P4 XLEAP-SBS已上市，聊一聊NextSeq™ 1000/2000平台的“焕新”

2024-04-01 13:11:56, 白熊同志 Illumina因美纳（中国）科学器材有限公司

自2003年人类基因组计划完成，生物科学研究正式进入基因组学时代。基因测序向着更大样本量、更多维基因组学分析方向发展，催生了一系列高通量（NGS）测序工具的诞生及升级。

自诞生以来，NGS因其通量高、准确度高等优势在科学研究和临床检测等领域展现出无与伦比的潜力，是目前最主流的测序技术。无论是在临床端的生殖遗传、肿瘤检测、微生物组学等，还是科研端的人类基因组、单细胞测序、蛋白组学、药物研发等领域，NGS技术都推动了更大规模、更多类型的研究进展。

其中，在全球范围内，应用最广泛的NGS技术路线是边合成边测序（SBS）技术。SBS彻底改变了传统测序方式，该技术由因美纳（Illumina）公司于2007年推出，以可逆终止子化学为基础，因能够提供高精确度、高产出的无错误读数，一经推出便迅速改变了测序技术的格局。基于SBS技术，因美纳推出了MiSeq、NovaSeq 6000、NextSeq 1000/2000等一系列平台，在提供优质测序数据的同时，也为研究者提供了更多选择。

作为基因组学领域的开拓者，因美纳一直在探索创新。2022年，因美纳革命性推出了XLEAP-SBS™化学技术，再次突破自己塑造的技术传奇。据了解，XLEAP-SBS化学技术专为更长的读长而设计，以标准SBS技术为基础，在速度、保真度和稳定性方面均有显著提升，与核苷酸结合速度可达原来的2倍，阻断物切割速度可达原来的2.5倍。同时，该化学技术在室温下可保持稳定，试剂实现常温运输，更具可持续性，能够为研究者提供稳定可靠的测序数据。XLEAP-SBS是因美纳迄今为止速度最快、数据质量最高、最可靠的测序化学技术。

令人欣喜的是，近日，因美纳发布了可应用于NextSeq 2000/2000-CN的新型P4 XLEAP-SBS试剂，为NextSeq 2000/2000-CN带来了全新升级，助力其成为因美纳迄今最大通量、最灵活的桌面式高通量测序仪。

NextSeq 1000/2000系列测序系统：更灵活的测序选择

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN测序系统（以下统称：NextSeq1000/2000系列测序系统）是因美纳重要的突破性产品，该测序平台上市之初，便是传奇的缔造者。

因美纳iSeq、Mini Seq和Miseq系列桌面式高通量测序仪为临床和科研较小规模的高通量测序提供了便捷、可及的测序选择，NovaSeq系列更适用于大规模测序的应用。而2020年发布的NextSeq1000/2000系列测序系统，则为广大科研工作者提供了更SMART（简便、灵活、准确、快速及科技突破）的选择，满足了“一台仪器承载更多测序类型”的期待。

最初，NextSeq1000/2000系列测序系统的推出，旨在推动更多核心实验室、中小型研究实验室和科研实验室使用SBS技术进行NGS测序。经典SBS化学测序技术，加上超高分辨率光学系统、超高密度纳米孔流动槽和机载DRAGEN基因组加速器，兼具了超高通量测序仪的稳定性，又保持了中低通量测序系统的高标准数据质量。

作为首个内置DRAGEN™ BIO-IT架构的测序平台，NextSeq1000/2000系列测序系统具有灵活的生信选项。尤其，本地机载DRAGEN二级分析为原始数据的拆分、整合和基因组分析提供了极大的灵活便利性。该系列测序系统中集成了多种DRAGEN生物信息学流程，适用于全外显子测序、靶向重测序、全转录组基因表达、基因融合检测、单细胞全转录测序、全基因组测序、DNA扩增子panel、靶向重测序等生信流程，使得数据分析变成可视化的一键流程操作，大大减少了对生信人员的依赖，降低了数据分析的壁垒。另外，由于本地化的流程兼具加速算法，NextSeq1000/2000系列测序系统不受云端空间、网速等因素影响，分析流程时间更可控，部分机载解决方案2小时内就能生成结果。

此外，NextSeq1000/2000系列测序系统采用干式系统设计，测序过程使用便捷的集成式卡盒，大大简化了文库上样的操作。由于试剂始终在卡盒内，不需要清洗仪器，简化了仪器维护并优化了仪器效率。

有趣的是，NextSeq1000/2000系列测序系统不仅是创新技术的集成者，也是完美设计的承载者。凭借优雅的外观轮廓和对光的卓越使用，NextSeq1000/2000系列测序系统在2021年获得全球工业设计顶级奖项“红点奖”，让生命科学的艺术感更加具象。

