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LncRNA测序
长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNAs)是一类长度大于200 nt并且不编码蛋白质的RNA,广泛存在于生物体内。LncRNA参与表观遗传、转录及转录后等多水平调控,与个体的生命活动和人类疾病发生有密切联系。LncRNA测序通过高通量测序以及生物信息学分析,对样品中lncRNA及mRNA进行全面的研究,在医学、农学等领域有广泛研究。
技术路线
技术参数
产品
策略
推荐数据量
周期
Hiseq PE150
≥12G
60天
样品要求
1. 总RNA:完整且无污染的RNA样品,总RNA ≥ 2 μg(单次200 ng),OD260/OD280在1.8~2.0之间,OD260/OD230 大于1.8,RIN ≥ 7,电泳检测28S:18 S ≥ 1.5。 样品切忌反复冻融,用封口膜将样品管密封,防止污染,用干冰运输到实验室。
2. 组织样品:动物、植物、微生物总量大于300 mg的新鲜样品(植物材料应尽量选取幼嫩部位)。采样后将样品立即用TRIZOL或液氮速冻,分装保存于-80℃(保存期不超过一个月)。请用干冰运输样品,各样品用封口膜将管口密封好并标记,防止出现污染。
3. 细胞样品:细胞个数≥ 1×107个。先使用TRIZOL试剂进行处理样品:每0.25 mL样品(5~10×106个细胞)加入0.75 mL TRIZOL试剂(可参考TRIZOL试剂说明书),分装保存于-80℃(保存期不超过一个月),用干冰运输样品,且各样品用封口膜将管口密封好并标记,防止出现污染。
LncRNA测序,
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