酵母杂交Tips6 顺式作用元件怎么看？

2022-09-14 04:43:30, 欧易生物 上海欧易生物医学科技有限公司


想通过酵母单杂交筛选上游调控因子，该如何选择单杂交诱饵序列呢？选了启动子后，但是启动子上元件很多，如何查询元件功能，选择关键motif？


01

酵母单杂交诱饵选择方法（Y1HGold-pAbAi系统）


1. 启动子片段形式：选择感兴趣元件比较集中的区域（建议200-300bp左右）；

2. motif形式：选择感兴趣motif进行串联。

注意事项:插入序列中不要同时含有BstbI/BbsI


02

常用的启动子预测软件


http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/

(Plantcare顺式作用元件预测结果示例）


https://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/?action=newplace

(NEW PLACE顺式作用元件预测结果示例）


温馨提示：由于不同建库材料基因表达的时空特异性差异，以及转录因子在总转录水平中的占比较低（约3-5%），推荐所研究的诱饵与建库取材的表达谱相匹配，更有助于通过单杂交技术筛选上游调控因子。


欧易生物提供水稻/拟南芥转录因子家族文库筛选服务。

-OEBIOTECH

OEBIOTECH -


END

排版人：小久


原创声明：本文由欧易生物(OEBIOTECH)学术团队报道，本文著作权归文章作者所有。欢迎个人转发及分享，未经作者的允许禁止转载。

点击“阅读全文” 收获更多精彩

  • 客服电话： 400-6699-117 转 1000
  • 京ICP备07018254号
  • 电信与信息服务业务经营许可证：京ICP证110310号
  • 京公网安备1101085018
  • 客服电话： 400-6699-117 转 1000
  • 京ICP备07018254号
  • 电信与信息服务业务经营许可证：京ICP证110310号
  • 京公网安备1101085018

Copyright ©2007-2026 ANTPEDIA, All Rights Reserved