直播回放 | 病原检测新技术及应用实践学术研讨会（第2期）

2022年6月以来南方省份进入流感高发期，流感病例数创近三年同期新高。江苏省疾病预防控制中心急性传染病防制所朱立国副所长首先介绍了流感的背景和流行特征，随后从人群季节性流感和人感染动物流感两方面回顾了国内外流感的分子流行病学现状和发展趋势。流感在新冠疫情暴发后保持极低流行状态较久，特别是H3已经近3年未流行，人群中预存的免疫力在逐渐消退。当前南方季节性流感处于优势循环株更迭期由B-Victoria向H3转变，随着气温的升高，预计近期流感活动水平会逐渐上升，南方流感疫苗接种率低的地区，存在扩散风险。

最后，朱所总结了流感防控的工作重点：

1、做好疫情监测，加强疫情报告。

2、加强医防结合，对疑似病例及不明原因发热病例尽快采样送检。

3、加强病原学监测，密切跟踪病毒变异情况。

4、推进源头管控，人病兽防，关口前移。

5、加强公众健康教育，提高自我防护意识。

新冠肺炎疫情加快了“医防融合”体系建设，公共卫生实验室基于宏基因组测序技术在应对突发、新发传染病疫情之外，如何为临床治疗场景提供技术支撑？上海市疾病预防控制中心病原所陈敏副所长介绍了其团队面对两起感染不明原因病原体的新冠重症病例时的应对策略。针对不明原因感染这一根本问题，需要采集不同样本类型，制定综合的检验策略，再利用不同方法的检验结果相互验证，结合临床信息逐步锁定病原体。最后，陈所从两个实践案例出发，分享了宏基因组测序在公共卫生实验室应用的思考和展望，宏基因组测序要进一步提升数据库的准确性、安全性，并结合临床信息和其他检测结果做出综合诊断决策。未来，除了为不明原因公共卫生事件提供线索、快速确认重症感染病原体之外，宏基因组测序技术还可以对环境生物因子进行监测，通过与其他人群监测数据匹配，来提供新的公共卫生监测工具。

对病源的及时准确追踪是疾病应对与控制的关键问题，大数据技术和方法能够增强对病源的跟踪与追溯能力，为有针对性地开展疫情防控提供技术支撑。中国科学院微生物研究所研究员胡松年老师详细介绍了本单位在病原微生物大数据资源整合与挖掘方向所做的工作，并就大数据分析在公共卫生应用中的挑战分享了自己的观点。针对明确的公共卫生应用目的，制定相应的病原微生物的大数据整合策略，从单独的组学分析，向菌株组学、时空、分型、耐药等综合信息的整合分析转变，最终建立平急一体的智慧化传染病防控大数据体系。其中，最大的挑战是样本收集标准的制定与执行、多维来源数据的整合，以及符合应用需求的个性化分析接口选择。数据标准不统一、来源复杂将影响数据利用效率，不同应用需求会影响整合数据分析的方向。这些问题需要一线公卫专家、临床专家与数据专家加强沟通，共同讨论解决之道。

全球范围内突发和新发传染性疾病威胁与日俱增，高通量测序在病原微生物检测监测方面具备独特的优势。华大智造生物技术高级经理王逸丛分享了宏基因组测序、靶向测序、全基因组测序在病原微生物领域的不同应用场景。宏基因组测序无需培养，可针对样本中所有的病原菌进行测序，适合在新发病原菌鉴定、暴发疫情调查、混合感染鉴定等场景使用。靶向测序针对感兴趣的病原体测序，适合对人群、环境中的新冠、流感等已知病原体进行基因组变异监测。华大智造针对新冠和流感的监测场景，推出从样本到报告的全流程靶向测序产品组合，采用ATOPlex靶向扩增技术，搭配自动化文库制备系统、多种可选通量的测序仪以及无缝衔接的数据处理系统，为用户提供简单、快速、便捷的使用体验。