微课回顾 | MGISEQ-200焕新篇 · 全新升级

2021-03-01 12:27:29, 华大智造 深圳华大智造科技有限公司

在第五期智造微课中，性能大升级的MGISEQ-200线上亮相，引发了极为火爆的“大批围观”。聚焦升级版MGISEQ-200的性能特色、应用场景和抗疫表现，本期微课回顾为大家进行一一梳理。



MGISEQ-200升级亮点速览



01

通量更灵活

升级版MGISEQ-200通量愈显灵活。其中，大载片（FCL，有效reads数：500M）可满足批量样本集中交付，降低单样成本；小载片（FCS，有效reads数：75-100M）可实现紧急样本快速测序，降低开机成本。

02

速度更快

配备优化后的生化反应，MGISEQ-200为测序提速。其中，小载片测序（FCS，SE50）最快仅需6小时。面对ICU样本或突发疫情等情况时，升级版MGISEQ-200的优势更为明显，可在第一时间获取未知致病原检测结果。

03

读长更长

MGISEQ-200的大小载片（FCL/FCS）均支持PE150，数据量产出稳定，可以解锁更多应用，包括：靶向捕获/多重测序、RNA测序和WES测序等。

04

质量更高

经过结构化大数据训练的软件算法，升级版MGISEQ-200在碱基识别上更准确，配合优化后的生化试剂，能提供更高质量的数据。以人细胞系标准样本NA12878为例，使用MGISEQ-200 PE100读长进行测序，Read1 Q30≥90%，Read2 Q30≥85%以上，Mapping Rate、Duplication Rate、变异检出等性能均表现优秀。




适配更多应用，满足更多测序需求




从小型基因组测序、低深度全基因组测序，到靶向捕获和多重测序，从临床应用到科研应用，升级版MGISEQ-200测序仪“一机多能”，更有自动化整体解决方案加持，提供了丰富的日运行能力。


基于MGISEQ-200测序平台，华大智造提供自动化的整体解决方案，包括：自动化样本制备系统，高通量测序仪和生信分析加速器。整体解决方案基于同一套硬件系统，可拓展多种不同应用，不仅适配华大智造的整体方案，也支持第三方文库制备试剂盒和第三方分析软件。




MGISEQ-200助力抗疫，身手不凡




基于MGISEQ-200，某地疾控中心成功在两天内完成当地首例新冠病例样本的病毒基因鉴定和组装，第一时间获取了全长29.9Kb的病毒基因组序列，在战“疫”中充分展现了中国速度。


泰国疾控中心使用MGISEQ-200对疑似病例样本进行深度测序和精准检测，解决了低病毒载量下qPCR检测Ct值处于临界值的问题。


韩国科学家团队利用MGISEQ-200，对新冠病毒感染的Vero细胞总RNA进行了分析，并结合以往研究给出了新冠病毒转录组和表观转录组的高清图谱。


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FAQ精选
Q. 升级版的MGISEQ-200在PE100的读长下，要跑多长时间？
升级版MGISEQ-200在PE100读长下，有两种载片选择，小载片（FCS，PE100）的测序时间约为30小时，在样本量少的情况下，提供快速测序方案；大载片（FCL，PE100）测序时间约47小时，在样本量多的情况下，降低单样成本。

Q. 老客户升级后，MGISEQ-200的老版芯片（FC）还可以用吗？
升级后的MGISEQ-200兼容原有载片（FC，有效reads数：300M）及其试剂套装。但需要注意的是，自2020年3月起，原有版本的试剂套装将不再生产，相关技术支持将在最后售出的套装有效期内提供。


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