【SPR互作问答】第6期:实验操作篇

2026-06-30 13:25:12, 熊晓生 极瞳生命科技(苏州)有限公司


前言

规范的实验操作是SPR数据可靠的核心保障。本期覆盖SPR全实验流程的16个高频问题,从实验准备、进样参数设置,到芯片再生、特殊实验操作,帮你掌握标准化操作流程,规避实验操作中的常见坑。

Q1

SPR实验的完整流程包括哪些核心步骤?



SPR完整实验流程分为5大核心步骤:

① 实验准备(芯片选择、缓冲液配制、样品制备)

② 配体固定(共价偶联或捕获法,验证配体活性);

③ 样品进样(预实验确定分析物浓度和再生条件);


④ 芯片再生(去除残留分析物);

⑤ 数据分析(传感图处理、参数拟合)

Q2

芯片装载前需进行哪些准备工作



① 芯片复温至室温(避免温度变化导致基线漂移);

② 检查芯片表面是否清洁,无划痕或污染;

③ 确保流路系统已清洗,无残留样品或气泡;

④ 准备好运行缓冲液,已完成过滤和脱气。

Q3

进样时间和解离时间的设置原则是什么?不同实验如何调整?

进样时间和解离时间的设置原则是什么?不同实验如何调整?


核心设置原则如下:

① 进样时间:确保分析物充分结合,动力学实验通常需要120~180 s,小分子筛选可缩短至30~120 s;

② 解离时间:确保解离信号能反映真实速率,慢解离(kd<10⁻⁴ s⁻¹)需300s以上,快解离(kd>10⁻³ s⁻¹)需120s,小分子10~120 s;

Q4

动力学分析中,分析物浓度梯度应如何设计?

表面活性剂在缓冲液中的作用是什么?常用浓度是多少?


浓度梯度设计需遵循以下核心原则:

① 浓度范围覆盖KD值的0.1~10倍,确保曲线有足够跨度;

② 至少设置5个分析物浓度点,另设零浓度和重复浓度对照;

③ 浓度梯度采用10倍以内稀释,避免跨度太大导致拟合不准确;

④ 高浓度需避免分析物聚集。

Q5

筛选实验与动力学实验的进样流速设置有何不同?



① 筛选实验:低流速(5~10μL/min),节省样品,提升检测通量;

② 动力学实验:中高流速(30~50μL/min),减少物质迁移限制,确保准确测定结合速率。

Q6

什么是芯片再生?再生的核心要求是什么?



再生是分析循环后,通过再生试剂去除芯片表面残留分析物的过程,核心要求:

① 彻底性:彻底去除残留分析物,信号回归基线;

② 温和性:不破坏配体活性,确保后续循环的结合活性稳定;

③ 兼容性:再生条件温和,避免芯片表面损伤;

④ 高效性:再生时间短,不影响实验通量。

Q7

常用的再生试剂有哪些?如何根据实验选择?



常用再生试剂及适用场景如下:

① 低pH试剂(10mM 甘氨酸-HCl,pH1.5~3.0):适用于抗体、蛋白-蛋白互作;

② 高离子强度试剂(14M MgCl₂、0.55M NaCl):适用于静电吸附的分析物;

③ 高pH试剂(1~100mM NaOH):适用于核酸、脂类;

④ 螯合剂(EDTA):适用于NTA芯片捕获的组氨酸标签蛋白。

选择原则:根据分析物与配体的结合方式,优先从温和条件开始筛选。

Q8


预实验的目的是什么?需完成哪些核心验证?



预实验是正式实验前的关键环节,核心目的与验证内容包括:

① 验证配体活性(是否能与分析物特异性结合);

② 优化进样时间、解离时间、分析物浓度和流速;

③ 筛选合适的再生条件;

④ 评估非特异性结合水平,调整实验方法。

Q9

实验中设置对照的类型有哪些?各自作用是什么?



