2026-04-15 15:52:13, Beibei Liu 诺坦普科技(北京)有限公司
关键词: MST|SpS|共价抑制剂||慢动力学分析
研究背景
共价抑制剂作为攻克难成药靶点、克服临床耐药的核心利器,早已成为新药研发的热门方向,从布鲁顿氏酪氨酸激酶(BTK)抑制剂伊曲替尼、表皮生长因子受体(EGFR)抑制剂奥希替,多款重磅药物的成功,让共价药物研发成为行业焦点。
可真正落地到实验环节,
常规方法却让无数研发人员频频碰壁
蛋白质谱成本高、蛋白用量大,心疼经费又耗样品
基于酶活性测定的为间接检测,实验设计复杂,且不适用于无酶活靶点
SPR等生物物理方法共价分子检测时,不同浓度配体分子无法洗脱,加上芯片无法再生,成本较高。更关键的是,共价键的形成需要一定反应时间,难以获得反映共价反应效率的关键参数Kinact / KI
针对以上研究的全流程痛点,NanoTemper推出 “光热混动”双核模式,经典的MST(微量热泳动)与创新的SpS(光谱位移)技术,在效率和成本两个维度给出了完美解决方案,依托高分文献实证,轻松实现亲和力表征、慢动力学分析,适配各类靶点,样品消耗极低,彻底打破传统技术局限!
研究内容
2026年1月自中国科学院分子细胞科学卓越创新中心、上海交通大学,赛岚医药的研究人员发表在Nature Chemical Biology的文章开发出胸腺嘧啶DNA糖基化酶(TDG)蛋白共价抑制剂,可在p53缺陷型癌症中诱导合成致死效应。
TDG在肿瘤中高表达,但在癌症进展中的作用机制以及靶向TDG的治疗应用仍不甚明确。在本研究中,作者发现抑制TDG可在p53缺陷的癌症中诱导合成致死效应(指两个基因中任一单独失活时细胞仍可存活,但两者同时失活则导致细胞死亡的现象)。
作者利用高通量药物筛选平台,筛选优化获得首个TDG共价抑制剂C-271,并解析了C-271通过靶向TDG活性位点附近的C276抑制其酶活。通过MST技术表征了C-271以高亲和力特异性结合TDG,而不与其他糖基化酶同系物结合。MST实验在溶液条件下进行,实验操作简单,进行一次亲和力检测,仅需极少量TDG蛋白(829ng) 。
图示:MST实验显示C-271与TDG的特异性结合
本研究首次揭示TDG与p53的合成致死关系,发现共价抑制剂C-271在p53缺陷肿瘤中选择性诱导免疫原性细胞死亡,为p53突变癌症这一"不可成药"靶点开辟了新的治疗策略。
共价药物与靶标发生结合主要分为两个过程:
(1) 可逆结合:形成初始非共价复合物,第一步的potency以 KI表征,KI表示达到最大潜在共价键形成速率一半时所需的抑制剂浓度
(2) 共价键形成:不可逆反应步骤,以 Kinact 表征,描述共价键形成的最大潜在速率。
共价化合物并不能简单用IC50来描述化合物对靶标的活性抑制。随着共价弹头活性以及非共价部分的亲和力改变,以及检测时间点、温度的变化,IC50会有较大的波动,而Kinact / KI能更好的表征共价化合物抑制效率[2]。
基于光谱位移技术SpS的Dianthus α提供共价化合物慢动力学分析(Slow Kinetics )。将梯度共价化合物和靶标蛋白混合后,置于Dianthus α仪器内,设定监控和间隔时间后,仪器自动完成检测,获得动力学曲线。
动力学监测(左图):较高浓度(蓝色/青色)比低浓度(黄色/绿色)更快达到饱和。虚线表示用于提取 kobs 值的指数拟合。
计算kinact / KI(右图):将kobs 与共价抑制剂浓度作图,非线性拟合得出 kinact =3.73×10⁻³ s⁻¹,KI=3.20×10⁻⁵ M,以及二阶速率常数kinact / KI=116.49 M⁻¹s⁻¹,符合两步共价结合机制的特征。

Dianthus α操作简单,仅需一份样品便可自动完成检测和计算,且适用于无酶活性的靶标蛋白表征。
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NanoTemper为您答疑解惑
MST和Spectral shift技术表征共价化合物,无需固定靶标分子,无额外成本增加。结合慢动力学方法获得kinact / KI,更好的了解共价化合物抑制效果。样品消耗量低,不限定靶标分子是否有酶活,均可轻松表征。
分子互作平台 Monolith X
攻克共价化合物互作检测难题,选对技术平台是关键。NanoTemper提供MST+Spectral Shift双平台,不用固定靶标、不费珍贵蛋白、不用反复更换耗材,可精准测出核心动力学参数kinact / KI,无酶活靶点、难成药靶点都能轻松测,彻底告别传统实验的诸多痛点。
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参考文献
1. Boike, Lydia, Nathaniel J. Henning, and Daniel K. Nomura. "Advances in covalent drug discovery." Nature Reviews Drug Discovery 21.12 (2022): 881-898.
2. Singh, Juswinder, et al. "The resurgence of covalent drugs." Nature reviews Drug discovery 10.4 (2011): 307-317.
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