snp位点结构预测软件

一、数据分析流程 分析流程 1.实验部分: 通过杂交富集外显子区域序列,建库,测序。, 2.序列QC: 去除低质量reads,和连续的低质量片段,去掉接头序列。QC统计reads数量及测序质量。 3.Mapping:由于bwa能准确,快速的将短序列比对到基因组上,而且软件持续更新和说明文档完备,是外显子捕获测序的首选。 4.Sam到bam......

肿瘤是一种复杂疾病,其发生发展可能与多种因素相关,基因组、转录组、蛋白组、表观调控等都在肿瘤发生发展过程中起着非常重要的作用,对于疾病发生发展的机制解析将对临床上的诊断、治疗及预后等都有很好的指导作用。然而,从单一的分子层次入手,很难全面的解析疾病发生机制,目前越来越多的研究采用多层次多平台联合应用的策略,从多组学角度全面解析和阐述肿瘤发生发展机制。比如,由......

转录组指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合。转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带,转录水平的调控是目前研究最多的,也是生物体最重要的调控方式。RNA-Seq能够在单核苷酸水平对任意物种的整体转录活动进行检测,在分析转录本的结构和表达水平的同时,还能发现未知转录本和稀有转录本,精确地识别可变剪切位点以及cSNP(编码序列单核苷酸多态性......

全基因组重测序全基因组重测序通过对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组重测序和序列比对,可以找到大量的SNP(Single Nucleotide Polymorphism)、InDel(Insertion/Deletion)、CNV(Copy Number Variation)等信息,从而进行个体或群体的基因组的差异性分析,在植物育种研究、遗传进化分析及......

高深度搜索编码区遗传信息外显子组测序(Whole Exome Sequencing,WES)是利用探针杂交富集外显子区域的DNA序列,通过高通量测序,发现与蛋白质功能变异相关遗传突变的技术手段。相比于全基因组测序,外显子组测序更高深度、更加经济、高效。优势:1. 直接对蛋白编码序列进行测序,找出影响蛋白结构的变异;   2. 高......

单细胞测序是指在单个细胞水平上对基因组进行扩增与测序的一项新技术。该技术的建立需要两个必备条件:1.高质量的全基因组扩增技术2.高通量低成本的测序技术(Next Generation Sequencing , NGS)。 MALBAC痕量DNA扩增技术以其极低的扩增偏倚倍数和高达90-93%基因组覆盖度,可以较为全面的挖掘单细胞基因序列差异和结构变异。在单......

技术介绍人类基因组由 30 亿个核苷酸组成,它们携带着人类的遗传信息并决定人体的生理特征。人类基因组序列的 0.1%—0.2% 在人种、人群和个体之间存在 DNA 序列的差异,即单核苷酸多态性(SNP,single nucleotide polymorphism)。许多的这些单核苷酸多态性可引起不同的遗传性状,即遗传的多态性(polymorphism),如 ......

生物信息学服务   服务描述 公司致力于为全国生命科学领域提供高质量低成本,方便快捷的生物信息学服务,包括生物信息学软件定制、设计及算法整合,具体疑难生物学数据分析,高通量生物学数据分析,基于生物信息学分析探路的实验路线设计等 服务内容 1、可对基因组学、蛋白组学和生物芯片研究产生的数据进行序列比对、特异探针设计、基因功能预测、基因调控网络构建、蛋......

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采用各种软件及数据库直接对数据进行分析,客户可提供现有实验检测数据或从数据库获得,设计分析方案,提供完整数据分析报告。生物芯片分析原始数据预处理及均一化首先对原始数据进行信号值去除背景预处理,然后进行中值均一化。差异microRNA筛选采用统计学方法进行差异microRNA的筛选,一般比值大于2且t-test p<0.05的被认为是差异表达microR......

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