2025-11-17 14:04:32, 熊晓生 极瞳生命科技(苏州)有限公司
在表面等离子体共振(SPR)分子互作实验中,传感图(Sensorgram) 是反映分子结合动力学、亲和力的 “直接语言”—— 它像 “分子互作的心电图”,实时记录芯片表面配体与分析物的结合、解离全过程。掌握传感图的解析逻辑、质量判断与问题排查方法,是避免实验 “走弯路”、获取可靠数据的核心。
本文从基础到进阶,系统梳理SPR传感图关键技术要点,助力实验人员高效开展研究。
01
SPR传感图:构成与定义
SPR Sensorgram: Composition and Definition
完整的SPR传感图一般由4个核心阶段组成,横/纵坐标的物理意义直接关联分子结合量,是解析的基础。
1)
四大核心阶段
2)
坐标与单位
横坐标:时间(单位:秒,s),覆盖从基线到解离结束的完整实验时序;
纵坐标:响应值(共振单位,RU),反映芯片表面分子结合量
单位定义:1 RU ≈ 1 pg/mm²(每平方毫米芯片表面结合1 pg 蛋白质,约产生1 RU信号变化)
02
一眼辨优劣:9大核心特征
9 Features to Judge the Superiority or Inferiority
实验数据可靠的前提是 “传感图质量达标”,可通过 “看基线、看突变、看曲线、看重复” 快速判断:
优质传感图需同时满足以下9大特征
稳定基线:缓冲液流动时,基线漂移较小,无高频噪声(排除温度、气泡干扰);
小折射率跳变(Bulk Shift):进样/停样瞬间,信号跳跃 <5 RU(说明样品与缓冲液折射率匹配,无非特异性干扰);
无质量传输限制:结合相为平滑指数曲线,非直线(确保结合由分子互作速率控制,而非扩散限速);
指数曲线形态:结合相呈指数增长、解离相呈指数衰减,曲线有明显曲率(符合1:1 Langmuir结合模型);
可达稳态:高浓度分析物注入时,信号能趋于水平状态(用于计算平衡亲和力KD);
充分解离:解离时间足够长(通常 180-600 s),信号衰减≥5%(确保解离速率常数kd计算准确);
合适响应值:结合最大响应值 Rmax<100 RU(减少分子空间位阻,降低质量传输,降低拟合偏差);
合理浓度梯度:分析物浓度覆盖 “0.1-10 倍KD”,曲线在图上均匀分布(无重叠或信号过弱);
重复可靠:至少 1 个浓度点设 2-3 次重复,重复曲线重叠度高(验证系统稳定性)
03
核心原理:动力学逻辑
Core Principles: Kinetics Logic
SPR分子互作最常见的1:1 Langmuir Isotherm模型下,结合相和解离相均呈 “单指数曲线”—— 这是判断数据是否符合理想互作的核心依据。
1)
1:1 结合模型与动力学公式
一个分子,即分析物(A),以可逆的方式与一个分子,即配体(B)结合。
ka(结合速率常数):反映分子结合效率(与分子大小、电荷、位阻相关),单位:M−1s−1;
kd(解离速率常数):反映复合物稳定性(与分子间化学键强度相关),单位:s−1;
KD(解离平衡常数):也被称为亲和力,表示平衡状态下一半配体被分析物占据时的分析物浓度,单位:M。数值上,KD=kd/ka,KD越小,亲和力越强。
在相互作用开始时,测量配体未接结合时的基线。然后通过引入分析物,形成配体-分析物(AB)配合物。相互作用形成的络合物的量(浓度)可以用微分方程来计算:

d[AB]/dt:结合净速率;
B0:配体初始浓度;
[AB]:复合物浓度;
[A]:分析物浓度
我们可以使用SPR设备的实时响应信号来替换以上公式:
dR/dt:响应值随时间的变化率,及结合曲线的瞬时斜率,单位RU/s;
C0:分析物的初始浓度,单位:M;
R:在时间 t 时的响应值,单位:RU;
Rmax:配体所能产生的最大理论响应值,单位:RU
2)
结合解离曲线及特征
① 结合相(指数增长):
Rt:在时间t时刻的响应值;
Req:随着注入分析物浓度的变化所能达到的最大响应(平衡响应);
C:分析物浓度
特征:当R远小于平衡响应值Req时,即初始阶段信号将快速上升; 随着R接近Req,上升逐渐平缓,最终接近水平状态。
