4月新发客户文献——本期热点『代谢/疾病/肿瘤/免疫/信号通路』

2023-05-19 21:15:42, 冯朋飞 上海吉凯基因医学科技股份有限公司


2023年,使用吉凯基因的产品/服务发表的文献700+篇。历年累计20000+篇!


此次小编精心挑选了10篇4月新发的高质量文章供大家欣赏,恭喜以下研究团队!同时也希望在2023年给您的科研计划提供一些思路和灵感,快来一睹为快吧!


往期回顾

2022年10月新发客户文献——本期热点『肿瘤/损伤/细胞癌/自噬』

2022年11月新发客户文献——本期热点『损伤/稳态/肿瘤/凋亡』

2022年12月新发客户文献——本期热点『肝纤维化/损伤/免疫逃逸/肿瘤』

2023年1月新发客户文献——本期热点『肠道稳态/血管修复/肿瘤/自噬』

2023年2月新发客户文献——本期热点『肿瘤/代谢/免疫/糖尿病』

2023年3月新发客户文献——本期热点『脂肪肝/外泌体/肿瘤/免疫』

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OTUB1通过稳定FGFR2促进成骨细胞骨形成


OTUB1 promotes osteoblastic bone formation through stabilizing FGFR2

发表期刊:Signal Transduction and Targeted Therapy

IF:38.104

发表单位:国家蛋白质科学中心(北京)

吉凯助力:Fgfr2/OTUB1 过表达腺相关病毒


文章摘要:骨稳态是通过成骨细胞骨形成和破骨细胞骨吸收之间的平衡来维持的。这一过程的失调会导致多种疾病,包括骨质疏松症。然而,其潜在的分子机制尚未完全了解。在这里,作者发现去泛素酶Otub1的整体和条件成骨细胞敲除导致成骨分化和骨化缺陷导致的骨量低和骨强度差。在机制上,FGFR2的成骨机制的稳定性是由OTUB1维持的。OTUB1通过抑制SMURF1的E2结合来减弱E3连接酶SMURF1介导的FGFR2泛素化。在没有OTUB1的情况下,FGFR2被SMURF1过度泛素化,随后被溶酶体降解。同样,腺相关病毒血清型9(AAV9)在膝关节中传递的FGFR2挽救了成骨细胞特异性Otub1缺失小鼠的骨量损失。此外,骨质疏松小鼠骨骼中Otub1 mRNA水平显著下调,在卵巢切除诱导的骨质疏松小鼠中,通过aav9传递系统恢复Otub1水平可减轻骨质减少。综上所述,这些研究结果表明,OTUB1通过控制FGFR2的稳定性,正向调控骨稳态中的成骨分化和矿化,这为缓解骨质疏松症提供了一种光学治疗策略。


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FOXI3致病性变体导致一种形式的颅面短小症


FOXI3 pathogenic variants cause one form of craniofacial microsomia

发表期刊:Nature Communications

IF: 17.694

发表单位:北京航空航天大学医学科学与工程学院

吉凯助力:FOXI3 过表达质粒


文章摘要:颅面短小症(CFM;也被称为金氏综合征),是一种颅面发育障碍,具有不同的表达性和严重程度,并有一系列可识别的异常。这些出生缺陷与来自第一和第二咽弓的结构有关,可单侧发生,包括耳发育不良、小耳畸形、耳前标记和凹坑、面部不对称和其他畸形。其遗传模式是有争议的,而该综合征的分子病因学在很大程度上是未知的。作者共对670例属于欧洲和中国血统的CFM患者进行了调查。在FOXI3的21个先证者(3.1%)中发现了18个可能的致病变异。对可能致病性FOXI3变异的转录活性和亚细胞定位的生化实验和敲入小鼠研究强烈支持FOXI3参与CFM。研究结果表明,常染色体显性遗传,外显率降低,和/或常染色体隐性遗传。FOXI3变异体的表型表达是可变的。由于受影响个体中大量可能的可能致病变异的外显率降低,因此受影响的这类变异遗传自未受影响的父母。在这里,作者提供了提示性证据,表明FOXI3等位基因与致病变异的共同变异可以改变表型的严重程度,并解释不完全外显率。


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CircTmeff1通过与TDP-43相互作用并编码一种新的TMEFF1-339aa蛋白促进肌肉萎缩


CircTmeff1 Promotes Muscle Atrophy by Interacting with TDP-43 and Encoding A Novel TMEFF1-339aa Protein

