您好,欢迎您查看分析测试百科网,请问有什么帮助您的?
如果企业客服不在线,也可拨打400电话联系。或者发布求购信息
1. 产品概述转录组是指在特定生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括mRNA,rRNA,tRNA以及其他非编码RNA。通过转录组测序技术,可以全面快速获取某一物种特定组织或器官在某一状态下的所有mRNA的序列信息。2. 应用领域: ◆ 肿瘤的发生发展机制 ◆ 复杂疾病的分子机制 ◆ 药物作用靶点及机制研究 ◆ 胚胎发育研究 ◆ 环境毒理研究 3. 技术路线 4. 研究内容 5. 技术参数 (1)样本要求: 新鲜动物组织:≥0.3g 新鲜培养细胞:≥5×106个 新采集的全血:≥5ml PAXgene采血管:≥2管 RNA要求: 样品浓度:≥50ng/ul 样品体积:>10ul 样品总量:>2ug 样品纯度:RIN≧6.5(动物)、6(植物、真菌),OD260/280≧1.8,OD260/OD230≧1 (2)测序策略:PE150 (3)推荐数据量:6G以上 (4)测序平台:Novaseq,MGIseq2000 6. 案例分析 SHQ1调控的RNA剪切对急性淋巴细胞白血病细胞的存活率是非常必要的。期刊:NatureCommunication IF:12.121 发表时间:2018.10 研究单位:武汉大学 研究结论:急性淋巴细胞白血病(T-ALL)是一种恶性侵袭性血液肿瘤。本研究发现SHQ1在T-ALL中高度表达,SHQ1缺失会诱导T-ALL细胞的死亡,增加动物存活率。为阐释具体作用机制,作者利用RNA-seq发现缺失SHQ1会影响RNA的正常剪接,而MYC也会因剪接效率低而显著下调,相应地过表达MYC可显著挽救SHQ1失活引起的T-ALL细胞死亡。之前研究表明MYC是NOTCH1下游重要的靶基因,但NOTCH1调控MYC的机制尚不清楚。本研究发现在T-ALL中NOTCH1能结合SHQ1的启动子区域激活SHQ1表达,进而调控MYC表达。综上所述,本研究不仅发现了SHQ1在RNA剪接和肿瘤发生中的作用,也阐明了NOTCH1–SHQ1–MYC调控通路,为MYC基因的表达调控提供了新的见解。图1.SHQ1的缺失影响pre-mRNA的剪接效率参考文献:SuHexiu, HuJuncheng, HuangLiangetal. SHQ1regulationofRNAsplicingisrequiredforT-lymphoblasticleukemiacellsurvival. [J]. NatCommun, 2018, 9:4281.
转录组测序迈维代谢NGS测序,转录组测序
转录组测序迈维代谢NGS测序信息由武汉迈特维尔生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于转录组测序迈维代谢NGS测序报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
群组论坛--近红外(NIR)
您可能要找:迈维代谢NGS测序转录组测序迈维代谢NGS测序价格转录组测序NGS测序参数
Copyright ©2007 ANTPedia, All Rights Reserved
京ICP备07018254号 京公网安备1101085018 电信与信息服务业务经营许可证:京ICP证110310号