在结合与解离达到平衡时,即dR/dt=0,此时可从上方公式得到Req与Rmax关系:
从传感图得知:
当平衡响应值Req大约为最大响应值 Rmax的一半时,KD 值等于分析物浓度
Req/Rmax比值与分析物浓度C0成线性关系
② 解离相(指数衰减):
R0:解离开始时的响应值;
t0:解离开始时的时间
特征:区别于结合曲线,解离曲线仅由kd决定 ——kd越小(复合物越稳定),曲线越平缓
此外,还可通过半衰期t1/2=ln(2)/kd 直观判断稳定性,如kd=10−3s−1时,t1/2≈693 s ≈12 min,复合物稳定:
③ 典型曲线:
这些曲线在结合率和解离率上有所不同,但其形状都属于指数型。曲线由左至右为相对更快的结合速率及解离速率。然而,不能直接从图形比较结合速率,因为结合速率也取决于分析物浓度(参考前面动力学公式)。
04
质传效应:别让数据失真
Mass-transpor Limited: Ensure the Authenticity of the Data
SPR分子互作最常见的1:1 Langmuir Isotherm模型下,结合相和解离相均呈 “单指数曲线”—— 这是判断数据是否符合理想互作的核心依据。
然而,有时候曲线看起来却是线性而非指数型。
这种情况一般是一种叫“质传效应(MTL,Mass-transfer Limited)”的现象限制了动力学。
1)
质量传输限制(MTL)的本质
如上图所示,由于B(Ligand)相固定于芯片表面,A(Analyte)、B两种物质的结合行为并非均相混合。所以在使用模型时,必须要考虑到分子扩散的影响,即质传效应(MTL)。在分析物注入开始后,当分析物与配体的结合速度比分析物向配体的扩散速度快,传感芯片表面就来不及补充,造成分析物短缺。这种形成的原因可能是配体固定密度过高、分子亲和力极强或者缓冲液流速过慢。
2)
如何避免质传效应(MTL)
ka(结合速率常数):单位M−1s−1,反映分子结合效率(与分子大小、电荷、位阻相关);
kd(解离速率常数):单位s−1,反映复合物稳定性(与分子间化学键强度相关);
km(质量传输系数):单位m·s-1,与质量迁移与分析物A的扩散系数(D)、流动池经过的体积流速(v)以及流动池的长宽高(h、w、l)相关;
kf(正向反应速率):分子相互作用中分析物从流路体相到芯片表面形成复合物的速率;
kr(逆向反应速率):分子相互作用中复合物从芯片表面解离并回到流路体相的速率;
KD(平衡解离常数):也被称为亲和力,表示平衡状态下一半配体被分析物占据时的分析物浓度。KD=ka/kd(单位 M),KD越小,亲和力越强。
从以上推导的公式我们可以得到以下结论:
km越大(扩散越快),kf和kr越接近ka,kd,越符合模型;
ka[B]应远小于km,所以在ka较大的情况下(结合速率较快),减小[B] (即Rmax) 以确保动力学数据的准确性;
km的影响因素包括流动池的尺寸、扩散系数、流速。其中仪器设计决定了流动池的物理尺寸,分析物的分子量大小决定了扩散系数(分子量越小,扩散系数越大)。因此,在确定了实验体系的情况下,可适当提高流速提高km大小
可靠的动力学分析需要减少质传效应(扩散控制),因此要提高流速(通常为30 μL/min)、降低B物质(即配体Ligand)含量(通常控制饱和载量Rmax<100 RU)等措施。这就代表需要高灵敏度的传感器来捕捉变化,SPR无疑是目前最优的一种技术。
参考极瞳生命历史文章:质传效应 — SPR动力学试验中不可忽略的现象
05
实时观察:实验中的 “动态质控”
Real-time Observation:"Dynamic Quality Control"
实验过程中主动观察传感图,建议同时查看实验通道(B)、参比通道(A)、扣减后通道(B-A),可及时发现问题并调整,避免浪费样品与时间:
如果异常信号在A和B通道中存在,但在扣除后消失,该异常通常是系统性的(如折射率效应、非特异性结合),数据仍然可信;
如果异常信号在扣除后依然存在:该异常是与特异性相互作用相关的,需要高度重视,如双相结合(如下图,存在多种快慢不同的结合情况使其严重偏离指数型拟合曲线)或不完全解离
注意检查5个关键节点
基线期:看系统稳定性