发表期刊:Advanced Science

IF: 17.521

发表单位:南通市第六人民医院

吉凯助力质谱分析


文章摘要:骨骼肌萎缩是许多急慢性疾病的常见临床特征。环状RNA(circRNAs)是一种共价闭合的RNA转录本,参与各种生理和病理过程,但它们在肌肉萎缩中的作用尚不清楚。环状rna表达谱分析表明环状rna参与了肌肉萎缩的病理生理过程。circTmeff1被认为是影响肌肉萎缩的潜在circRNA候选基因。进一步发现,circTmeff1在体内和体外的多种类型的肌肉萎缩中高表达。此外,circTmeff1的过表达在体内和体外都会引发肌肉萎缩,而下调circTmeff1的表达可以挽救体内和体内的肌肉萎缩。特别是,在既定的萎缩环境下,下调circTmeff1的表达部分挽救了小鼠的肌肉质量。在机制上,circTmeff1直接与TARDNA结合蛋白43(TDP-43)相互作用,促进TDP-43在线粒体中的聚集,从而触发线粒体DNA(mtDNA)释放到细胞质中,并激活环状GMP-AMP合酶(cGAS)/干扰素基因刺激因子(STING)通路。出乎意料的是,TMEFF1-339aa被鉴定为一种由circTmeff1编码的新蛋白,介导其促萎缩作用。总的来说,抑制circTmeff1代表了一种治疗多种类型骨骼肌萎缩的新方法。


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红细胞膜包裹的纳米管治疗系统在阿尔茨海默病靶向免疫调节中的作用研究


Study on the Role of an Erythrocyte Membrane-Coated Nanotheranostic System in Targeted Immune Regulation of Alzheimer''s Disease

发表期刊:Nature Communications

IF: 17.694

发表单位:中南大学湘雅第三医院

吉凯助力:CD22/TfR-A/AAP 过表达质粒


文章摘要:阿尔茨海默病(AD)是老年人群中最常见的神经退行性疾病之一。尽管AD的病理生物学研究取得了重大进展,但仍并没有有效的治疗方法。在这里,建立了一种用转铁蛋白受体适体修饰的红细胞膜伪装纳米药物递送系统(TR-ZRA),该系统可以靶向穿过血脑屏障,以改善AD免疫环境。基于金属有机框架(Zn-CA),TR-ZRA负载CD22shRNA质粒,以沉默衰老小胶质细胞中异常高表达的分子CD22。最重要的是,TR-ZRA可以增强小胶质细胞吞噬Aβ的能力,缓解补体激活,从而促进AD大脑中的神经元活动,降低炎症水平。此外,TR-ZRA还负载了Aβ适体,这使得能够在体外快速、低成本地监测Aβ斑块。用TR-ZRA治疗后,AD小鼠的学习和记忆能力增强。总之,本研究中的仿生递送纳米系统TR-ZRA为AD治疗提供了一种有前途的策略和新的免疫靶点。


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肿瘤相关巨噬细胞衍生的外泌体LINC01232通过降低表面MHC-I的表达诱导胶质瘤的免疫逃逸


Tumor-Associated Macrophage-Derived Exosomal LINC01232 Induces the Immune Escape in Glioma by Decreasing Surface MHC-I Expression

发表期刊:Nature Communications

IF: 17.694

发表单位:华中科技大学同济医学院协和医院

吉凯助力:NBR1/E2F2 干扰质粒


文章摘要:肿瘤相关巨噬细胞(TAM)浸润促进了胶质瘤的恶性,但其潜在机制尚不清楚。本文报道了TAMs分泌外泌体LINC01232以诱导肿瘤免疫逃逸。从机制上讲,发现LINC01232直接结合E2F2并促进E2F2进入细胞核,两者协同促进NBR1的转录。NBR1结合和泛素化MHC-I蛋白之间通过泛素结构域的结合增加,导致MHC-I在自噬溶酶体中的降解增加,肿瘤细胞表面MHC-I的表达减少,这反过来导致肿瘤细胞逃避CD8+CTL免疫攻击。用shRNA破坏E2F2/NBR1/MHC-I信号传导或用相应抗体阻断在很大程度上消除了LINC01232的肿瘤支持作用,并抑制了M2型巨噬细胞驱动的肿瘤生长。重要的是,LINC01232的敲除增强了肿瘤细胞表面MHC-I的表达,并改善了对CD8+T细胞再灌注的反应。本研究揭示了TAMs和神经胶质瘤之间存在的关键分子串扰通过LINC01232/E2F2/NBR1/MHC-I轴介导,以支持恶性肿瘤的生长,表明靶向该轴可能具有治疗潜力。


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细胞质YAP1介导的ESCRT-III组装促进细胞自噬死亡,并在乳腺癌中被NEDD4L泛素化


Cytoplasmic YAP1-mediated ESCRT-III assembly promotes autophagic cell death and is ubiquitinated by NEDD4L in breast cancer

