项目文章 | IF=11.492！首个基于中国汉族人群的冠心病mGWAS研究

2021-07-09 14:25:32, 小迈武汉迈维代谢生物科技股份有限公司

今年年初，广东省人民医院钟诗龙教授团队的研究成果刊登在 “Clinical and Translational Medicine” 期刊上，这项研究在中国汉族人群冠心病（Coronary Heart Disease，CAD）队列中进行了基于代谢组的全基因组关联研究 (mGWAS)，这也是汉族CAD人群的第一个大规模mGWAS研究。鉴定了7个新的代谢物数量性状基因位点（mQTLs）并揭示了这些mQTLs可能的临床意义。迈维代谢提供了血浆广靶代谢组的检测。

● 期刊：Clinical and Translational Medicine

● IF：11.492

● 发表时间：2021.01

冠心病（Coronary Heart Disease，CAD）是全球最常见的心血管疾病类型，发病率和死亡率都很高。遗传变异可以解释大约 10.6% 的 CAD 遗传性，同时，CAD又与人体代谢密切相关。基于代谢组的全基因组关联研究 (mGWAS)是发现重要的与代谢有关的mQTL的一种有效方法，它可以深入了解基因和代谢物之间的生物学联系和分子机制。迄今为止，已经发现了数百个mQTL，然而，大多数 mGWAS 都是在欧洲人群中进行的，在中国人群中进行的研究数量有限。

这项工作一共涉及来自三个临床中心的 1551 名 CAD 患者。发现集为广东省人民医院的1028名CAD患者，随访五年；验证集是来自三个中心的523名CAD患者（广东省人民医院、湘雅医院、中山大学附属第一医院），随访两年。使用广泛靶向的代谢组学的方法检测分析血浆样本中的代谢物，并从血细胞中收集 DNA 进行基因分型。主要研究设计如图所示。

■ ■■■■

图1.主要研究和分析设计示意图

CAD：冠状动脉疾病； MACE：主要心血管不良事件

初步分析确定了13个代谢物-数量性状基因位点（mQTL）

最初的关联分析中，一共有300多万个SNP位点与两个独立队列中的 161 种代谢物和 12280种代谢物比率相关。将前10个主成分、性别、年龄、AST浓度、降血压药物、估算肾小球滤过率 (eGFR) 和糖尿病作为协变量，经过异质性检验、P 增益和连锁不平衡 (LD) 分析筛选后，这些关联下降到109个（包括 13 个代谢物和 96 个代谢物比率），与13个基因位点相关，如图2所示。曼哈顿图如图3所示。

■ ■■■■

图2. meta分析中与代谢物或代谢物比率相关的基因位点

■ ■■■■

图3. meta分析中位点的曼哈顿图

(A) 红色虚线表示单个代谢物的全基因组显着性阈值

( p < 3.11×10 ^-10 )

(B) 红色虚线表示代谢物比率的全基因组显着性阈值

( p < 3.88×10 ^-12 )

单样本MR方法发现 IPA与 MACE 风险相关

为了探索这些与mQTL 相关的代谢物是否影响心血管终点事件的发生，作者们使用孟德尔随机化 (MR) 方法来解释它们之间的因果关系。首先，通过 Cox 回归模型探讨发现集中mQTL相关代谢物与死亡和主要不良心血管事件（MACE）之间的关联。在调整了性别、年龄、eGFR、AST、高血压、糖尿病、心血管家族病史、吸烟史等协变量之后，初步观察到 IPA（3-吲哚丙酸）可能会降低 MACE 的风险。然后使用两种 MR 方法（单样本MR、双样本MR）来探索它们的因果关系。在单样本 MR分析中发现 IPA 与 MACE 风险相关（HR _[95%CI]，0.70 [0.55–0.89]）。遗憾的是，在双样本 MR 分析中没有发现有力的证据。