寡核苷酸中杂质的HPLC分析

2022-09-14 08:31:05 昭和电工科学仪器(上海)有限公司


核苷酸片段缺失体

反义核酸等核酸药物的开发和品质管理中,需要开发尽可能从合成的目标寡核酸中分离出杂质的方法。以下是使用聚合物基质HILIC色谱柱HILICpak VN-50 2D进行20mer的目标合成寡DNA和19mer (n-1)、18mer (n-2)、17mer (n-3)的核苷酸片段缺失体HPLC分析的应用实例。HILIC模式基本上亲水性越强保留时间越长,所以按照各合成寡DNA聚合度由低到高顺序洗脱。本实验条件不需要离子对试剂,也不需要在流动相中添加高浓度盐,适用于寡核酸的LC/MS分析。

Sample : Synthesized oligo-DNAs (crude), 1 μL
1. 20mer, ATACCGATTAAGCGAAGTTT
2. 20mer, ATACCGATTAAGCGAATTTT
3. 20mer, ATACCGATTAAGCTAATTTT
4. 20mer, ATACCGATTAATCTAATTTT

碱基序列差异

以下是使用聚合物基质HILIC色谱柱HILICpak VN-50 2D进行20mer的目标合成寡DNA和三种碱基序列差异(1,2,3处差异)合成寡DNA的HPLC分析的应用实例。导入不同类型的碱基会导致样品亲水性的变化,所以使用HILIC模式可以分离各种寡DNA。本实验条件不需要离子对试剂,也不需要在流动相中添加高浓度盐,适用于寡核酸的LC/MS分析。

Sample : Synthesized oligo-DNAs (crude), 1 μL
1. 20mer, ATACCGATTAAGCGAAGTTT
2. 20mer, ATACCGATTAAGCGAATTTT
3. 20mer, ATACCGATTAAGCTAATTTT
4. 20mer, ATACCGATTAATCTAATTTT

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