视频实操SCI作图课(5):如何合并代谢物数据?合并表格2min搞定!

2022-04-14 16:14:24, 小迈 武汉迈特维尔生物科技有限公司



前几期我们了解了PCA、PLS-DA、OPLS-DA等常见的代谢物数据分析的小工具,在做这些数据分析前,我们经常需要将2个表格的数据合并到一个表格中。在合并表格中,大家可能会采取复制粘贴的方式。如果大家代谢组数据量少时可能影响不大,但数据量多了,操作起来就比较复杂,这个时候合并表格小工具就会大显神威。无论多复杂的数据,通通2min搞定。接下来和产品小姐姐一起看视频了解合并表格具体操作过程吧!


 

 视频解说教程


1
什么时候用合并表格?

合并表格的功能就是将2个表格按照指定列的相同内容进行合并,变成包含两个表格内容的一个表格。如我们手里有A、B两套代谢组数据,A数据包含物质、cpd_ID、CAS信息,B数据包含物质、样本1和2含量信息,需要将物质、cpd_ID、CAS、样本含量信息在同一个表格显示,即可使用合并表格小工具。




2
合并表格如何操作?

a. 第一步:任务名称

任务名称根据我们文件的特性、功能或需要命名,如案例命名为糖样本含量表。注意建议任务名称长度小于20个字符,一个中文汉字或英文字母均记为一个字符。


b. 第二步:输出文件名称

输出文件名称需指定一个长度4-16个字符的字符串,默认为demo。注意此参数禁止使用中文,只允许包含数字、大小写字母、点号(“.”)、下划线(“_”)和中划线(“-”)的组合,如案例命名为Sample-sugar-content。


c. 第三步:输入文件A(inputx)

该文件需要是txt 格式,且文件大小不得超过 50M。具体操作为打开A表格—另存为文本文件(制表符分隔)(*.txt)—打开生成的txt文件—另存为—编码UTF-8—保存。注意txt 格式要求为Tab分隔的文本文件,编码格式为UTF-8。示例如下:


d. 第四步:输入文件B(inputy)

格式要求与文件A一致,至少包含一列与文件A相同的列。示例如下:



e. 第五步:标题行A(headerx)

当文件A有标题行时选择True,否则选False。


f. 第六步:标题行B(headery)

当文件B有标题行时选择True,否则选False。


g. 第七步:待合并列A(byx)

点启用,并填写指定文件A待合并列的列标题或序号,如案例填写物质或1。若本参数与待合并列B全都留空,则自动把两文件共有的列作为待合并列。


h. 第八步:待合并列B(byy)

与第七步一样,点启用,并填写指定文件B待合并列的列标题或序号,如案例填写物质或1。


i. 第九步:保留数据A(allx)

默认选择False。选择True时,将保留仅在文件A中出现而文件B中没有的行,缺少的数据将以NA填充。如案例选择False输出为:



j. 第十步:保留数据B(ally)

同第九步一样,默认选择False。选择True时,将保留仅在文件B中出现而文件A中没有的行,同时缺少的数据将以NA填充。


k. 第十一步:结果排序 (sort)

默认选择True,其将对结果按合并列的内容依据ASCII排序。在本例中,若本参数为True,将会对结果按“物质”列排序。


l. 第十二步:忽略字符(incomparables)

默认为空。指定不参与合并的字符,该字符不会出现在结果中。留空则所有字符都参与合并。



m. 第十三步:提交

等待任务完成后,进行下载即可。



3
文章怎么用表格?

在文章中代谢物的含量数据通常可以直接用表格展示。但完成数据合并整理后,Excel的格式无法直接运用文章,需要对表格进行美化加工。一般需要调整3线表的格式,同时左对齐或者居中对齐。这样处理后的表格就可以直接用于文章啦!



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