高光时刻 | 活动仅10天！全新4D蛋白质组检测数量翻2倍价格仅需1/2

2022-06-29 04:02:20, 小迈武汉迈特维尔生物科技有限公司

前言

近年来，随着技术的不断进步，蛋白质组逐步从方法学研究进入到了实际应用阶段，并在包括精准医学在内的各个研究领域中大放异彩。然而蛋白质组学研究仍面临着巨大挑战，主要为扫描速度和灵敏度限制了蛋白质的检出。以DDA检测模式为例，在一次实验中共检测到101726个信号，仅17%信号可用于采集二级图谱，仅9.6%的信号可被鉴定出来。为应对蛋白质组学挑战，4D蛋白质组学技术应运而生，有效克服部分蛋白质组学研究困难问题，并大大提高生物样本中蛋白质的检出率。

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4D蛋白质组的扫描速度和灵敏度大大提高了蛋白质检出

为提供更好的蛋白质组学及多组学服务，迈维代谢斥资千万引进timsTOF Pro2仪器，并经过专业团队一年的创新蛋白质组实验方法研发，开发出领先的4D蛋白质组产品。

专业的研发团队

赵海义

迈维代谢蛋白质组学研发总监

拥有12年蛋白质组学相关技术经验和项目经验，精通蛋白质组学样本前处理、质谱检测及生信分析等各环节的技术原理和方法学。先后开发了蛋白质组学label-free定量算法和软件、修饰蛋白质组学（磷酸化、糖基化、乙酰化）、iTRAQ/TMT及DIA信息分析流程、4D-labelfree/DIA定量蛋白组实验流程及生信分析流程。参与过两届国际人类染色体蛋白质组计划（C-HPP），主导过多肽组、线粒体、叶绿体等特殊样本的蛋白质组前处理方法的开发。发表论文8篇，申请专利4项。从业以来，帮助客户完成了大量蛋白质组学相关课题项目，涵盖高校、科研单位和医院，囊括了从模式生物到普遍高等动植物到细菌、真菌和病毒等各种类型物种；涉及的样本类型从动物各类组织器官、各种细胞系、植物各类组织以及多种动物体液（血液、尿液、脑脊液、唾液、毒液等）到微生物菌体及病毒等约150类不同种类物种，帮助客户发表文献200余篇。

高质量4D蛋白质组数据

经过迈维代谢研发人员一年的努力，我们终于可以向各位老师交出一份满意的4D蛋白质组产品答卷，检测实力达行业顶尖水平，具体可看实际检测数据解析。

1.迈维4D蛋白组检测达国际领先实验室水平

经研发团队一年研发，迈维针对不同实验梯度对Hela细胞提取液进行4D蛋白质组学检测。使用4D-label free定量蛋白质组学技术，200ngHela细胞提取液60min检测梯度可鉴定蛋白质家族数量达6587种，高于Matthias Mann实验室4972种。使用4D-DIA定量蛋白质组学技术，200ngHela细胞提取液60min检测梯度可鉴定蛋白质家族数量达6623种，高于AlexeyI. Nesvizhskii实验室6525种。迈维代谢4D蛋白组检测水平已达国际领先实验室水平，具体检出参考下图。

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2.蛋白质检出数量多、样本检出稳定性高

除Hela细胞外，迈维代谢研发团队对多种生物样本进行了4D蛋白质组学检测，如293T细胞、大鼠肾脏、血清/血浆、油菜叶片、油菜根、油菜茎等，部分样本类型采用4D-labelfree定量蛋白组技术检出水平如下图。

由于样本类型差异，各样本采集到的二级谱图数量不同，采集到的二级谱图最高可达24万张，平均为19+万张，相比市面上其它蛋白质组学用到的仪器，timsTOF Pro2 采集到的二级谱图数明显增加，这得益于timsTOF Pro2卓越的灵敏度和扫描速度。

由于各样本采集到的二级谱图数量不同，因此各样本鉴定到的肽段数目有所差异，最高可达56381个肽段。各样本鉴定到的蛋白质Group均达到6000+水平，其中293T细胞和油菜茎的鉴定数超过了7000蛋白质Group，由此可见迈维代谢蛋白质检出数量稳定，更有效保证老师数据丰富性。

3.定性重复性高

为了评估定性结果的可重现性，我们分析了每种样品鉴定到的肽段和蛋白质中，同时被3个重复鉴定到、同时被2个重复鉴定到和只被一个重复鉴定到的肽段/蛋白数目占总肽段/蛋白数的比例，结果见下图。其中，每种样品在3个重复RUN中全部被鉴定到的蛋白占总蛋白比例平均值为85.84%，肽段的平均值为79.55%，显示了高度一致性，由此可见迈维4D蛋白组产品定性重复性高，更有利于老师数据挖掘。

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肽段和蛋白在1、2、3个技术重复RUN中鉴定到的数目占总数目的比例分布图

注：图例中PEP1s表示肽段层面仅在1个样品中被鉴定到，PRO1s表示蛋白层面仅在1个样品中被鉴定到，其它同理。BL：油菜叶片；BR：油菜根；BS：油菜茎；RK：大鼠肾脏。

4.定量稳定性高，可重现性高

我们对五种样本类型三次重复的4D-label free定量蛋白质组学数据进行皮尔逊相关性分析。结果表明重复样本间的定量值相关性非常好，皮尔森相关系数基本在0.97以上。

对蛋白定量值的变异系数分析，cv值平均小于20%的蛋白总蛋白的95%，整体的CV值较小，进一步说明定量结果具有极好的可重现性。

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各类样本蛋白定量值CV分布图

注：293T：293T细胞；BL：油菜叶片；BR：油菜根；BS：油菜茎；RK：大鼠肾脏。

通过皮尔逊相关性分析和变异系数分析可见，迈维4D蛋白质组学产品定量稳定性高，数据结果更可靠，重复性高，更有利于后期验证。

通过各项数据展示，相信老师也对迈维代谢4D蛋白质组学产品实力有所了解。总体而言，迈维代谢4D蛋白质组产品具有蛋白质检出数量多、样本检出稳定性高、定性重复性高、定量准确性高、定量稳定性高、可重现性高等优点，更好地保证蛋白质覆盖深度，实验数据可靠性。