Sander Piersma:从磷酸化蛋白质组学数据中推断激酶活性的工具及应用 | WeOmics-G13

2022-11-15 09:51:47, 西湖欧米wOmics


“Westlake Proteomics Series (WeOmics)” 系列研讨会 由西湖大学Guomics实验室,西湖实验室iMarker实验室,The Proteomic Navigator of the Human Body (π-HuB) Project共同举办,并由西湖欧米承办,SCIEX协办。


本期研讨会主题:磷酸化蛋白质组学数据和激酶活性 

直播时间:2022年11月15日(周二)7:00-8:30PM


报告专家:

Sander Piersma,阿姆斯特丹大学医学中心肿瘤蛋白质组学实验室,研究科学家


讨论嘉宾:

陈晨(主持人),西湖欧米研发总监

边阳阳,西北大学生命科学学院教授
张振鹏,北京蛋白质研究中心博士后研究员
张程,西湖大学Guomics实验室博士后研究员
吕梦葛,西湖大学Guomics实验室博士生


本次研讨会介绍:
异常细胞信号通路是癌症和其他疾病的一个标志,其中包括蛋白质的磷酸化/脱磷酸化在内的信号通路是最重要的信号传导机制之一。蛋白质的磷酸化是由蛋白激酶催化的,人类基因组中已经发现了530多个蛋白激酶。异常的激酶活性是肿瘤发生和癌症进展的驱动因素之一,这导致下游底物的磷酸化丰度改变。这种底物磷酸化的足迹可以用来推断上游激酶的活动。目前的磷酸化蛋白组学方法可在每个生物样本中获得>10,000个磷酸化位点,这些信息可用作预测激酶活性。过去十年报道了许多推断激酶活性的软件工具,Sander Piersma 博士将做一个概述。主要的工具包括:激酶底物富集分析(KSEA),翻译后修饰底物富集分析(PTM-SEA)和整合的激酶活性推断分析(INKA)。Sander Piersma 博士会比较这三个主要工具,并展示它们的应用。



往期回顾

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