蛋白组学研究的老师看过来！火爆的FASP技术了解一下

2022-09-21 07:35:02, 赛多利斯德国赛多利斯集团

上一次我们介绍了超滤家族小兄弟Vivaspin® 500和Vivacon® 500在生物分析前处理中的作用，并介绍了剑桥大学的科学家使用Vivaspin® 500处理小分子量胰岛素链获得了良好结果。这次我们要正式介绍一下现在被吹爆的过滤辅助样品制备（ Filter-Aided Sample Preparation， FASP）技术！

2009年，Matthias Mann领导的研究小组（马克斯普朗克生物化学研究所，蛋白质组学和信号转导系，Martinsried 德国）发表了一种使用超滤装置制备肽段样品的新方法。这种被称为过滤辅助样品制备（Filter-Aided Sample Preparation，FASP）¹的新方法可以对用洗涤剂溶解的生物样品进行无凝胶处理，以便通过质谱分析法进行蛋白质组学分析。在FASP中，通过超滤除去洗涤剂，经蛋白消化后，还可以将肽段与未消化物质分离开。

有研究对蛋白质组和糖蛋白质组分析用的不同超滤装置的有效性作了对比分析。发现包括标称截留分子量（MWCO）为30和50 kDa的Vivacon® 超滤装置在内的水平超滤装置非常适用于FASP²。

Vivacon® 500
处理量0.5ml

Vivacon® 2
处理量2ml

我们采用的是极低吸附的Hydrosart膜，而且是膜面积非常小的横膜，最大程度降低非特异性吸附。

因为FASP技术处理速度快、易于操作、可重现性高等特点，其已成为一种备受青睐的蛋白质组学的操作流程。此外，该技术也已经用于蛋白质组学的许多新应用，包括定量核酸以估算细胞数量、为肽段分级提供支持的蛋白质衍生化，以及修饰用于提取部分蛋白质的洗涤剂^3,4。

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*本活动的最终解释权归赛多利斯所有

-参考文献-

1.Wiśniewski et al. (2009). Universal Sample Preparation Method for Proteome Analysis. Nature Methods 6, 359-362.

2.Wiśniewski, Zielinska and Mann (2010). Comparison of Ultrafiltration Units for Proteomic and N-glycoproteomic Analysis by the Filter-Aided Sample Preparation Method. Analytical Biochemistry 410(2), 307-309.

3.Matic et al. (2011). Absolute SILAC-Compatible Expression Strain Allows Sumo-2 Copy Number Determination in Clinical Samples. Journal of Proteome Research 10(10), 4869-4875.

4.Wiśniewski (2017). Chapter Two - Filter-Aided Sample Preparation: The Versatile and Efficient Method for Proteomic Analysis. Methods in Enzymology 585, 15-27