Anal. Chem.新突破!清华大学团队携手Xevo™ MRT打造超高速单细胞代谢物质谱流式平台,通量飙升20倍

2026-04-13 09:54:46, 沃特世 沃特世科技(上海)有限公司


单细胞代谢组学是解码细胞异质性、推动精准医学发展的核心手段,而脂质作为细胞功能的关键执行者,其单细胞水平的精准分析对免疫研究、肿瘤生物学意义重大。但传统有机质谱流式技术受限于低通量,难以实现稀有细胞的快速筛查与海量样本的高效分析,成为领域发展的关键瓶颈。

近日,清华大学张四纯教授团队链接 - 红.pngWaters Xevo™ MRT高分辨质谱仪为核心检测单元,成功开发出一款高通量单细胞脂质质谱流式平台,相关研究成果发表于国际顶级分析化学期刊《Analytical Chemistry》(https://doi.org/10.1021/acs.analchem.6c00190)。该平台一举将单细胞分析通量提升至1064.5个细胞/分钟,较传统CyESI-MS(约38个细胞/分钟)和ILCEI-MS(约51个细胞/分钟)方法实现20倍飞跃,同时实现无标记、高精准的稀有细胞快速筛查,为单细胞脂质组学研究与临床转化搭建了全新高效技术体系!

图1. 高通量单细胞脂质质谱流式平台。


核心突破

双重设计解锁高通量分析新高度


针对传统技术的通量瓶颈,张四纯教授研究团队打造了集气体驱动聚焦流接口、稳定气动控制模块、Xevo MRT高分辨质谱于一体的集成化平台,从样本前处理到检测全程实现技术优化,核心突破体现在两方面

1

气体驱动聚焦流(SCFF)接口创新

定制3D打印喷嘴搭配高精度气路控制,将细胞均匀包裹为单分散微液滴,大幅减少溶剂用量、加速溶剂蒸发与离子释放,使单细胞驻留时间低至0.05 s,从源头突破分析效率限制;同时通过微流控系统实现细胞悬液恒流稳定输送,配合3.5 kV直流高压保障高效电离、降低背景噪声,为后续信号精准识别筑牢前处理基础。

2

Xevo MRT硬核性能支撑

作为平台的“检测核心”,Xevo MRT在100 Hz高扫描速率下,仍保持高达100,000 FWHM的质量分辨能力与fg级灵敏度,不仅能精准捕获单细胞脂质的微量特征信号,更可实现完整单细胞信号与细胞碎片、背景干扰的精准区分,为高通量分析下的精准定性定量提供关键保障。

实验证实,该平台的通量与细胞尺寸高度匹配,其中T细胞分析通量达1064.54个细胞/分钟,THP-1、HL-60细胞通量也分别实现243.87、493.52个细胞/分钟,且在流速、细胞浓度变化的情况下,单细胞信号持续稳定,展现出优异的检测重复性。

依托Xevo MRT的出色性能与平台的一体化设计,该技术不仅实现通量的跨越式提升,更在脂质覆盖、细胞分型、稀有细胞筛查、批次稳定性等方面展现出全方位优势,真正满足单细胞研究的实际需求:

高覆盖脂质分析,解锁单细胞脂质组全景

在正离子模式下,平台对m/z 650 - 950范围的脂质分子实现高效检测,从HL-60、Jurkat T等细胞中成功鉴定出141种脂质特征,涵盖磷脂酰胆碱(PC)、磷脂酰乙醇胺(PE)、鞘磷脂(SM)、甘油三酯(TG)等关键脂质类型,清晰解析单细胞脂质组的结构多样性,为细胞代谢表型分析提供全面分子依据。

图2. HL-60细胞单细胞脂质组分析与鉴定:(a)(b) 正离子模式下代表性单细胞质谱图(分m/z 680−850、850−950区间,标注关键脂质);(c) 鉴定脂质按脂肪酸不饱和度分类饼图(反映单细胞脂质组结构多样性)。

无标记精准分型,实现细胞类型特异性识别

基于脂质代谢指纹,平台无需抗体标记,即可对7种不同肿瘤细胞系(HeLa、HL-60、Jurkat T等)实现精准聚类区分,各细胞系展现出独特的脂质表达谱。通过筛选出6种高特异性脂质标志物,结合随机森林、线性判别分析(LDA)模型,细胞类型分类准确率达99.93%,细胞拒选率低至0.0006,实现超高置信度的细胞分型。

