寡核苷酸合成案例分享 - 80nt长链固相合成

2026-04-20 11:01:03 苏州英赛斯智能科技有限公司(Inscinstech Co., Ltd.)


小核酸药物(包括siRNA、ASO等)作为继小分子和抗体药之后的第三代前沿疗法,正快速引领精准医疗的革命浪潮。长链DNA/RNA是核酸药物研发的核心支撑,广泛应用于小核酸药物本身合成、基因编辑工具(如CRISPR-Cas9向导RNA)、病毒递送载体构建,同时在靶点验证、候选药筛选及规模化生产中不可或缺,其质量直接决定研发效率与产品安全性,凸显了合成长链序列的必要性,然而,其研发与规模化生产的核心瓶颈之一,在于如何高效、经济地获取高质量的长链DNA原料。这一合成技术是制备基因编辑工具、病毒载体及核酸药物本身的起点,其通量、长度与成本直接决定了候选药物的筛选速度与最终疗法的可及性。合成长链序列的挑战主要源于三方面:一是工艺上,长链合成需多步串联反应,偶联、脱保护效率的累积误差会降低产物纯度,链越长,杂质(缺失碱基、错配序列)越多,纯化难度呈指数级上升;二是序列组成上,高GC含量、重复序列或特殊修饰碱基易形成稳定二级结构,阻碍合成并增加纯化难度;三是设备稳定性上,长链合成对设备精度和反应环境控制要求极高,温度、湿度等微小波动会导致产物批次差异,难以满足规模化生产的一致性要求。

据权威市场分析报告预测,全球小核酸药物市场正以超过30%的年复合增长率高速扩张,预计到2030年,市场规模将突破250亿美元。这一广阔前景,对上游关键原料与工艺提出了前所未有的需求与挑战。


在此这一背景下,英赛斯核酸合成仪平台通过持续优化自动化合成循环,在确保高精度与高纯度的同时,不断突破单通道核酸合成仪在合成长度与规模效益上的极限。凭借它以出色的稳定性和可放大性,构建起从小试探索到商业化生产的坚实桥梁,为小核酸药物的产业化进程之路提供了不可或缺的规模化支撑基础。




80nt长链合成工艺

    NestoOligo 100是一台灵活直观的全自动寡核苷酸合成仪,全系列产品覆盖从50umol-9mmol核酸样品的快速合成。采用高精度计量泵驱动系统,流过式固相合成技术显著降低试剂消耗量,确保对反应速度和接触时间的精确控制。设备合成效率高,便于线性放大,  从而获得高成本效益及高质量的合成结果。

合成序列:

ATCC.........CCCC(80nt)

MW:24700 g/mol

合成工艺简述

本工艺采用 NestoOligo 100核酸合成仪进行核酸合成,以CPG为固相载体,单体投料量控制在4~8当量,单步反应时间为10~15分钟。相较于常规高通量核酸合成仪(如192通道、12通道)的长链合成工艺,传统方案通常需使用8当量以上、甚至高达20倍的单体投料,才能趋近目标纯度,但实际产物纯度仍不理想,单步耦合效率普遍仅为0.99,且存在通量偏低、难以满足大规模需求等痛点。本工艺以解决上述问题为核心优化目标,在单体投料比与合成规模两方面均实现关键提升,综合性能优于市面常规工艺。


NestoOligo 100核酸合成仪


合成过程中的合成效率、UV、电导、压力等参数实时监控

序列合成全程监控

碱基合成实时监控

合成效率监控

bj.96weixin.com

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NestoOligo 100 上80nt的合成粗品结果

经色谱质谱分析,得到合成粗品纯度为64.56%,单步碱基的偶联效率可达99.4%,质谱正确。


Hicient L-2000Bio高效液相色谱

HPLC图谱(英赛斯)




MS图谱(分子量正确)



此案例采用使用英赛斯NestoOligo 100核酸合成仪完成,合成粗品纯度优异。充分展示显示了该NestoOligo 100系统优秀的合成效率和运行稳定性。


英赛斯小核酸整体解决方案



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