2022-07-15 08:11:51, 欧易生物 上海欧易生物医学科技有限公司

背景知识介绍
根据特征数据丰度,如差异物种或生物标记物等,将数据拆分为训练集及验证集,先对训练集构建随机森林模型,再用此模型预测验证集,构建ROC曲线。
ROC曲线的横坐标是false positive rate(FPR),纵坐标是true positive rate(TPR)。用于展示构建的分类器模型在验证集上的表现,从而评估该模型的效能。
欧易云平台-ROC分析曲线
2.1 ROC分析曲线小工具。
将特征数据表文件(包括微生物丰度表,基因表达谱,临床数据表)结合分组文件,可以对单一特征或复合特征绘制对应的ROC曲线。可选择进行10折交叉验证,后对10折进行平均处理得最终ROC曲线。具体输入文件格式,请参考页面右侧的使用说明。
2.2绘图特征选择。
选择复合特征,则构建单个模型,该模型构建基于数据表中的全部特征,因此结果中含有单个ROC曲线。若选择单特征绘图,则针对数据表内每个特征构建模型,且绘制对应的ROC曲线。
2.3 其他常用参数选择。
用户可以自行选择是否进行10折交叉验证。同时提供了多种绘图相关参数,包括选择是否在ROC结果图中展示具体的AUC值。字体类型选择。若选择进行了10折交叉验证,则可选择在结果图上展示全部10折交叉验证结果与标准差。同时参考线与ROC曲线的颜色也支持用户自定义。
2.4 结果说明。
ROC曲线横坐标为假阳性率,纵坐标为真阳性率,蓝色曲线为10折后取的平均曲线,AUC为曲线下面积,阴影部分为上下1个标准差。AUC值越接近1代表模型效能越好。越接近于0.5,则代表该模型真实性较低,更趋近与随机分类。
猜你想看
END
排版人:小久
原创声明:本文由欧易生物(OEBIOTECH)学术团队报道,本文著作权归文章作者所有。欢迎个人转发及分享,未经作者的允许禁止转载。
点击“阅读全文” 收获更多精彩
04-10 小 M
产品试用 | 先试一下!MCE 类器官培养基,是谁还没→薅羊毛04-10 小 M
激酶家族:从分类到关键靶点,一文读懂!04-10 小 M
以象科技-高光谱采集系列 | 布料HL27053高光谱采集04-10 以象科技
特色技术 ︳燃烧离子色谱法助力工业纺织品中的可萃取有机氟(EOF)含量测定04-09 创新中心
聚焦应用,共话未来 I 岛津LabTotal事业部张家界技术交流会圆满落幕04-09 LabTotal事业部
岛津津智(LabTotal Smart)系列产品 | 溶剂效应消除器04-09 LabTotal事业部
岛津透射型衍射光栅闪亮登场04-09 经营企划部
重磅福利 | LCMS-80XX系列签约,送服务!04-09 LabTotal事业部
Peak微课堂 |告别氦气依赖,氢气方案如何引领未来?04-09 毕克气体
以象科技-高光谱采集系列 | 布料HL27119高光谱采集04-09 以象科技
CTO峰会群英荟2 | 吕圭源院长4月24日深度开讲:循证,让健康产品更有底气!04-08 Hunter
CTO峰会群英荟3 | 天丰生物段子卿博士:递送创新+科学循证,抗衰新思路!04-08 Hunter
圆满收官 | 高通量蛋白质组学与数据分析培训班【北大生科院站】04-08
材料研发|汇像带您迈入“AI+自动化”数字工厂新纪元04-08 汇像科技XImaging
邀请函|新品亮相,国仪量子与您相约第35届中国化学会年会04-08 CIQTEK
培训通知|波谱校园行首站启航!华南师范大学站即将开启04-08 CIQTEK
邀请函|新品亮相,国仪量子与您相约中国晶体学会第三届陶瓷青年学术会议暨晶态复合材料研讨会04-08 CIQTEK
展会预告 | 赛恩科仪受邀参与第十届全国磁性材料与器件大会04-08 赛恩科仪
【颗粒攻略】破解高粘粉末检测难题:LS13320XR精准解析锰酸锂粒径分布,助力电池性能跃升04-08 小贝


