2021-04-13 04:11:37, 协和药物所 上海欧易生物医学科技有限公司
点击上方“蓝色字体”关注我们
(点击图片即可报名)
● 前言
2018年11月中国医学科学院药物研究所再帕尔·阿不力孜教授、贺玖明研究员课题组在Advanced Science发表的题为“A Sensitive and Wide Coverage Ambient Mass Spectrometry Imaging Method for Functional Metabolites Based Molecular Histology”的研究论文,通过优化的空气动力辅助解吸电喷雾质谱成像(AFADESI-MSI)技术,绘制了生物样本中超过1500种代谢物的空间分布图谱,将功能代谢物的时空变化与组织结构和生物功能联系起来,有助于分子组织学和分子病理学研究。
中文标题:一种基于分子组织学的高灵敏高覆盖质谱成像方法用于检测功能性代谢物
研究对象:大鼠肾脏,大鼠脑和人食道癌组织
发表期刊:Advanced Science
影响因子:15.840
发表时间:2018年11月
运用生物技术:质谱成像空间代谢组学
● 研究背景
解析功能性代谢物在组织中的空间分布是了解生物系统中分子过程的关键。质谱成像(MSI)具有同时显示组织中已知或未知生物分子相对丰度和空间分布的能力,已广泛用于癌症和其他疾病的组织学诊断。然而,由于组织样品的复杂性和异质性,全面绘制代谢物的分布图仍然具有挑战。尤其是对于那些具有广泛生物功能但丰度较低的代谢物,需要开发一种无针对性的,高灵敏度,覆盖范围广,化学特异度高的成像方法,以可视化多种代谢物在原始状态下的空间分布。本课题组对自主研发的气流辅助解吸电喷雾电离质谱成像(AFADESI-MSI)进行了优化,通过非靶向分析,在大鼠脑、肾脏和人食道癌组织中观察到数千种代谢物,为分子组织学研究提供了有力的分析工具。
● 研究思路
● 研究结果
1.AFADESI-MSI喷雾溶剂系统的优化
自制的AFADESI离子源与高分辨率Q-Orbitrap质谱仪结合使用。设计了可重复的组织匀浆模型,以优化喷雾溶剂系统。图1中显示了不同喷雾溶剂系统中代表性内源性代谢物的MSI。结果显示ACN/H2O(8:2)为检测的最佳溶剂,且高速气流可显著提高代谢物的离子强度。研究通过优化后的AFADESI-MSI检测到了1500多种代谢物,包括胆碱,多胺,氨基酸,肉碱,核苷,有机酸,碳水化合物,脂质和其他小分子代谢物。
图1 | 喷雾溶剂系统的优化
2.优化后的AFADESI-MSI具有高灵敏度、高覆盖度、动态范围宽和高特异性的特点
AFADESI引入了高速气流显著提高了检测的灵敏度。硫苷脂(STs)在脑和肾脏疾病中起重要作用。图2显示ST位于肾脏的肾髓质中,而在大鼠大脑中,STs主要存在于胼胝体和内囊。此外,研究第一次报告了低丰度化合物C20:0-OH-ST在肾髓质的特异性分布,进一步说明AFADESI-MSI的高灵敏度扩大了的检测范围。
图2 | 硫苷脂(STs)在大鼠脑和肾中的提取离子色谱(EIC)轮廓和MSI
较宽动态范围有助于提供精确的代谢产物分布。应用非靶向AFADESI-MSI方法在对功能代谢物的检测中实现了超过三个数量级的动态范围。图 3显示甜菜碱及其同位素离子的离子峰强度分别为1.2E6,6.7E4,5.1E3和1.1E3,并显示出清晰一致的髓质特异性分布。
图3 | 大鼠肾脏中甜菜碱及其同位素离子的MSI
在MSI中,低丰度代谢物的空间分布常常被m/z接近的高峰度离子所掩盖。课题组应用功能强大的成像软件(Δm/z = 0.001)和高质量分辨率质谱仪确保了不同代谢物的精确成像。图4显示了三种m/z非常接近的代谢物在大鼠肾脏中的特异性分布。其中m/z 808.5143(红色)和m/z 808.5557(绿色)在脑中表现出互补的空间分布。
图4 | 大鼠肾脏和大脑中m/z接近的代谢物MSI
3.基于代谢物的分子组织学研究
原位分析组织中功能代谢产物的空间分布有助于病理诊断、药物机制研究和生物标志物发现。大鼠肾脏的分析结果显示,肌酐作为肾功能的重要指标仅分布在肾盂。甜菜碱[M+H]+在髓质中显示出较高的强度,但[M+Na]+几乎完全出现在髓质中,这与髓质中钠盐的重吸收是相符合的。此外,研究发现核苷主要分布在皮质,而核苷酸在肾髓质中显示出较强的离子强度,提供了有关髓质中核苷酸循环机制的信息(图5)。
图5 | 大鼠肾脏中代表性代谢物的MSI
大脑有复杂精细的微区结构。研究显示,脂质和许多小分子代谢物的分布与大脑的特定解剖结构显示出高度的相关性(图 6)。腺苷是一种重要的神经调节剂,在胼胝体、下丘脑和丘脑中强度较低,而在端脑和小脑中含量很高。脂质,特别是磷脂(PLs)在大脑中表现出特定的空间分布。例如,磷脂酰胆碱(PC)‐36:1,磷脂酰丝氨酸(PS)‐36:1和磷脂酸(PA)‐34:1几乎仅出现在胼胝体和内囊中,而磷脂酰乙醇胺(PE)‐40:6表现出完全相反的空间分布。
图6 | 大鼠脑中代表性代谢物的MSI
