一篇搞定SCI论文图片问题!

2021-02-22 11:25:57, Genechem 上海吉凯基因医学科技股份有限公司


SCI论文是每一个科研人都必须经历的艰难过程,撇开论文设计问题不说,最为头疼的就是论文图片处理问题了。一般杂志要求图片最低分辨率为300DPI,部分杂志要求不低于600DPI,而且,每一个杂志对于图片的要求都是不一样的。

作为一个合格的生物科研人,首先需要弄清楚DPI是什么?用什么工具?绘制什么格式的图片?这里我们整理了关于SCI图片最全的知识,等你收藏分享!

一、图片类型

现在使用的图片类型有很多种,每一种图片样式的使用范围是不一样的,主要的图片类型有两种:一种是点阵图,一种是矢量图。

什么是点阵图?通俗一点讲,就是图片是由点(像素)按照横向和纵向一一排布而成,优点在于可以展现丰富的内容。比如我们平时的照片,可以很容易展示出各种美丽的场景和笑脸。然而,点阵图也有缺陷,最大的问题就在于放大后失真,具体来讲,就是放大后点阵图呈现的就不是美丽的图案,而是能清晰看到一个个小方格(参照点阵图放大后效果)。

原始效果

点阵图放大后效果

什么是矢量图?矢量图在数学上定义为一系列由线连接的点构成对象。每个对象都是自成一体的实体,它具有颜色、形状、轮廓、大小和屏幕位置等属性。这样的对象就像我们几何中学到的简单图形,很多这样的对象就可以组成图片。

原始效果

矢量图放大后效果

矢量图的最大的优势是:不管图片放大多少倍都不会失真,原先是什么样的图片,放大后就还是什么样的图片,不会感到一点违和感(参照矢量图放大后效果),是不是很神奇?!但是,矢量图也不是完美的,它最大的弱点在于展示丰富的场景时,需要使用大量的资源,这使矢量图很难甚至无法展现像照片那样丰富的效果。

回到SCI论文中使用的图片,我们还需要明确一下图片格式与图片类型的关系,以下汇总了常规图片类型以及相关的图片格式。

类型格式

英文名称

名称说明

矢量图

svg

Scalable Vector Graphics

可缩放矢量图形

SVG是W3C推出的基于XML的二维矢量图形标准,可以提供高质量的矢量图形渲染

矢量图

pdf

Scalable Vector Graphics

便携式文档格式

PDF是以PostScript语言图像模型为基础,忠实地再现原稿的每一个字符、颜色以及图像

矢量图

ps

PostScript

PostScript语言描述的可任意放大和缩小的矢量图

矢量图

eps

Encapsulated PostScript

带有预视图像的PS格式

矢量图

ai

Adobe Illustrator

AI是Adobe Illustrator的文件扩展名,AI格式是一个严格限制的,高度简化的EPS子集

矢量图

psd

Photoshop Document

PSD是Adobe公司的图形设计软件Photoshop的专用格式

矢量图

emf

Enhanced Metafile

是微软公司为了弥补使用WMF的不足而开发的一种Windows 32位扩展图元文件格式

点阵图

jpeg/jpg

Joint Photographic Experts Group

联合图像专家组

JPEG是联合照片专家组开发并命名的"ISO 10918-1"文件格式,JPEG是一种俗称

点阵图

bmp

Bitmap

位图

BMP是Windows操作系统中的标准图像文件格式

点阵图

png

Portable Network Graphics

便携式网络图形

PNG是一种无损压缩的位图格式

点阵图

gif

Portable Network Graphics

便携式网络图形

GIF以超文本标志语言方式显示索引彩色图像。也就是我们常见的动态图文件

点阵图

tiff/tif

Tag Image File Format

标签图像文件格式

TIFF是一种独立于操作系统,可以支持很多色彩系统图片格式

SCI论文中常用的格式有TIFF,PDF,EPS,SVG,其中TIFF主要展示各种扫描彩图、黑白图等;PDF,EPS和SVG主要用于绘图产生的矢量图片。在投稿的时候,杂志社将你的文章送审给审稿人的时候一般是PDF格式。

