关于AB SCIEX DDA 代谢数据处理Metasense 参数设定Tips

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►  打开Metasense主程序界面，设定好样品名和数据，建议先将数据在Processor中转成 .spectrus格式，这样可以减少软件运行时间。设定好Parent的保留时间，数据分析保留时间区间，注意设定格式，此例中设定为8..25。Triple TOF的MS Accuracy的设定推荐为0.005Da。

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►  通常软件会自动识别仪器种类和采集模式 (Instrument Type Acquisition Type) ，如果不能正确识别就需要人工进行指定，在Acquisition Type下拉菜单中选择DDA。External Metabolite List选择默认的ACD/Percepta，点击对应的option可以设定代谢类型。

►  在Component Detection Algorithm中选择ItelliTarget。

►  点击Component Detection Algorithm后的option进入组分识别算法的参数设定。

►  将Data Analysis Region中将Full改为false，Start tR和End tR中设定对应的数据分析区间，此例中分别设定为8和25。在Peak Picking栏中设定组分的标峰参数，其中主要可以调整Peak Minimum Height， Peak S/N Threshold和Peak Area Threshold，这三个参数分别是最小峰高，峰的信噪比和最小峰面积的阈值，Peak Picking中的参数要根据自己数据的实际情况进行调节。此例中将最小峰高阈值设定到占最大峰高的0.1%。Smoothing栏中无需做任何调整，不需要进行平滑处理。在Target Analysis栏中设定提取组分提取MS 谱图的MS精度 (Mass Accuracy for MC Generation) 高分辨质谱可以设定为0.005Da，在组分分子式吻合度指数FFQ (Formula Fit Quality Index) 中设定为0.5，该指标是所选组分的计算同位素模式和实验同位素模式的 “相似性度量” ，完全吻合的是1，最不吻合的是0，一般可以设定一个中间数值0.5 。

►  勾选窗口右侧Advanced，进入高级参数设定窗口

►  此高级参数设定窗口中仅需要设定一个参数，找到Mass Accuracy for Peak Labeling，设定Mass Accuracy到0.005Da，此参数设定的是MS谱图中数值显示精度。

►  至此组分识别IntelliTarge参数设定完成点击OK保留参数设定回到程序主界面。

►  勾选主界面右下角Use Advanced Setting进入高级参数设定

►  在此高级参数设定中Metabolite Confirmation栏中针对不同的实验类型做相应的调整，如果你的实验为单点数据请将Remove Metabolite With Maximum in T0，Remove Metabolite with Only One Peak, Remove Metabolite with Slow Speed Reaction和Remove Metabolite with Significant Fluctuation调整为False，如果你的实验是多点实验如孵化实验，可以将这四个参数调整为True。此例为单点实验，所以这四个参数均为False。

►  点击OK回到主界面，参数设定完成，点击Run运行即可。