秒级筛查稀有细胞,攻克低丰度细胞检测难题

稀有细胞的精准识别是临床研究与诊断的关键需求,而该平台凭借高通量优势,实现了稀有免疫细胞的快速无标记筛查。在人外周血单个核细胞(PBMC)分析中,平台可在3分钟内精准识别丰度低至1.53%的树突状细胞(DCs),无需复杂的抗体染色与前处理,直接通过脂质代谢特征完成稀有细胞的定量与分型,为免疫研究、肿瘤微环境分析中的稀有细胞检测提供了高效方案。

超高批次稳定性,适配批量样本与临床研究

针对多批次样本分析的需求,平台展现出优异的重复性,批次间Pearson相关系数R>0.990;即使存在轻微批次差异,经Harmony算法校正后,可在保留细胞生物学差异的前提下实现数据完美整合,确保批量样本、临床队列研究中的数据可比性,为技术的临床转化奠定坚实基础。

图3. 基于Harmony算法的重复性验证与批次效应校正:a) 校正前3批HL-60细胞UMAP图(批次1存在显著批次效应);b) 整合前HL-60与Jurkat T细胞UMAP分布;c) 皮尔逊相关矩阵验证批次间超高重复性(R>0.990);d-f) Harmony算法校正后UMAP图:d) 3批HL-60细胞实现精准对齐,批次效应有效消除;e) 多批次HL-60与Jurkat T细胞整合分析结果;f) 两类细胞聚类边界清晰,生物学固有差异完整保留,随机森林分类准确率达99.93%。

硬核支撑

Xevo MRT - 

高通量单细胞分析的理想搭档


此次研究的成功,离不开Xevo MRT高分辨质谱仪的核心性能支撑,其为平台赋予了高扫描速度、高分辨率、高灵敏度的三重核心优势,完美适配单细胞脂质组学的高通量、微痕量检测需求:

1

100 Hz高扫描速率

匹配气体驱动聚焦流的高速进样接口,实现单细胞信号的快速捕获,不遗漏细胞事件;

2

超高分辨率

在100HZ高扫描速率下仍保持高达100,000 FWHM的质量分辨能力,精准区分脂质分子的细微质量差异,实现特异性定性;

3

高灵敏度检测

有效捕获单细胞中微量脂质的特征信号,让微痕量代谢物信号清晰可辨。

同时,链接 - 红.pngXevo MRT支持灵活的质谱参数优化,研究中通过锁定PC(34:1)特征峰、优化锥孔电压、脱溶剂温度等参数,进一步提升了检测的精准度与稳定性,成为高通量单细胞脂质分析的核心工具。

应用前景

从基础研究到临床转化

开启单细胞脂质研究新征程


这款以Xevo MRT为核心的高通量单细胞脂质质谱流式平台,凭借高通量、无标记、高覆盖、高稳定的独特优势,突破了传统技术的多重瓶颈,为单细胞脂质组学研究开辟了全新应用场景:

免疫细胞功能分析

快速解析PBMC中T细胞、B细胞、树突状细胞等亚群的脂质代谢特征,挖掘免疫细胞活化、分化的代谢调控机制;

肿瘤异质性研究

高通量分析肿瘤细胞系及肿瘤微环境中的细胞脂质谱,识别肿瘤干细胞、耐药细胞的特异性脂质标志物;

临床稀有细胞筛查

实现外周血、体液中低丰度临床相关细胞的快速无标记检测,为疾病早期诊断、疗效监测提供新方法;

药物研发与筛选

批量分析药物处理后单细胞的脂质代谢变化,精准评估药物对细胞的作用效果与代谢调控机制。

此次清华大学团队的研究成果,是单细胞脂质组学技术的重要突破,这既是科研团队创新实力的彰显,也是 Xevo MRT高分辨质谱仪卓越性能在单细胞分析领域的有力验证。作为沃特世重磅推出的高分辨质谱产品,Xevo MRT凭借高灵敏度、高分辨率、快速扫描的综合优势,与科研团队的技术创新相辅相成,成为单细胞代谢组学、脂质组学、临床质谱等领域的理想研究工具。

更多详细内容请见原文


本研究第一作者为清华大学化学系博士生杜沐蓉,通讯作者为清华大学化学系张四纯教授,以及北京佑安医院王文静教授、北京天坛医院葛培聪研究员。


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