发表期刊:Cancer Communications

IF: 15.283

发表单位:哈尔滨医科大学肿瘤医院

吉凯助力:YAP1 过表达质粒


文章摘要:核yes1相关转录调控因子(YAP1)促进肿瘤进展。然而,细胞质YAP1在乳腺癌细胞中的作用及其对乳腺癌患者生存的影响尚不清楚。研究旨在探讨细胞质YAP1在乳腺癌细胞中的生物学功能,以及细胞质YAP1作为乳腺癌生存的预测标志物的可能性。研究发现,YAP1主要表达于乳腺癌症细胞的细胞质中。细胞质YAP1促进乳腺癌症细胞的自噬性死亡。细胞质YAP1与ESCRT-III复合物亚基结合,携带多泡体蛋白2B(CHMP2B)和液泡蛋白分选4同源物B(VPS4B),促进CHMP2B-VPS4B的组装并激活自噬体的形成。EGCG将YAP1保留在细胞质中,促进CHMP2B-VPS4B的组装,从而促进乳腺癌症细胞的自噬死亡。YAP1与NEDD4L结合,以及NEDD4L-介导的YAP1的泛素化和降解。乳腺组织微阵列显示,高水平的细胞质YAP1有利于癌症患者的生存。细胞质YAP1通过促进ESCRT-III复合物的组装来介导乳腺癌细胞的自噬死亡;此外,作者建立了一个新的基于细胞质YAP1表达的乳腺癌生存预测模型。


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M2巨噬细胞中的YY1复合物通过上调IL-6促进前列腺癌症进展


YY1 complex in M2 macrophage promotes prostate cancer progression by upregulating IL-6


发表期刊:Journal for ImmunoTherapy of Cancer

IF: 12.469

发表单位:东南大学附属中大医院

吉凯助力:YY1 过表达慢病毒/质粒


文章摘要:肿瘤相关巨噬细胞主要极化为M2表型,通过分泌多种细胞因子重塑肿瘤微环境,促进肿瘤进展。YY1在前列腺癌的M2巨噬细胞中高表达,并与较差的临床预后相关。在过表达YY1的转基因小鼠中,肿瘤浸润的M2巨噬细胞比例增加。相反,抗肿瘤T淋巴细胞的增殖和活性受到抑制。使用M2靶向肽修饰脂质体载体靶向YY1治疗M2巨噬细胞,抑制PCa细胞肺转移,并与PD-1阻断产生协同抗肿瘤作用。IL-4/STAT6通路调控YY1,YY1通过上调IL-6来增加巨噬细胞诱导的PCa进展。此外,通过在M2巨噬细胞和THP-1中进行H3K27ac-ChIP-seq,作者发现在M2巨噬细胞极化过程中获得了数千个增强子,这些M2特异性增强子在YY1 ChIP-seq信号中富集。此外,在M2巨噬细胞中,一个M2特异性的IL-6增强子通过与IL-6启动子的长链染色质相互作用来上调IL-6的表达。在M2巨噬细胞极化过程中,YY1形成了一个LLPS,其中p300、p65和CEBPB作为转录辅助因子。M2巨噬细胞中YY1复合物的相分离通过促进IL-6增强子-启动子的相互作用而上调IL-6,从而增加PCa的进展。


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LncRNA KIAA0087通过介导SOCS1/JAK2/STAT3信号通路抑制骨肉瘤的进展


LncRNA KIAA0087 suppresses the progression of osteosarcoma by mediating the SOCS1/JAK2/STAT3 signaling pathway

发表期刊:Experimental and Molecular Medicin

IF: 12.153

发表单位:湖南师范大学第一附属医院

吉凯助力:KIAA0087  干扰慢病毒


文章摘要:在哺乳动物细胞中广泛表达的长链非编码RNA(lncRNA)在骨肉瘤(OS)的进展中发挥着关键作用。然而,lncRNA KIAA0087在OS中的详细分子机制仍不清楚。本文研究了KIAA0087在OS肿瘤发生中的作用。通过RT-qPCR检测KIAA0087和miR-411-3p水平。通过CCK-8、集落形成、流式细胞术、伤口愈合和跨孔试验测定来评估恶性特性。通过蛋白质印迹测定SOCS1、EMT和JAK2/STAT3通路相关蛋白水平。miR-411-3p和KIAA0087/SOCS1之间的直接结合通过双荧光素酶报告基因、RIP和FISH测定得到验证。在裸鼠体内评估生长和肺转移。通过免疫组织化学染色测定肿瘤组织中SOCS1、Ki-67、E-钙粘蛋白和N-钙粘蛋白的表达水平。在OS组织和细胞中发现KIAA0087和SOCS1的下调和miR-411-3p的上调。KIAA0087的低表达与低生存率相关。KIAA0087或miR-411-3p抑制的强制表达抑制了JAK2/STAT3通路的生长、迁移、侵袭、EMT和激活,并触发了OS细胞的凋亡。然而,KIAA0087敲低或miR-411-3p过表达却发现了相反的结果。机制实验表明,KIAA0087通过吸收miR-411-3p增强SOCS1的表达,使JAK2/STAT3途径失活。挽救实验显示,KIAA0087过表达或miR-411-3p抑制的抗肿瘤作用分别被miR-411-3p-模拟物或SOCS1抑制所抵消。最后,体内肿瘤生长和肺转移在KIAA0087过表达或miR-411-3p抑制的OS细胞中受到抑制。总之,KIAA0087的下调通过靶向miR-411-3p介导的SOCS1/JAK2/STAT3途径促进OS的生长、转移和EMT。


