免疫肽组：揪出体内坏份子——抗原

亲爱的科研伙伴们，青莲百奥在此向您展示我们的创新产品——免疫肽组学。我们专注于利用尖端的质谱技术和生物信息学工具，为肿瘤免疫治疗和疫苗研发提供深度解析和个性化解决方案。

什么是免疫肽组学

免疫肽组是指对有核细胞在参与抗原呈递途径中的 MHC I 类或 II 类蛋白质上呈递的全部多肽的研究，对于探究细胞介导和体液反应介导的免疫原性表位至关重要。

图1：MHC I类和II类抗原呈递途径1

青莲百奥技术流程

青莲百奥已推出专门检测免疫肽组学的一套完整方案。通过MHC抗体富集MHC及其结合肽，使用高深度质谱仪tims TOF HT进行检测。随后采用peaks独有的Deep novo深度测序技术，通过连续迭代预测氨基酸，从而从串联质谱（MS/MS）数据中重建多肽序列。不需要序列数据库，因此可以从质谱数据中预测未知多肽的氨基酸序列，有助于发现新抗原、开发疫苗以及推进癌症免疫治疗。

图2：青莲百奥免疫肽组学技术流程

青莲百奥技术优势

图3：青莲百奥免疫肽组学优势

应用场景

免疫肽组学作为肿瘤免疫治疗领域的前沿技术，通过高通量鉴定肿瘤特异性抗原肽段，为个性化癌症疫苗和细胞疗法的开发提供了关键信息。它揭示了肿瘤细胞如何通过调节MHC分子的表达来逃避免疫系统的监视，从而为设计新的免疫治疗策略提供了分子层面的见解。

应用案例：肿瘤-免疫治疗

2023年11月，芬兰加赫尔辛基大学团队基于免疫肽组学鉴定了小鼠（AB12 细胞系）和人细胞系（H28、MSTO-211H、H2452 和 JL1）以及患者原发肿瘤中恶性胸膜间皮瘤（MPM）的免疫肽组学抗原呈现情况。该研究通过PeptiCRAd技术包被筛选的两个免疫肽，对小鼠进行免疫治疗。结果表明其有效诱导了抗肿瘤免疫反应，抑制了荷瘤小鼠AB12肿瘤生长。综上所述，免疫肽组学可以用于间皮瘤治疗性癌症疫苗的研发。

图4：恶性胸膜间皮瘤免疫组学检测2

应用案例：感染疾病-抗原筛选

2021年7月，麻省理工学院和哈佛大学布罗德学院团队 用严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）感染两个细胞系，并使用质谱法检测其免疫肽。该研究发现HLA-I肽不仅来源于经典开放阅读框（ORF），而且来源于当前疫苗未捕获的刺突和核衣壳中的内部框外ORF。在人源化小鼠模型和患有新冠肺炎的个体中，来自框架外ORF的免疫肽引发了T细胞反应，甚至超过了2021年报道的一些T细胞表位。这些结果将有助于选择用于免疫监测和疫苗开发的肽。

图5：SARS-CoV-2免疫肽组学检测3

参考文章

1. Purcell AW, Ramarathinam SH, Ternette N. Mass spectrometry-based identification of MHC-bound peptides for immunopeptidomics. Nat Protoc. 2019;14(6):1687-1707. doi:10.1038/s41596-019-0133-y

2. Chiaro J, Antignani G, Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14(1):7056. Published 2023 Nov 3.

3. Weingarten-Gabbay S, Klaeger S, Sarkizova S, et al. Profiling SARS-CoV-2 HLA-I peptidome reveals T cell epitopes from out-of-frame ORFs. Cell. 2021;184(15):3962-3980.e17. doi:10.1016/j.cell.2021.05.046

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