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CircRNA测序
CircRNA (Circular RNAs)是一类不具有5’末端帽子和3’poly(A)尾巴,并以共价键形成环状结构的非编码RNA分子。CircRNA在生物体内广泛存在,与线性RNA相比,稳定性更高,并且参与生物体内多种调控过程。CircRNA的多种特性使得circRNA在疾病研究、临床诊断以及生物的生化发育研究中具有广泛应用,成为RNA研究领域的新热点。
技术路线
技术参数
产品
策略
推荐数据量
周期
Hiseq PE150
8G
60天
样品要求
1. 总RNA:完整且无污染的RNA样品,总RNA ≥ 3 μg(单次1ug) ,OD260/OD280=1.8-2.0,OD260/OD230≥1.8,RIN≥7;RNA无明显降解,无污染,电泳检测28S:18S≥1.5。RNA溶于DEPC水中,-80℃保存,保存期间避免反复冻融。请用干冰运输样品,各样品用封口膜将管口密封好并标记,防止出现污染。
2. 组织样品:动物、植物、微生物总量大于0.5g的新鲜样品(植物材料应尽量选取幼嫩部位)。采样后将样品立即用TRIZOL或液氮速冻,分装保存于-80℃(保存期不超过一个月)。请用干冰运输样品,各样品用封口膜将管口密封好并标记,防止出现污染。
3. 细胞样品:细胞个数≥1×107个。先使用TRIzol试剂进行处理样品:每0.25 mL样品(5-10×106个细胞)加入0.75 mL TRIzol试剂(可参考TRIzol试剂说明书),分装保存于-80℃(保存期不超过一个月),用干冰运输样品,且各样品用封口膜将管口密封好并标记,防止出现污染。
CircRNA测序,
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