项目文章 | GUT:磁控胶囊内窥镜-肠道内容物无创采样的新方法!

2021-05-19 17:43:24, 小迈 武汉迈维代谢生物科技股份有限公司




2021年1月,武汉协和医院消化内科蔺蓉教授课题组的研究成果--磁控采样胶囊内窥镜的设计开发与性能检测已经被GUT(IF=19.819)接收。该项研究设计开发了一种磁控采样胶囊内窥镜(magnetically controlled sampling capsule endoscope,MSCE)用于无创采样,并与常规手术采样的样本对比,分析肠道菌群和代谢组学检测数据的差异。结果证明MSCE方法能够准确反映肠道的菌群和代谢产物信息,并且封闭采样可以很大程度上避免样本污染。迈维代谢参与了其中代谢组学检测及数据分析的工作。


肠道菌群和其代谢产物与多种重要疾病的预防、诊断、预后和治疗有关。目前获取有关微生物/代谢物的信息的方法有局限性。胶囊内窥镜目前已用于胃肠道检查,但是它缺乏采集肠道生物样本的能力。很少有研究将胶囊内窥镜采样和肠道菌群(或代谢)研究结合起来。这项研究旨在开发一种精确的磁控采样胶囊内窥镜(MSCE),可以方便、无创、准确地获取消化生物信息,用于疾病诊断和评估。



本项研究一共采用了8只广西巴马小型猪作为研究对象,随机分配为两组,每组4只。实验组接受抗生素治疗建立腹泻模型,对照组给予同样体积的生理盐水。10天后,同时使用MSCE和常规手术两种方法对8只动物模型的空肠和回肠的内容物进行采样,一共收集到32份肠道内容物样本。随后对这些样本进行了微生物和代谢物的成分分析。整体实验设计如下图所示:


 

实验设计






1


MSCE可以通过直接可视化获取肠内容物,成功率高

MSCE的总体设计如下图所示,先用体外模型测试了MSCE取样的可行性。操作者可以通过传回的视野独立控制它的方向,当MSCE到达指定位置时,可以将其采样端口旋转放置在内容物中。外部提供采样命令,通过MSCE的采样端口进行采样。


 

MSCE模型图



2


MSCE和手术可以在不同肠段取到类似的肠道菌群和代谢产物

通过16S rDNA测序评估对照组空肠和回肠段的菌群组成,结果发现,手术组和MSCE组的α多样性无显著差异;16S rDNA测序结果还表明,与空肠内容物相比,回肠内容物变形杆菌的丰度相对降低,而厚壁菌门的丰度提高,MSCE和手术采样得到的结果相似(图3)。


 

图3MSCE和手术采样对不同肠段的微生物分布情况比较


接下来对比了不同肠道的代谢物检测结果。PCA分析显示,影响聚类的主要因素是不同的采样区域,而不是不同的采样方法。关于空肠和回肠之间的差异代谢物,手术组和MSCE组的下降/无差异/上升的代谢物数量相似(249 vs 250、167 vs 170、5 vs 7)。两种不同方法采样的空肠和回肠的差异代谢产物也聚集在相似的KEGG途径中(图4)。上述结果表明,这两种不同的采样方法不会影响不同肠段的代谢物组成


 

图4MSCE和手术采样对不同肠段的代谢物成分影响比较



3


MSCE和手术可以在不同疾病模型中取到相似的肠道菌群和代谢产物

通过评估两组中菌群多样性和组成的变化,发现抗生素的使用显著降低了菌群多样性。与手术组相比,通过MSCE收集的样本具相似的α多样性指数(图5A–B)。β多样性分析表明,引起微生物群落差异的主要因素是区域和模型差异而不是取样方法差异(图5C)。在疾病模型中,抗生素治疗降低了拟杆菌、杆菌和放线菌的数量,而埃希氏菌-志贺氏菌属的丰度明显增加,这个特征在回肠中尤其明显。然而,与手术组相比,通过MSCE收集的样本显示出类似的微生物群组成(图5D)。

为了确定两种方法的技术重现性,研究者们评估了两组的代谢物成分。不同的模型间出现了清晰的样本聚类,而手术组和MSCE组则聚在一起,这表明差异在很大程度上由不同的模型而不是方法来解释(图6A)。使用VIP分数来筛选差异代谢物,发现手术组的结果与MSCE组相似(图6B)。同样的,两种不同采样方法采集的不同模型差异代谢物聚集在相似的KEGG途径上(图6C)。以上结果均表明,两种采样方法均不影响代谢物谱


 

图5不同疾病模型的肠道菌群组成


 

图6不同疾病模型的肠道内容物代谢物成分



4


MSCE和手术可以取到相似的与疾病相关肠道微生物和代谢产物

最后,为了评估MSCE取样的准确性,研究者们着重分析了与肠道疾病相关的标志性菌属和代谢物,比如:大肠埃希菌-志贺氏菌属、肠球菌、乳酸链球菌科、鲁米诺球菌科等短链脂肪酸(SCFA)产生属,乳杆菌和鲁米诺球菌的抗炎属;代谢物则有与结肠炎相关的代谢产物2-吡咯烷酮、5-羟基吲哚-3-乙酸和琥珀酸,以及包含乙酰基-L-肉碱、甘油磷脂酰胆碱、马尿酸和6-甲基烟酰胺在内的多种抗炎代谢产物。上述菌属和代谢物的丰度均不受采样方法的影响(图7)。 

以上所有的结果表明,MSCE可以准确揭示与疾病相关的肠道菌群和代谢产物的丰度,从而在疾病诊断中发挥出重要作用。


 

图7与疾病相关肠道微生物和代谢产物



本研究新开发了一种磁控采样胶囊内窥镜MSCE,可以通过精确的磁控技术以无创方式对肠道内容进行可视化采样,在疾病诊断中具有很高的成功率,并验证了它对肠道菌群和代谢组学结果的准确性。研究者们认为,MSCE可能会在预防、诊断和个体化治疗方案中开辟新的篇章。


附录:点击文末“阅读原文”获取文章原文。


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