干货 | UCSC数据库如何预测转录因子

2022-06-30 19:36:23, 标星关注 上海欧易生物医学科技有限公司



Step1:打开UCSC数据库


http://www.genome.ucsc.edu/



Step2:进入搜索页面:EZH2



Step3:点击EZH2基因






Step4:找到启动子位置和序列:



Step5:接下来调用JASPARS数据源




Step6:点击Connect,进行关联






分值越高,p值越小,越严格。即颜色越黑。



找到感兴趣转录因子后,进入JASPARS数据库,查找转录因子和基因的结合位置。



复制基因启动子序列信息。



以上就是预测转录因子并查找结合位点!


如有疑问,欢迎各位老师咨询!



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