#连载02#说说二代测序样品制备自动化

2018-11-10 14:51:39 安捷伦科技(中国)有限公司


又是一周混乱日……呃,好吧,跳过吐槽、跳过导入语,继第一期之后,继续来唠二代测序样本前处理的自动化!

先来回顾一下上一期的内容,小安在第一期给各位客官讲了实验室流程,还配有真相视频,当然也附上了安捷伦已开发好方法,并实验验证过方法的试剂盒名单(回想中……仍然一头雾水?哎呦,直接查看历史消息啦,518日!)

切入正题,本期小安将会介绍 SureSelectXT 的操作界面,让您1分钟轻松学会使用,此外还会列举一大波成功案例供大家查阅,看自动化平台 Bravo 是如何让您的实验室获得成功的~~~

1.操作界面 --- 1分钟学会使用


请用你萌的双手告诉我,如此清新简约的画风你萌感受到了吗!没错,就这张门脸,控制样品制备从建库到片段捕获的各个环节。只需选择实验名称、样品数量、就可以点开始了,对就是那个“Run”。(小安按:样品和试剂还是需要准备好放到仪器上的哦)你,学会了吗[微笑]

2.一大波成功案例正在靠近 --- 踩在巨人的肩上,做最放心的选择

小安毫(mo)不(zhe)夸(liang)张(xin)地说,小安家的自动化平台Bravo是目前世界上用户最多,口碑最好的二代测序样品自动化制备平台。谷歌一下,你就知道:

[1]MassivelyParallel Single-Cell RNA-Seq for Marker-Free Decomposition of Tissues into CellTypes.
Jaitin et al, Science 343, 776 (2014); DOI: 10.1126/science.1247651

http://www.sciencemag.org/content/suppl/2014/02/12/343.6172.776.DC1/Jaitin-SM.pdf(补充材料,可直接拷贝链接到您的浏览器中浏览)

WeizmannInstitute的研究者于2014年发表在Science上的成果,其中采用Bravo做高通量单细胞RNA-Seq建库

[2] The GeneticLandscape of Clinical Resistance to RAF Inhibition in Metastatic Melanoma.
Wagle et al. Cancer Discovery January 2014 4; 94

HarvardMedical SchoolBroad Institute of MIT andHarvard等单位的研究者2014年发表成果于Cancer Discovery,其中文库构建过程中采用Bravo自动化平台。

[3] AHT-ChIP-seq:a completely automated robotic protocol for high-throughput chromatinimmunoprecipitation.
Sarah Aldridge et al. Genome Biology 2013, 14:R124doi:10.1186/gb-2013-14-11-r124

文中作者用Bravo完成high-throughput (AHT) ChIP-seq方法开发,得到极高的质量和浓度上的重现性。

[4] Advancinggenetic testing for deafness with genomic technology.
Shearer AE, Black-Ziegelbein EA, Hildebrand MS, et al. J Med Genet2013;50:627–634

Universityof Iowa Hospitals and Clinics的研究者于2013发表在JMed Genet,其中采用Bravo做文库构建。

[5] Pre-capturemultiplexing improves efficiency and cost-effectiveness of targeted genomicenrichment.
Shearer et al. BMC Genomics 2012, 13:618

University of IowaCarver College of Medicin的研究者于2012年发表在BMCGenomics。其中用Bravo做建库和捕获。

今天暂时到这里吧,这里面有没有您的一道菜呢?

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