基于优越的性能，适配不同通量和测序场景的灵活性，连同优雅的外观设计，NextSeq1000/2000系列测序系统已成为众多科研机构和商业实验室的重要工具之一，目前全球装机数量已超过2150台，已助力多个领域取得突破性成果，发表文章数千篇，在全球范围内获得了用户的认可。

越南Gene Solutions公司的Giang Hoa博士是全球首批将NextSeq 2000平台引入实验室的科学家之一。借助NextSeq 2000平台更高的通量和更快的周转时间，Giang Hoa博士大大拓展了其实验室的研究范围，并绘制了首个越南结直肠癌患者的突变谱和致癌信号通路图谱。对于匈牙利塞麦尔维斯大学的Csaba Bodor博士而言，NextSeq 2000平台为其实验室带来了更高的测序通量，加速了研究成果的发表。利用NextSeq 2000平台，其团队分析了慢性淋巴细胞白血病用药前后基因突变变化；发现了胚系MUTYH 突变与高级别胶质瘤存在的潜在关联。

XLEAP-SBS助力NextSeq平台体验升级

纵然得到众多用户的认可，因美纳的创新升级之路并未缓步。

此次发布的P4 XLEAP-SBS试剂是首款可应用于桌面式测序仪的搭载XLEAP-SBS化学技术的新型试剂，适配于NextSeq 2000/2000-CN测序系统，支持SE50、PE50、PE100和PE150读长，单次最大测序数据量可达540Gb。

升级后，NextSeq1000/2000系列测序系统一跃成为因美纳所有桌面式测序仪中通量最高、单样本测序成本最低的测序系统，完成了从低、中通量向中高通量的跃迁。

1.更灵活的测序选择：

搭载XLEAP-SBS系列试剂，NextSeq1000/2000系列测序系统为多种测序应用提供了更宽阔平台。该系列具有四种流动槽类型（P1、P2、 P3 和 P4）和14 种试剂盒配置，可满足大部分项目的测序需求，用户可根据应用场景，选择合适的试剂。

2.为用户带来体验升级：

通量升级，更广数据量范围，更多应用场景：

P4 XLEAP-SBS试剂的上市为NextSeq1000/2000系列测序系统带来了50%的通量提升，研究者可以通过一台测序仪完成更多的项目，无疑大大拓展了测序仪的使用场景。

速度升级，更短每循环耗时，更短测序时间：

单次测序时长至多缩短20%以上，使研究者能够在更短的时间内完成更多的样本测序，提高实验效率。

质量升级，更低碱基错误率，更优数据质量：

在PE150测序配置下，Q30可达≥90%，为用户带来更强有力的数据支持。

3.一体化工作流程，操作更友好：

NextSeq1000/2000系列测序系统的一体化流程设计，在实验室繁杂的操作中非常有优势。研究者可通过“配置选项”进行云端或本地生信分析，通过可视化的文字选择，完成复杂的生信分析流程，友好便捷的操作步骤使得生信分析环节更标准化。

P4 XLEAP-SBS试剂的高灵活性和可扩展性使得NextSeq1000/2000系列测序系统能够适应更多类型的研究和应用场景，可覆盖从微生物到大型基因组的测序应用，也是宏基因组学、空间转录组学、单细胞研究等研究领域的理想选择。

搭载升级后的XLEAP-SBS试剂，NextSeq1000/2000系列测序系统可提供更优的测序解决方案：单细胞测序表现提升50%，单次通量增加50%，单次检测细胞/样本数量也增加50%，在覆盖水平不变的情况下，帮助研究者获得更多单细胞的遗传信息；在靶向病原微生物检测时，使用新型P2 300循环试剂测序，一天内即可完成测序；在使用新型P3 300循环试剂时，测序时间可达到仅需40小时，相比标准SBS试剂的测序时长缩短了8小时，可节省研究者一个白天的工作时间；XLEAP-SBS试剂还可为免疫组库分析带来深度解析，在数据来源和样本组成都很复杂的情况下，仍能维持高度的测序准确性；在16SDNA测序中，34小时实现最多384个可用UMI检测，保证了测序过程中的错误校正，提高了数据的准确性。

除了此次上市的P4 XLEAP-SBS试剂，新型P1、P2和P3 XLEAP-SBS 试剂将于2024年第二季度上市，为实验室增加更多的测序方案选择，也为不同场景下的测序应用提供更多可能性。

参考文献：

1. https://www.illumina.com.cn/company/news-center/feature-articles/25-greatest-impacts-in-25-years--a-look-back-at-illumina-and-the.html

2. https://mp.weixin.qq.com/s/cIGaD2fOHApgQDF2NM9yUA

3. https://mp.weixin.qq.com/s/Us7PSWMNbf9JEBHf-RbV8A

4. https://mp.weixin.qq.com/s/rVgCC1-uqhpz6KMBj8UVUw

*本文转自测序中国公众号