SPR实验核心对照类型及作用如下:

① 阳性对照:已知能与配体结合的分子,验证实验系统有效性;

② 阴性对照:已知不与配体结合的分子,评估非特异性结合;

③ 空白对照(缓冲液):扣除仪器噪音;

④ 参比对照(空白芯片通道):扣除非特异性结合、基质干扰和本体偏移

Q10

免疫原性检测实验的特殊样品处理步骤是什么?



免疫原性检测核心是检测血清中的抗药抗体(ADAs),特殊处理步骤如下:

① 血清/血浆样品酸性处理(pH1~2),使抗药抗体(ADAs)与药物复合物解离;

② 立即中和至生理pH,避免ADAs失活;

③ 中和后快速进样,防止ADAs与药物重新形成复合物。

Q11

膜蛋白实验的进样流速为何通常较低?推荐流速是多少?



原因:膜蛋白固定在脂质双层中,高流速可能破坏脂质双层结构,导致配体流失;低流速能维持脂质双层稳定,同时保证分析物与膜蛋白充分结合。

推荐流速:10~20μL/min。

Q12

高通量筛选实验中,样品进样的排列原则是什么?



① 阳性对照和阴性对照均匀分布在样品板中,监控实验稳定性;

② 避免 “黏性” 样品(如强结合小分子)连续进样,影响结合信号;

③ 相同浓度梯度的样品集中排列,减少仪器调整时间;

④ 零浓度对照间隔设置,校正基线漂移。

Q13

芯片再生后需验证哪些指标以确保有效性?



需验证4项核心指标,全部达标方可继续实验:

① 基线恢复:再生后信号回归基线,信号差异≤5%;

② 结合信号稳定:重复进样同一分析物,结合响应值变化≤10%;

③ 配体活性:分析物结合动力学参数无显著变化;

④ 无非特异性累积:多次再生后非特异性结合无明显升高。

Q14

单循环动力学与多循环动力学实验的操作区别是什么?



二者核心操作差异与适用场景如下:

① 单循环动力学:一个循环中依次进样梯度浓度分析物,无需再生;优点是无需优化再生条件,节省时间;缺点是可能造成通道不可重复使用;

② 多循环动力学:每个浓度分析物单独进样,进样后再生;优点是数据稳定,再生后可重复进样,适合慢解离互作;缺点是需优化再生条件,耗时较长。

Q15

抗原表位作图实验的核心操作步骤是什么?



抗原表位作图用于判断不同抗体的结合表位是否重叠,核心操作步骤如下(此处介绍常用的夹心法):


① 固定捕获分子(如抗体)到芯片表面;

② 捕获第一种抗体,封闭剩余捕获位点;

③ 进样抗原,与第一种抗体结合;

④ 进样第二种抗体,检测是否能同时结合抗原;

⑤ 再生芯片,重复测试不同抗体对;

⑥ 分析第二种抗体的结合信号,判断表位是否重叠。

Q16

“Recover(垂钓)” 方法适用于什么场景?核心操作步骤是什么?



适用于中药活性成分垂钓、靶点筛选等场景,核心是回收与配体结合的分析物并鉴定。

核心操作步骤:

① 配体固定(如靶蛋白共价偶联至C5芯片,固定量5000~10000 RU);

② 进样样品(如中药提取液),接触时间120~180s,流速5~10μL/min;

③ 回收结合成分:用0.5% TFA洗脱,然后溶解(如甲醇、碳酸氢铵等对质谱友好的试剂),重复5~10次,合并回收液;

④ 鉴定:通过质谱分析回收成分;

⑤ 验证:回收成分与配体的亲和力测定(KD值0.1~10μM为有效结合)。


【SPR互作问答】往期链接:

【SPR互作问答】第1期:核心原理篇

【SPR互作问答】第2期:仪器组件篇

【SPR互作问答】第3期:芯片选型篇

【SPR互作问答】第4期:配体固定篇

【SPR互作问答】第5期:缓冲液与样品处理篇


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