人工智能助力下的碱基识别SDB软件：基因合成的高效质量控制

Sanger测序作为DNA测序技术的金标准，曾在人类基因组计划中发挥了关键推动作用，并且一直被用来获得高度准确且可信赖的测序数据。因此，准确的碱基识别及读取尤其重要。

在Sanger 测序的数据分析中，经常出现下列常见的挑战：

测序峰图的形态偏离，碱基识别软件可能错误读取

测序背景干扰信号也会降低碱基识别的读取质量

染料斑干扰碱基读取

纳新创智

Smart Deep碱基识别软件 (SDB) 新利器刷新基因测序精度！

如何克服这些问题？Applied Biosystems™利用人工智能算法开发了一种新颖的Sanger测序碱基识别解决方案：Smart Deep Basecaller (SDB)软件（纳新创智 | Smart Deep碱基识别软件 (SDB) 新利器，刷新基因测序精度！）。SDB利用深度神经网络算法，提高Sanger测序图谱中的碱基识别精度。并且使用大量的内部生成的，带注释的Sanger测序数据集合来训练和测试算法。因此，SDB软件可以用于分析Applied Biosystems™基因分析仪的结果并提供先进的碱基识别及读取。Sanger测序数据分析的新利器，增强研究人员对测序结果的信心。

SDB碱基识别软件新性能一览：

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增加读取长度，更高通量

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强大的碱基识别：轻松应对染料峰、N-1 峰、迁移率偏移、高GC困难模板

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新功能Get,识别杂合性插入/缺失 (het indel)

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通过增强视图提高 3’ 端分辨率

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减少编辑=缩短人工审核时间

如何利用SDB碱基识别软件进行基因合成质量控制QC

讲座回放

基因合成是一项重要的生物技术工具，但质量控制是确保合成基因的准确性和可靠性的关键。从质粒构建到基因编辑鉴定进行碱基序列确认，Sanger测序作为最广泛的DNA测序方法应用于质量控制过程中。我们将介绍SDB碱基识别软件在基因合成QC中的应用案例，并探讨其在碱基识别和优化合成序列方面的作用。

赛默飞Gene Art 从寡核苷酸组装到基因克隆，提供基因合成服务。Gene Art测序经理Werner Sterr专注于支持基因合成与测序服务，讲座中详细分享了Gene Art在基因合成的工作流程中，引入SDB碱基识别软件进行基因合成质量控制，并且从多维度对SDB碱基识别软件与KB Baseballer及第三方软件进行测试对比。结合案例展开介绍了SDB更长的碱基读取及强大的碱基识别能力可应对日常困难模板数据分析，另外，减少编辑审查的时间可提高工作效率。

Gene Art利用Sanger测序进行基因合成质量控制

QC工作流程中，引入SDB碱基识别软件进行Sanger测序数据分析

多维度对SDB碱基识别软件与KB Baseballer及第三方软件进行测试对比

基于荧光毛细管电(CE)基因分析平台

进行Sanger测序和多重荧光片段分析

远超您的预期!

如果您对以上应用感兴趣，