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幽门螺杆菌诱导的GNB4异常去甲基化和表达通过Hippo–YAP1途径促进胃癌发生


Helicobacter pylori-induced aberrant demethylation and expression of GNB4 promotes gastric carcinogenesis via the Hippo–YAP1 pathway

发表期刊:BMC Medicine

IF: 11.15

发表单位:山东第一医科大学附属省立医院

吉凯助力:GNB4 干扰慢病毒


文章摘要:幽门螺杆菌(H.pylori)感染会导致异常的DNA甲基化,并增加癌症(GC)的风险。鸟嘌呤核苷酸结合蛋白亚单位β-4(GNB4)参与各种致瘤过程。作者在之前的研究发现幽门螺杆菌诱导的GC中GNB4的甲基化水平异常;然而,人们对其表达和潜在的分子机制知之甚少。GNB4在胃癌中的表达显著上调,并与侵袭性临床特征和不良预后相关。GNB4水平升高与生存时间缩短有关。幽门螺杆菌菌株26695和SS1的感染在GC细胞系和小鼠中诱导了GNB4 mRNA和蛋白的表达。此外,GNB4的沉默阻断了幽门螺杆菌在GC细胞中的促增殖、转移和侵袭能力。幽门螺杆菌感染显著降低了GNB4启动子区的甲基化水平,特别是在CpG#5位点(chr3:179451746–179451745)。幽门螺杆菌感染通过激活NF-κB上调TET1的表达。TET与经过去甲基化修饰的GNB4启动子区域结合。在功能上,作者发现GNB4在体外和体内模型中通过Hippo–YAP1途径诱导肿瘤的致癌行为。作者的研究结果表明,幽门螺杆菌感染激活NF-κB-TET1-GNB4去甲基化-YAP1轴,这可能是GC的潜在治疗靶点。


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S100钙结合蛋白A16通过触发CUL4A连接酶介导的LATS1泛素降解来抑制胶质瘤发展中的Hippo途径,从而促进细胞增殖


S100 Calcium Binding Protein A16 Promotes Cell Proliferation by triggering LATS1 ubiquitin degradation mediated by CUL4A ligase to inhibit Hippo pathway in Glioma development

发表期刊:International Journal of Biological Sciences

IF: 10.75

发表单位:南京医科大学第一附属医院

吉凯助力:S100A16  干扰慢病毒


文章摘要:S100钙结合蛋白A16(S100A16)是S100蛋白家族的一个新成员,与肿瘤发生过程有关,并在中枢神经系统组织中大量表达。研究旨在探讨S100A16在神经胶质瘤进展中的生物学功能和可能的机制。此研究首次发现S100A16在神经胶质瘤中明显上调,且S100A16水平较高的患者生存时间较短。S100A16过表达促进了神经胶质瘤细胞的增殖、侵袭和迁移,以及裸鼠肿瘤的形成。重要的是,作者发现S100A16是Hippo通路的负调控因子,它可以降低LATS1的表达水平,促进YAP核输入,并启动下游靶基因CYR61和CTGF。此外,研究数据显示,S100A16通过诱导CUL4A介导的LATS1泛素化降解,使LATS1蛋白不稳定。通过促进CUL4A介导的LATS1泛素化来抑制Hippo信号通路,证明了S100A16在神经胶质瘤进展机制中的重要生物学作用。S100A16可能是神经胶质瘤患者的一种新的生物标志物和治疗选择。


1.实验技术干货

2.蛋白质组学研究

3.腺病毒简介及应用

4.临床基础研究思路解析    

5.组织特异性腺相关病毒

6.单细胞测序    

7.慢病毒实验操作指南

8.悬浮细胞专用病毒

9.靶点设计/数据库教程

10.测序技术研究与应用

11.非编码RNA研究技术与应用

12.腺相关病毒选择/应用    

13.表观遗传研究

14.文章解析

15.国自然课题设计思路解析

16.生物信息分析及工具      

17.外泌体研究    

18.肿瘤免疫研究

19.高分文章  

20.吉凯病毒神经方向应用案例 


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