原位代谢谱分析有助于深入理解代谢重编程和肿瘤的发展机制。课题组通过AFADESI-MSI分析食管癌组织的冷冻切片,结果表明精胺和亚精胺在癌组织中被上调,对应肿瘤强大的增殖能力。谷氨酰胺作为癌细胞中主要的三羧酸(TCA)循环碳源也显示出在肿瘤组织中的大量消耗。此外,研究发现某些代谢物表现出上皮特异性分布。例如,N1-乙酰基亚精胺,L-肉碱C3:0,L-肉碱C4:0,L-肉碱C5:0,硫酸胆固醇主要分布于癌旁上皮(图 7)。
图7 | 食管癌组织中代表性代谢物的MSI
● 研究结论
研究开发了一种灵敏且覆盖度广的AFADESI-MSI方法,用于原位分析组织上的代谢物并发现特异性生物标志物。通过优化喷雾溶剂系统,在组织切片上检测了到包括胆碱,氨基酸,肉碱,核苷,碳水化合物,硫酸胆甾醇,脂质在内的1500多种代谢物。AFADESI-MSI不仅可以提供与解剖学相关的代谢物的质谱信息,还可以帮助阐明分子水平的病理机制,从而揭示代谢物特定分布与结构和功能特征之间的联系。该方法具有覆盖范围广,灵敏度高,动态范围宽和特异性强等优点,在空间代谢组学研究和分子组织学分析中显示出广阔的应用前景。
小鹿推荐
基于AFADESI-MSI的分子组织学检查方法可在1cm×1cm的组织切片中在40分钟内提供数千种代谢物的空间信息。毫无疑问,这种快速高通量无需标记的质谱成像方法将为生物组织中代谢物的空间分布研究提供有力的研究工具。再帕尔·阿不力孜、贺玖明课题组针对其自主研发的MSI技术不断的优化改良,结合生物信息学,发展为空间代谢组学方法,有望促进具有空间异质性相关的生物学问题的解答。
文末看点
上海鹿明生物科技有限公司,一直专注于生命科学和生命技术领域,是国内早期开展以蛋白组和代谢组为基础的多层组学整合实验与分析团队。近期热推的空间代谢组学方法鹿明生物正在火热推广中,欢迎各位感兴趣的老师咨询详聊~
// 长按扫码即可咨询 //
获取原文
咨询鹿明生物技术空间代谢组学技术工程师
咨询样本准备
由中国医药生物技术协会药物分析技术分会为主办单位举办的首届“生物成像与空间多组学”主题学术研讨会,2021年4月16日在北京举行。研讨会报名通道已开启,欢迎各位老师扫描下方二维码报名参加哦~~
参考文献:
1. Green D. R., Galluzzi L., Kroemer G., Science 2014, 345, 1250256.
2. Zhang J., Rector J., Lin J. Q., Young J. H., Sans M., Katta N., Giese N., Yu W., Nagi C., Suliburk J., Liu J., Bensussan A., DeHoog R. J., Garza K. Y., Ludolph B., Sorace A. G., Syed A., Zahedivash A., Milner T. E., Eberlin L. S., Sci. Transl. Med. 2017, 9, eaan3968.
3. Mirzaian M., Kramer G., Poorthuis B. J., J. Lipid Res. 2015, 56, 936.
4. Wirthensohn G., Beck F. X., Guder W. G., Pflügers Arch. 1987, 409, 411.
5. Konjin Z. N., Azari M. R., Shekoohi Y., Rahimzadeh M., Seyedi M., Int. J. Occup. Hyg. 2015, 5, 101.
猜你还想看
END
小周 撰文
欢迎转发到朋友圈
本文系鹿明生物原创
转载请注明本文转自鹿明生物
我知道你在看哟
点“阅读原文”查看更多精彩
04-23 飞飞
【报名火爆】2024单细胞蛋白质组学技术与产业应用研讨会线上直播通道发布!04-23
特洁安Aquafine助力河南电子半导体客户高品质生产,为“中国芯”提供有力保障04-23
Aliben动态 | 俄罗斯科学院院士Valery Tuchin教授到访艾立本科技参观交流04-23 艾立本科技
春启青莲礼,血浆免费试 | 高深度血浆蛋白质组限时免费测!04-23
德国元素TOC总有机碳分析仪线下用户培训邀请函(第一轮通知)04-23
最高91分,机会巨大!答题赛最后12小时,通道即将关闭!04-23 市场宣传部
【 Stage-RTL反射率测试】典型配置、硬件说明、软件操作04-23
从专家共识看吉比爱如何布局质谱自动化及应对临床质谱挑战04-22 华大吉比爱
精彩回顾|华大吉比爱质谱整体解决方案亮相第五届北京临床质谱论坛04-22 华大吉比爱
汪建:三十而立,要立得正、立得稳,走出一片新的光辉04-22 华大集团
尹烨:想成为对人类历史有伟大贡献的组织,就必须秉承痴心和使命04-22 华大集团
答题有礼|世界地球日,与哈希一起保护世界上最重要的资源04-22
世界地球日,哈希助力保护水资源04-22
【惊喜不断】前处理产品秒杀季,超低优惠!04-22 电商部
德国元素耗材之星 | 线状铜(还原铜)04-22
飞凡焕新,锂想质选 | 赛默飞亮相CIBF202404-22
重磅 | 赛默飞与高校分测分会再续合作新篇章,赋能本土科研创新与人才培养04-22
农业新质生产力从生物育种开始04-22 飞飞
飞凡焕新,锂想质选 | 赛默飞亮相CIBF202404-22