中的CPS1位点结合。同时, β-羟基丁酸 (BHB)增强了CPS1基因座上的 H3K9bhb 修饰及CPS1表达;Bdh1(BHB合成基因)的敲低致CPS1表达下调,添加BHB后可恢复,表明CPS1表达受 H3K9bhb调控。与Teff细胞相比,在 TM细胞中发现P300(组蛋白羟丁基化的写入器)与H3K9bhb结合更多。P300抑制剂 (A485)致BHB处理的CD8+TM细胞中 H3K9bhb 和CPS1下调;而SIRT3抑制剂3-TYP或HDAC1 抑制剂TSA则相反并损害TM细胞形成,研究人员认为P300、SIRT3和HDAC1参与了CPS1表达的调控,p300 可能使用 β-羟基丁酰辅酶 A 作为辅助因子,以产生用于CPS1表达的赖氨酸 β-羟基丁酰化。将修饰的OT-I细胞转移到小鼠后用 Lm-OVA攻击,并在 30 天后接种OVA-B16黑色素瘤细胞,结果表明CPS1缺陷促进了黑色素瘤生长并缩短小鼠存活率;过表达CPS1具有改善效果。研究人员将Lm-OVA攻击小鼠的shCPS1或OE-CPS1 OT-I TM 细胞转移到小鼠后皮下接种OVA-B16细胞,发现CPS1敲低或过表达降低或增强TM细胞的抗肿瘤作用。综合上述数据,研究人员提出Kbhb对CPS1表达的表观遗传调控触发了尿素和瓜氨酸循环,从而触发了 CD8+T细胞记忆发育的氮处理。



图8. CPS1的β-羟基丁酰化触发了CP代谢级联


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小结


肝外细胞通过转氨作用很难完全清除细胞内氨,残留的氨会危及细胞完整性,尤其是对于长寿细胞而言。因此,这些细胞类型可能存在直接解毒氨的方法。研究人员使用氮代谢流、基于液质的靶向定量代谢组、流式细胞、免疫印迹等方法,证实CD8+ TM细胞使用尿素循环和瓜氨酸循环来解毒氨;与肝细胞一样,所有氨解毒的酶都存在于TM细胞中,而不是初生T细胞或Teff细胞中。在此前ARG2的作用一致认为不是解毒氨,该研究证实CD8+TM细胞上调线粒体转运蛋白SLC25A29介导细胞溶质精氨酸进入线粒体并被ARG2转化为鸟氨酸和尿素,经线粒体SLC14A1转运蛋白将尿素输送到胞质溶胶;这一过程不仅涉及尿素循环,同时也包括瓜氨酸循环。总之,研究团队的工作揭示了CD8+TM细胞通过促进尿素和瓜氨酸循环解氨毒以维持自身长寿。




参考文献


Ammonia detoxification promotes CD8+T cell memory development by urea and citrulline cycles. Nat Immunol. 2022.


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上述研究通过靶向代谢组学、N代谢流、分子生物学实验等相结合,揭示了CD8+T细胞促进长寿的方式是促进尿素和瓜氨酸循环以解氨毒。本研究涉及的所有代谢物的靶向绝对定量和代谢流实验,麦特绘谱均可提供相关检测方案。麦特绘谱拥有业内强大的Q600全定量代谢组、Q300全定量代谢组、Q200宏代谢组及各类小分子代谢物单独检测方法共20+套;同时还包括代谢流检测、菌群16S测序和宏基因组测序等技术,适用于多种样本分析,一站式代谢组学整体解决方案、独家的检测技术、全面的数据报告以及专业的售后探讨,已经协助客户完成多个代谢流等相关项目,相关成果发表在Signal Transduction and Targeted Therapy, Science Translational Medicine, Nature Communications等顶级期刊,总计影响因子超过2000。麦特绘谱助力您的科研探索之路不断创新和突破,详情请咨询绘谱热线400-867-2686,获取详细资料!


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