2023-06-02 16:24:57, 赋能用户的 深圳华大智造科技有限公司
2023年3月10日,华大智造与翌圣生物科技(上海)股份有限公司(以下简称:翌圣生物)签署战略协议,双方在自动化建库设备、高通量测序建库试剂达成战略合作。
本文将逐一展示基于华大智造MGISP-960高通量样本制备系统的测评数据,来自翌圣生物的两款建库试剂盒:一步法DNA酶切建库试剂盒(Cat#12195)和新一代机械法建库试剂盒(Cat#13577)。
翌圣生物的新一代酶切法建库试剂盒Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V2 采用高质量的片段化酶,并将片段化模块与末端修复模块合二为一,不但简化了建库流程,而且极大地降低了建库时间和成本(图1)。
图1 一步法DNA酶切建库流程
在MGISP-960平台上使用翌圣生物的一步法DNA酶切建库试剂盒(Cat#12195),搭配对应的长接头和短接头分别进行自动化建库,同时开展手工建库。
自动化文库产出为手工文库产出的90%以上,满足后续测序需求;且基于翌圣生物的一步法DNA酶切建库试剂盒,文库产出波动控制在6%以内(最大CV值为6%),与手工文库均有稳定的产出(表1,图2(a)(b))。
图2(a) 一步法DNA酶切建库试剂盒(长接头建库)基于MGISP-960的自动化及手工建库的文库产出
图2(b) 一步法DNA酶切建库试剂盒(短接头建库)基于MGISP-960的自动化及手工建库的文库产出
基于MGISP-960平台,同一样本搭配对应的长接头进行自动化建库,在不同酶切时间的条件下,文库产出波动控制在8%以内(最大CV值为8%)(表2),文库峰图高度重合(图3(a)(b)(c))。
图3(a)同一样本酶切10min的文库产出及峰图
图3(b)同一样本酶切15min的文库产出及峰图
图3(c)同一样本酶切20min的文库产出及峰图
测评方案
Hieff NGS® DNA Library Prep Kit(Cat#13577)是翌圣生物专业开发设计的新一代机械法建库试剂盒,在前一代建库试剂盒的基础上,改进了DNA片段末端修复和加A效率,同时采用新型的高保真酶,助力获得优异的测序数据(图4)。
图4 机械法DNA建库流程
在MGISP-960平台上使用翌圣生物新一代机械法建库试剂盒(Cat#13577),搭配对应的长接头和短接头分别进行自动化建库,同时开展手工建库。
图5(a) 机械法建库试剂盒(长接头建库)基于MGISP-960的自动化及手工建库的文库产出及峰图
图5(b) 机械法建库试剂盒(短接头建库)基于MGISP-960的自动化及手工建库的文库产出及峰图
翌圣生物的一步法DNA酶切建库试剂盒和机械法建库试剂盒均能良好适配于MGISP-960自动化平台,且自动化建库有着效率高,数据表现稳定的优点。作为开放性的建库设备,MGISP系列可适配不同类型的第三方建库试剂,为大规模的科研应用提供便捷的一站式实验平台。
>>适配自动化产品清单
翌圣生物科技(上海)股份有限公司是一家聚焦生命科学产业链上游核心原料,从事分子、蛋白和细胞三大品类生物试剂的研发、生产与销售的高新技术企业。翌圣生物坚持前瞻性技术研发和市场需求导向双轮驱动研发模式,依托自主研发建立了ZymeEditorTM 双向分子酶理性设计与定向进化平台、蛋白高密度发酵与超洁净纯化平台、分子诊断试剂关键原料研发平台、高通量测序建库试剂创新研发平台、高性能单克隆抗体研发平台和mRNA医药应用研发平台六大核心技术平台,集成了20项核心技术。核心产品覆盖qPCR系列、NGS系列、逆转录系列、核酸提取与纯化系列、PCR系列、分子克隆系列、体外转录系列、抗体、蛋白纯化系列、蛋白分析系列、重组蛋白、细胞分析系列、细胞培养系列、细胞转染系列、报告基因检测系列等多个品类,广泛应用于生命科学研究、诊断检测和生物医药等领域。
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