二、分辨率

可以想象一下,一个800X600图像就是一个大型的棋盘,它横向有800个1X1方格,纵向有600个1X1方格,而分辨率就是这个棋盘上一个个小方格的总数目。图片分辨率越高图像越清晰,反之,图片分辨率越低图像越模糊。这就是经过放大后的点阵图会变成一个个小方格的根本原因。

描述分辨率常用的单位就是DPI(Dots Per Inch),是将计算机识别的像素与图片的真实效果关联起来的最好工具。

为了帮助大家更加形象地理解分辨率,我们使用具体的实例来描述。大多数网页制作常用图片分辨率为72dpi,即每英寸像素为72,1英寸等于2.54厘米,那么通过换算可以得出每厘米等于28像素。如果一个15x15厘米长度的图片,那么,它就是一个420*420像素的大小的图片。如果15x15厘米长度的图片,分辨率是300,那么它就是一个1770*1770像素图片。

图片压缩

点阵图是按照像素进行存储的,然而,如果不经过压缩的话,一个图片会占据大量的存储空间,同时也不利于数据传输。

图片压缩是一种通过特定的算法来减小图片大小的机制。目前的图片压缩技术主要包含了有损压缩和无损压缩。常见的压缩方式有BZip, JPEG, JPEG2000, Lossless, LZW, RLE, Zip等,而SCI杂志一般要求的压缩方式为LZW,LWZ(Lempel Ziv Welch)是一种先进的无损压缩方法,它可以在不损失图像数据的基础上,将图片的大小降到最低。

三、论文图片的基本要求

对于国内的一些杂志以及部分影响因子较低的杂志,对图片的格式要求并不高。然而,如果想要发表影响因子比较高的论文,就必须对自己准备的素材进行精心整理。影响因子较高的杂志对图片的要求是非常严格的,而且,不同的杂志对图片的要求也是不同的。下图即为Science对图片的基本要求。

Science杂志对图片的要求主要是PS和AI能够识别的图片格式,并且要求图片的分辨率在150dpi到300dpi之间,图片的长宽为5.5cm或者12cm。从杂志的印刷来看,杂志的版面一般分为通栏或者半栏。一般杂志为A4纸大小左右,通栏的宽度为15厘米,半栏的宽度为7.5厘米(不同杂志稍有不同)。因此在保存图片的时候就要判断图片是准备使用于通栏还是半栏,如果你保存的分辨率越高,图片大小还可以更小。例如图片为半栏,分辨率为600dpi,那么宽度就可以设为4厘米。

四、图片准备

准备图片资源的时候,图片最好按照较高标准进行处理。因为图片从大改小容易,从小改大难。比如,矢量图转换为点阵图很容易,但点阵图转换为矢量图难;TIFF变为JPG容易,JPG变为TIFF难;600dpi变为300dpi容易,300dpi变为600dpi难;RGB变为CMYK容易,CMYK变为RGB难……不同的杂志的图片要求不一样,保存较大的图片,后期即使需要更改杂志,也可以很容易根据要求更改图片到合适标准。

五、绘图工具

目前,常用的绘图工具有很多,其中最为强大的是Adobe公司开发的AI,它是矢量绘图工具中最强大的一个。科研工作者可以使用AI画出各种酷炫的科技插图。

PS(Photoshop)同样是Adobe公司旗下的又一神器,它可以根据需求,修改图片大小,分辨率等基本信息。而且,在一定程度上可以将低分辨率的图片转到高分辨率图片。

另外,还有一些专门用于科研分析及绘图的工具,如R语言,MATLAB,python,Graphpad prism等等。

六、云平台

不管怎样准备图片,都需要复杂的安装过程和学习过程,难免碰到麻烦。这里给大家推荐一个很好的在线分析平台,拥有多种分析工具,不仅可以输出常规杂志所需的PDF,svg,TIFF等格式的图片,还可以输出600DPI的高清图片。

Gene Matrix吉凯基因分析平台拥有多个生物信息分析应用模块,采用可视化交互界面,操作简易流畅,满足科研工作者日常的分析和绘图需求。最近,它又推出了一套针对常见杂志配色的整套绘图方案,可以根据Science,npg,lancet,JAMA,cosmic,jco,UCSC, Uchicago等多种杂志常规配置,一步完成常规杂志配色绘图,让SCI绘图的困难成为历史!

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