贾辰熙研究员：精氨酸二甲基化靶向蛋白质组分析怎么做？｜WeOmics O-26

2023-04-07 00:27:29, 西湖欧米wOmics 西湖欧米（杭州）生物科技有限公司

“Westlake Proteomics Series” (WeOmics)系列研讨会 由The Proteomic Navigator of the Human Body (π-HuB) Project，CN-HUPO，西湖大学Guomics实验室，西湖实验室iMarker实验室共同举办，并由西湖欧米承办，SCIEX协办。

本期研讨会主题：mNeuCode 助力精氨酸二甲基化靶向蛋白质组分析

直播时间：2023年4月7日（周五）7:00-8:30 PM 北京时间7:00-8:30 AM EST

报告专家：

贾辰熙，Chenxi Jia

国家蛋白质科学中心（北京）研究员

讨论嘉宾：

李功玉，Gongyu Li

南开大学化学学院，研究员

常乘，Cheng Chang

国家蛋白质科学中心（北京），副研究员

张芳菲，Fangfei Zhang

西湖大学Guomics蛋白质组大数据实验室博士生

郭天南，Tiannan Guo，

西湖大学长聘副教授

西湖实验室 iMarker Lab 主任

西湖欧米创始人

介绍：

由于蛋白质精氨酸二甲基化往往发生在亚化学计量水平，其表征仍然存在重重困难。

为了能够对这些二甲基化位点进行靶向串联质谱 (MS/MS) 分析，我们在细胞培养过程中用稳定的同位素对甲基精氨酸进行代谢标记，在高分辨率 MS 扫描中产生一个包含 NeuCode 同位素特征的诊断峰，从而开发了 mNeuCode（甲基中子编码）标签。同时，我们也开发了一个叫做 NeuCodeFinder 的软件工具，用于筛选质谱中的 NeuCode 特征。

由此我们建立了一个用于发现整个蛋白质组的精氨酸二甲基化的靶向 MS/MS 工作流程。其功效和作用也通过鉴定 HeLa 细胞中 70 个蛋白质上的 176 个精氨酸二甲基化位点得到了证明。

其中，38% 的位点和 29% 的二甲基化蛋白质是新鉴定的，包括蛋白质 FAM98A 上的五个新精氨酸二甲基化位点，该蛋白质是蛋白质精氨酸甲基转移酶 1 (PRMT1) 的底物。

我们的结果表明，HeLa 细胞中 FAM98A 的缺失抑制了细胞迁移，重要的是，二甲基化缺失突变也抑制了这一过程。因此，PRMT1-FAM98A 通路可能是通过 FAM98A 的这些新发现的二甲基化位点来介导细胞迁移的。

通过使用 NeuCode 助力的技术，我们可能会推动亚定量的生物分子研究方法的转变，即从基于鸟枪法的蛋白质组分析转变为靶向蛋白质组分析。