2022-04-18 20:46:42, 小迈 武汉迈特维尔生物科技有限公司
前言
随着高通量测序技术的快速发展,人们对微生物的认知也在逐渐深入。微生物测序在环境、医学、农业、工业等各领域都有广泛应用,样本种类繁多,上到高山之巅的土壤,下到海洋深处的底泥,既能研究其对环境变化的影响,又可探究动物体内生理代谢的奥秘。常用的微生物检测手段主要是16S/ITS/18S扩增子测序和宏基因组测序,充足的样本量是保证测序质量的第一步。
微生物样本类型多样,主要包括:粪便、肠道内容物、拭子、瘤胃液、发酵液、组织液、冲洗液、组织、血浆、鲜奶、酸奶、土壤、污泥、沉积物、腐殖质、水体滤膜、空气滤膜、食品表面拭子、食糜等。不同的样本类型需要的样本量有区别,同一样本类型不同测序策略需要的样本量也有差异。
16S/ITS/18S扩增子测序所需样本量如下:
宏基因组测序所需样本量如下:
注:
(1)以上送样量为参考量,实际以提取结果为准;
(2)DNA样本需客户提供电泳图;
(3)PCR产物要经过纯化(如胶回收纯化),PCR产物需带有双端 Barcode序列,需客户提供电泳图;
(4)特殊样品,请联系公司技术人员协商送样量。
总 结
合格的样本是准确获取样本微生物组数据的保障,是实验和项目顺利完成的基础。以上是迈维代谢根据已有项目经验制定的微生物组样本要求,保障客户项目的顺利开展。
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