mNGS助力精准病原微生物诊断系列 — 最近的鹦鹉有点热

2021-11-10 10:37:49 Illumina因美纳（中国）科学器材有限公司

宏基因组病原微生物检测技术目前在临床诊疗中发挥的作用越来越受到重视，在疑难、危急重症、未知和罕见病原微生物感染领域发挥着不可替代的作用。因美纳期待通过“mNGS助力精准病原微生物诊断病例系列”，与您从一个个鲜明的病例中，共同直观地感受mNGS助力精准病原微生物诊断之优势。本期，我们将为您带来鹦鹉热相关话题。

近期，国内多地报告出现了一种关于鹦鹉热的病例，其中一条来自浙江丽水疾控的报道指出，自2021年9月上旬开始，丽水市中心医院和丽水市人民医院先后收治7例不明原因发热且发展至重症肺炎的患者，其中一例救治无效死亡，后经基因检测确诊鹦鹉热病例6例，临床诊断1例。

什么是鹦鹉热（Psittacosis）^[1]

又称鸟热，一种传染性疾病
病原体：鹦鹉热衣原体（Chlamydia Psittaci），球状、革兰氏阴性
传播：鸟类之间广泛传播，人类感染高危因素为鸟类接触史
临床表现：肺炎是最常见的表现；发热、头痛、肌肉痛、干咳等

特异性诊断方法

培养 – 培养技术难度高，且生物安全级别要求高，临床很少开展
血清学检测 – 干扰因素较多，早期假阴性高
实时聚合酶链反应 (PCR) – 国内尚未普及鹦鹉热衣原体的PCR检测

诊断延迟及其危害

由于缺乏特定的临床表现和影像学特征，鹦鹉热肺炎与由病毒、真菌和某些细菌（如军团菌）引起的社区获得性肺炎（CAP）具有许多共同特征，皆可表现为严重的头痛、高热、寒战、干咳和精神障碍，而我国既往缺少大规模临床病例，临床医生认识不足。数据显示，鹦鹉热衣原体肺炎占社区获得性肺炎的比例平均为1% ^[2]，但在入住重症监护室的重症肺炎患者中，比例高达8% ^[3]。

因美纳测序平台助力鹦鹉热

精准诊断之研究案例精选

案例1：COVID-19 大流行期间由鹦鹉热衣原体引起的非典型肺炎系列^[4]

本研究回顾性分析了32例经因美纳NextSeq测序平台mNGS诊断为鹦鹉热的患者数据。

所有患者均表现为非典型肺炎, 患者SARS-CoV-2 相关检测均为阴性。此外，常规培养肺泡灌洗液、外周血和痰液样本，进行针对常见呼吸道病原体的特异性IgM抗体、等温扩增试验和间接血清免疫荧光试验依旧为阴性。

以上方法因无法找到肺炎确切病因，故行mNGS检测，均发现鹦鹉热衣原体序列（表1）。所有患者在多西环素或基于多西环素的治疗后完全康复。

小结：mNGS 在32例鹦鹉热感染案例中快速、准确地检测到了病原信息，缩短了诊断时间并使临床及时启动了相应的抗菌药物治疗。

表1：32例mNGS检测结果

案例2：辅助诊断鹦鹉热重症肺炎和脑膜炎^[5]

患者女，54岁，反复头痛发热20 d，呼吸困难3 d来院就诊，具体发病及诊疗过程如下：

本案例中，尽管没有明确的鸟类或家禽接触史，两次外周血培养阴性亦为诊断带来了挑战，但通过mNGS 很快在 BALF 和 CSF 中检测到鹦鹉热，支持了临床诊断。

由以上两个案例不难发现，鹦鹉可以很“热”，和mNGS方法在临床的应用密不可分，而临床上类似的不明病因感染还有很多，究竟还有哪些病原是值得引起关注的？我们将在今后的系列中做更多揭秘和介绍。

参考文献

Infect Dis Clin North Am. 2010 Mar;24(1):7-25. doi: 10.1016/j.idc.2009.10.003.
Epidemiol Infect. 2017 Nov;145(15):3096-3105. doi: 10.1017/S0950268817002060.
Infect Dis Ther. 2020 Dec;9(4):1003-1015. doi: 10.1007/s40121-020-00353-y. Epub 2020 Nov 10.
Clin Surg. 2021 Aug;6: 3272.
BMC Infect Dis. 2021 Jun 30;21(1):621. doi: 10.1186/s12879-021-06205-5.