2022-08-09 15:30:52, APT-MKT 上海中科新生命生物科技有限公司
血液作为临床研究中重要的研究标本,具有易于采样、安全性高、蛋白分子含量丰富、可反映机体生理和病理状态等特点,在疾病早期诊断、预后指导等生物标志物研究方面具有重要的研究价值。随着质谱技术的发展,基于质谱的血液高通量蛋白质组学正逐渐成为研究血液蛋白质的强有力的技术方法,在肿瘤研究,免疫疾病,心血管代谢性疾病,生殖领域等均成为不可或缺的研究工具。近几年血液蛋白质组的发文数量也呈逐年上升的趋势。
但是血液由于其蛋白分布动态范围广(跨越10个数量级)、蛋白含量分布不均匀(高丰度占了绝大部分比例、低/超低丰度蛋白占比非常少),且质谱的灵敏度有限的原因(目前不做处理的质谱检测范围仍然高及中丰度蛋白为主),因此蛋白组学方法对血液蛋白,尤其是发挥功能性作用的低丰度蛋白的检测存在着极大的挑战性。
现中科新生命推出多维立体血液蛋白质组学方案:血液超大队列蛋白质组、血液外泌体蛋白质组、血液 N-糖肽蛋白质组以及靶向 OLink 蛋白质组,从蛋白、修饰、外泌体等多个研究维度提供全方位解决方案。今天主要讲的就是中科新生命推出的血液蛋白质组的新产品----深度血液4D-DIA蛋白质组。那这款产品是什么呢?主要的特色哪些呢?下面跟随小编一一揭晓。
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产品定义
深度血液4D-DIA蛋白质组是基于纳米颗粒特异性富集血液样本中低丰度蛋白的优势,并结合数据非依赖(DIA)采集方式实现对血液样本进行深度分析的组学技术。
实验流程图
02
产品特色
·高深度:2000+超高深度中低丰度蛋白鉴定
目前对于血液蛋白的深度质谱分析,主要方法是通过去血清高丰度和分级的方式,小样本规模可实现较高的深度鉴定,但是样本数量达到上百例后,对于实验流程和质谱上机的稳定性提出了更高的要求。对于既能满足鉴定深度又能兼顾大队列的稳定性的需要,一直是我们追求的方向。中科新生命新推出的深度血液4D-DIA蛋白组采用最新的富集方法+DIA全息扫描+ Spectronaut 16权威分析软件,实现了血液中低丰度蛋白的超高深度鉴定。
中科新生命内测数据如下所示,通过样本制备方法的优化、质谱方法以及数据分析全流程的全新升级,单个血液样本突破2000个蛋白的鉴定,最高鉴定数量已达3000+,多样本检测可达4000+的鉴定深度,大大提升了血液蛋白的检测深度,且低丰度蛋白的覆盖程度达到90%以上,非常适合临床研究中对于血液深度鉴定的需求。
每例血液样本的鉴定能力
鉴定能力统计及低丰度蛋白的覆盖率
· 中低丰度蛋白功能分布在神经、炎症、心血管等各大研究领域
除鉴定深度以外,大家一定对检测到的蛋白种类和功能感兴趣,中科新生命对检出的中低丰度蛋白参与的生物学KEGG通路进行分析,结果显示其覆盖了神经、心血管、炎症、肿瘤等各个领域的多种关键通路,因此无论您的样本是用于肿瘤领域标志物研究、慢性疾病的发病进程研究,或是感染性疾病、神经精神类疾病的研究等,深度血液4D-DIA蛋白组均可以实现无偏向性的血液蛋白的覆盖。
中低丰度蛋白功能分析
· 血液大队列研究优选方案:兼具超高稳定性、重复性与可靠性
中科新生命自推出DIA蛋白质组学产品以来,已助力客户发表多篇DIA 项目文章,且建立了从色谱、质谱、样本多维质控体系,保证结果的高稳定性和高重复性。深度血液4D-DIA蛋白质组也采用DIA全息扫描模式,同样具有超高的稳定性和重复性(DIA项目经验和客户文献见文末)。
中科新生命的实测数据显示,三次技术的定性重复性达90%,定量相关性达0.9,在色谱稳定性的评价中,多维度质控均达到了高标准的水平,进一步证实了结果的稳定性和可靠性。此外,深度血液4D-DIA蛋白质组与其他传统血液蛋白组学的方法比较分析,也显示出了其高稳定性的特色。如下图所示,深度血液4D-DIA可鉴定到传统去高丰度+DIA蛋白组的方法鉴定到的蛋白中高达86%的蛋白,证明了结果的稳定性和可靠性。
重复性和稳定性分析
人血浆蛋白质组官网收录了基于免疫分析、质谱蛋白组学和Olink蛋白组学检测到的人血浆蛋白,其中4072个蛋白来源于目前公开的质谱蛋白组学研究。中科新生命的深度血液4D-DIA蛋白质组数据与人血浆蛋白质组的数据的比对分析发现在鉴定到的蛋白中有高达82%的蛋白收录在人血浆蛋白质组中,证明了结果的可靠性。
可靠性分析
中科新生命至今已经完成了10000+样本的质谱检测,且样本类型涉及血液、动植物组织、外泌体等多种类型,项目经验丰富。现中科新生命助力发表多篇DIA文献,部分DIA客户文献请见下表。
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