科研快讯 | MGISEQ-200助力新冠病毒转录组结构研究

2021-03-01 12:29:30, 华大智造 深圳华大智造科技有限公司

3月15日，韩国基础科学研究所 （IBS, Institute of Basic Science） RNA 研究中心联合国立首尔大学 （Seoul National University）和韩国疾病预防控制中心（Korea Centers for Disease Control & Prevention）利用华大智造DNBSEQ 技术联合 Nanopore 单分子测序技术，对新冠病毒感染的Vero细胞总RNA进行了分析，并结合以往研究给出了新冠病毒转录组和表观转录组的高清图谱。

图1 MGISEQ-200在韩国基础科学研究所

RNA研究中心


测序数据显示，华大智造 MGISEQ-200 平台的测序深度更高，相比单分子测序技术，可以对病毒基因组进行更高深度覆盖（图1-D），能够在更精细水平上研究基因组。


图2 不同平台测序数据分布及其基因组覆盖度
（其中图A和图B基于Nanopore平台，
图C和图D基于华大智造DNBSEQ平台）

此外，研究者还发现新冠病毒使用经典的 TRS（Transcription-Regulating Sequence，转录调控序列）介导的机制产生大部分sgRNA（subgenomic RNA，亚基因组RNA）（图2-D），但同时发现了很多与TRS介导的重组不同的非经典重组事件 (图2-E, 2-F, 2-G)。

图3 新冠病毒的经典重组与非经典重组位点

作为国产测序平台之一，MGISEQ-200以其小巧、灵活、应用广泛的特点，在本次抗疫工作中表现不俗，不仅在疫情早期助力疾控单位完成新冠病毒全长组装，而且还在后续的科学研究中发挥了重要作用。

图4 MGISEQ-200

目前华大智造正在进行 MGISEQ-200 升级工作，能更加灵活地满足快检应用和科研应用的需要，将从之前唯一的测序载片 FC（300M）升级为FCL（500M）和 FCS（100M），继续为新冠病毒后续的科学研究提供更多助力。

【注：MGISEQ-200已在海外部分国家和地区更名为DNBSEQ-G50】



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