视频实操SCI作图课(14)：KEGG分类柱形图小工具

KEGG分类柱形图小工具

在迈维云第十个小工具的介绍中，我们介绍了什么是KEGG数据库，以及如何用迈维云进行KEGG富集分析。KEGG富集分析结束后，需要将富集结果进行图形化展示，便于在文章中进行展示。KEGG富集分析的图形化展示方式有两种，KEGG富集气泡图和KEGG富集分类柱形图。我们这次介绍的小工具是KEGG分类柱形图小工具。

KEGG分类柱形图常常用来表示差异分组间基因，蛋白质，代谢物的KEGG富集分析的图形化展示。

差异基因KEGG富集分类柱形图

以差异基因KEGG富集分类柱形图为例，横坐标代表差异基因的数量，纵坐标代表差异基因富集的KEGG通路名称。柱形图右侧有两个值，一个数字，一个百分比。数字的含义代表注释到该通路的差异基因的数量，比例的含义代表注释到该通路的差异基因数量与有注释的所有差异基因的比值，图片最右侧的标签代表KEGG通路所属的分类，分别用不同的颜色来展示。

迈维云平台链接：https://cloud.metware.cn/

使用迈维云平台进行KEGG富集分类柱形图绘制，只需要准备一个文件。以迈维代谢KEGG富集分析表为例，进行KEGG分类柱形图绘制只需要两列内容。第一列#Kegg_pathway，第三列Cluter_frequency。

在提交数据时，可以按照已有的KEGG富集分析结果进行提交即可，不过要保证KEGG富集分析结果里包含上述两列的内容，并且该两列内容的表头与我们示例文件要保持一致，这样后台才能自动识别这两列数据。

流程运行结束的界面如下图所示，包括查看按钮，下载按钮和删除按钮。如果直接使用可以点击下载按钮。因为该工具为迈维云的高级分析工具，可以在线对图片进行修改，点击查看按钮即可。

高级绘KEGG分类柱形图的修改报告数据修改和格式修改两部分。

（1）数据修改允许删除该分析结果中的任意一条通路的数据。操作要点是，点开删除开启按钮，鼠标左键点击要删除的通路名称，即可在该图中删除该通路。

注意事项：如果需要保存删除后的图片直接点击下载按钮即可。如果需要恢复原图，只需刷新即可。

（2）格式修改，点击配置面板进行操作。格式修改可以对图片中展示的字体，字号进行修改。标题名称，ｘ轴，Y轴标题进行修改。以及图片宽度，柱条厚度进行修改。还可以对KEGG分类颜色展示进行修改。

往期精彩：

• 视频实操SCI作图课(13)：样本相关性分析告诉你生物学重复如何选
  

• 视频实操SCI作图课(12)：迈维云平台助你事半功倍提取序列
  

• 视频实操SCI作图课(11)：如何一眼看透你的数据分布——直方图
  

• 视频实操SCI作图课(10)：多组学分析必会——Kegg富集分析小工具