应用分享 | MaxPeak Premier 色谱柱分析寡核苷酸药物

2023-05-31 20:17:24, 沃特世 沃特世科技(上海)有限公司



自沃特世将MaxPeak HPS技术从样品瓶/板扩展到色谱柱领域以来,该技术已为寡核苷酸、多肽等生物大分子分析带来了新的机遇。采用MaxPeak HPS技术的QuanRecovery样品瓶与样品板,有助于减少样品在制备阶段的非特异性吸附;采用MaxPeak HPS技术的Premier系列色谱柱,能有效屏蔽酸性化合物与金属之间的相互作用力,改善化合物的峰形与灵敏度,从而提高数据的稳定性、重现性。对于含磷酸骨架的寡核苷酸,Premier色谱柱改善效果显著,新成员Premier OST BEH C18 300Å更是锦上添花,能满足核酸分析更多需求。今天,就让我们一起回顾Premier系列色谱柱在寡核苷酸药物的经典应用。

       


寡核苷酸杂质分析

对于21-nt的寡聚物,分子中很大⼀部分(19个核苷)包含经修饰的核碱基,使用Premier OST BEH C18 (1.7 μm 2.1*100 mm)进行分析,无需钝化色谱柱就可以分析出14种杂质,连续进样结果稳定,LC-MS分析为经过修饰的寡核苷酸及其杂质的完整质量数确认,并提供了良好的质量精度(优于15 ppm),LC-UV分析可测量低⾄0.2%相对丰度水平的所有样品组分,详细内容可参考720007301ZH

 图1. 21-nt样品中寡核苷酸杂质分离结果的TUV⾊谱图。

表1. 在经过大量修饰的21 mer 寡核苷酸中鉴定出的14种寡核苷酸杂质。



siRNA分析

siRNA分子较短(约20~25个碱基对),经化学修饰的RNA双链体能够在体内调节蛋白质表达。siRNA可在变性条件下将双链体转化为两个互补的寡核苷酸分析,也可以在非变性条件下以完整双链体形式分析。图2为两种siRNA在非变性条件下的分析,详细内容可参考720007361ZH

图2. 单链和双链体siRNA成分的IP-RP LC保留研究。



sgRNA的分析

基因编辑在临床前和临床试验中取得了显著成功,基因编辑需要sgRNA将基因编辑酶引导到准确的位置,单个sgRNA长度通常在100 mer,并且也可被修饰。使用Premier OST BEH C18 300Å (1.7μm 2.1*100mm)色谱柱分离出sgRNA并对其序列确认,详细内容可参考720007897en

图3. 离子对反相色谱法分析10 pmol 质量的完整sgRNA。



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