2020-03-14 19:28:13, Chen Duoduo Cytiva(思拓凡)
Protein G 是一种来自链球菌的细胞表面蛋白,能与 IgG 上的 Fc 和 Fab 区域特异性的结合。
图 1 Protein G 配基与抗体的结合位点示意图
与 protein A 相比,protein G 可以结合的抗体种属来源更广泛,对某些多克隆的 IgG 和人源的 IgG3 的结合更紧密。
在通常的缓冲体系下,G 蛋白能够同所有的人源和鼠源的 IgG 结合,包括鼠源 IgG1;也能够结合 A 蛋白所不能结合或者结合很弱的 IgG2a、IgG2b。
该填料与各种属来源的抗体亲和力见下表:
表 1 Protein G 和 protein A 亲和填料可纯化的抗体种属及类型汇总
1. G 蛋白是在实验室水平上纯化抗体的一个很好的选择,因为它能够广泛的结合真核来源的各种抗体。
2. Protein G Sepharose 4 Fast Flow 能够在一个很广泛的 pH 范围内结合抗体,并且在中性 pH 时结合能力最强。
3. GE healthcare 的 protein G 配基是从大肠杆菌中重组表达的,去除了白蛋白结合结构域,避免了白蛋白的非特异性结合,这在提高产品质量方面是一个很好的帮助。
1. 填装进 PD-10 空柱中(货号:17043501),以重力的方式使用。重力操作不需要依赖于任何设备,方便快捷。
▪ 首先根据样品量取适量的填料加入重力空柱,让储存液(通常是 20% 的乙醇)靠重力流出;
▪ 随后用平衡 buffer 对柱子进行平衡;
▪ 将样品上到平衡好的柱子上后,继续用平衡 buffer 进行杂质的清洗和去除。
▪ 最后用洗脱 buffer 将目的样品洗脱下来。
该流程如下图所示:
图 2 PD-10 重力纯化柱操作流程
2. 填装进离心管中,通过离心的方式使用。离心的方式同样经平衡-上样-清洗-洗脱四个步骤,前三个步骤 buffer 的置换通过离心弃掉上清来实现,最后洗脱时离心收集上清。
离心的方式经常用于免疫共沉淀实验(Co-IP),该方法利用抗体与抗原的相互作用,从粗提物中分离得到与抗体相互作用的抗原或抗原复合物,然后向上述复合物中加入 protein G 或者 protein A 填料。
抗体可以与填料结合,最终通过洗脱,得到抗体及与抗体相互作用的抗原或抗原复合物。随后经过酶切,将得到的成分进行质谱分析,结合蛋白数据库检索,确定跟抗体相互作用的蛋白。
Co-IP 的具体步骤如下:
图 3 Protein G/A 填料在 Co-IP 应用上的操作流程
3. 装填进 XK,HiScale 和 Tricorn 空柱中,连接 ÄKTA 层析系统进行使用。
1 | 使用 protein G 填料的常见问题及解答在具体的纯化过程中有什么注意事项? |
答:根据填料载量和样品中抗体的含量,取适量的填料,一般按照载量的 20-30% 进行填料用量的计算。protein G 结合各种属来源的抗体时,载量如下:
上样时保证样品条件和初始平衡 buffer 的条件尽量一致,以便样品与填料的结合(在小体积纯化时,这一点尤其重要)。
一般在实验中可以先将填料与样品孵育,以使抗体可以充分捕获目的蛋白。或者降低上样流速,以使填料和样品充分结合。
洗脱时,一般用低 pH 值(pH2.5-3)的条件进行洗脱,因此建议在样品收集管中按照每毫升洗脱产物 60-200μl 的比例加入 pH 9.0 的 Tris-HCl,以便样品洗脱后可以尽快恢复至中性 pH 条件,有助于保持样品的稳定性。
做免疫共沉淀实验时,在清洗液中加入低浓度的非离子型去垢剂,如:Triton-X-100 或 NP-40 等,可以降低由于疏水作用引起的非特异性吸附。或者适当提高盐浓度,以降低由静电作用引起的非特异性吸附。
2 | 填料可以重复使用吗?清洗的条件是什么? |
答:Protein G Sepharose 4 Fast Flow 填料是可以重复使用的,再生条件如下:
常规再生:用 2-3 倍柱体积的洗脱 buffer 清洗填料后,立即用 2-3 个柱体积的结合缓冲液进行柱子的再平衡。
当柱子压力升高,或结合能力降低时,提示可能需要对柱子进行彻底的在位清洁:
去除沉淀和变性蛋白:用两倍柱体积的 6M 盐酸胍洗,然后用 5 倍柱体积的 binding buffer 清洗。
去除结合紧密的疏水性蛋白、脂蛋白、脂类:用去垢剂如 0.1% 的 Trion X-100 在 37℃ 处理 1 min,或者用 70% 的乙醇处理 12 h,然后立即用 5 倍柱体积的 binding buffer 清洗。
3 | 血清、腹水或细胞悬浮物来源的样品,上样前需要进行什么样的预处理? |
答:血清、腹水或细胞悬浮物来源的样品经常含有脂蛋白、酚红、小分子污染物等。最好在纯化前除去。
腹水中经常含有大量的脂蛋白,可以通过两种方式除去:
在二价离子存在的情况下,用硫酸右旋葡糖酐沉淀脂蛋白,沉淀可以通过离心除去,步骤如下:
PVP(聚乙烯吡咯烷酮)能产生一个 pH 值依赖的沉淀效应,在 pH 为 7 时能够沉淀β-脂蛋白和球蛋白,但是脂蛋白不能在低于 pH4.0 时沉淀。步骤如下:
酚红是一种在实验室细胞培养中的 pH 指示剂,可能会结合到某些纯化介质上,可通过脱盐柱去除。一些低分子量的污染物可以使用分级沉淀法去除,如硫酸铵沉淀、羊脂酸沉淀等,最后利用脱盐柱来更换缓冲液并除盐,将样品置换到合适的缓冲液中,并除去没有用处的小分子。
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