信号是否平稳,有无漂移 / 噪声;
持续漂移→延长平衡时间(如缓冲液冲洗 30-60 min),无效则清洗流路;高频噪声→执行月度维护操作排除气泡和污染,检查电源稳定性
进样期:看折射率突变
进样/停样瞬间,信号跳跃大小和形状
跳跃> 5 RU→下次实验需通过透析 / 稀释使样品与缓冲液匹配;跳跃形状异常(缓慢上升/下降)→排查流路堵塞或气泡
结合相:看动力学控制类型
前30-60s曲线形状;
曲线呈直线→MTL(按上文对策调整);曲线有 “拐点”(双相结合)→排查样品纯度(如杂质干扰);信号 “先升后降”(快速隆起再趋于平缓的驼峰)→检查缓冲液去垢剂浓度或存在竞争
稳态期:看是否达平衡
信号是否水平;
持续缓慢上升→延长进样时间,或优化缓冲液(如加 BSA 减少非特异性结合);始终无法变平→非特异性吸附,重新固定配体(降低密度)
解离期:看再生需求
初始下降速度、末期残留信号;
几乎无下降(曲线水平)→解离慢或不可逆,提前测试再生条件(如低 pH 、高盐)但不破坏配体活性;残留信号高→不完全解离或非特异性吸附,增加再生时间或调整再生试剂(确保不破坏配体活性)
一般发生以下情况可以考虑中止实验:
基线呈现出持续性的大幅度飘移现象;
信号中出现剧烈且持续的尖锐峰值,该现象或表明存在严重的气泡干扰或污染问题;
所有浓度梯度下的结合曲线均未检测到信号,且在已排除浓度过低这一因素的前提下,该情况可能意味着配体已丧失活性;
非特异性吸附问题十分严重,导致信号完全偏离真实情况,无法反映实际数据。
06
数据 “落地”:曲线拟合与验证
Data "Landing": Curve Fitting and Validation
漂亮的拟合未必反映真实规律,看似 “丑陋” 的拟合却可能最贴合数据本质和科学,因为拟合的核心是 “让模型匹配数据”,而非 “让数据匹配模型”。
以1:1 Langmuir 模型为首选,按 3 步完成拟合与验证:
1)
拟合前:数据质量检查
确保传感图满足 “基线稳、无 MTL、曲线为单指数”,否则不建议拟合
2)
拟合中:参数设置与优化
初始设置
折射率RI = 0
ka = 1*105 M-1s-1
kd = 1*10-3 s-1
物质迁移常数Tc为1E8
拟合:全局模式
优化技巧
用不同数量级初始值重复拟合(如ka取4~6次方),若结果收敛,说明参数可靠
3)
拟合后:3 重验证
曲线重合度
拟合线与实测曲线重叠;重复弯曲;残差较小
参数合理性
ka在103~107 M−1s−1范围内
kd在10−5~1 s−1范围内
干扰项检查
07
成果输出:传感图的规范呈现
Standard Presentation of Senorgram in the Paper
1)
传感图的规范标注
坐标轴:纵轴标 “响应值(RU)”,横轴标 “时间(s)”,刻度均匀无断轴;
曲线:同时展示实测曲线、重复曲线、拟合线,标注分析物浓度(如 62.5 nM、31.3 nM);
图注:包含实验对象、曲线类型、关键参数(ka、kd、KD及误差),参数符号斜体(如ka、KD),单位符合 SI 标准。
2)
方法描述:13 个核心要素
为确保他人可重复实验,需包含以下内容:
用于分析的仪器型号;
配体和分析物的产品、来源、分子量;
传感芯片类型
偶联条件
配体密度
缓冲液体系
实验温度
分析物浓度
再生条件
结合响应的拟合图
叠加重复性曲线
数据拟合模型
带有标准误差的结合常数
3)
文字发表建议
The surface plasmon resonance experiments were performed using a Polariton S-CLASS equipped with a research-grade C5 sensor chip. The ligand (60 kDa,>90% pure based on SDS–PAGE) was immobilized using amine-coupling chemistry. The surfaces of all four flow cells were activated for 7 min with a 1:1 mixture of 0.1 M NHS (N-hydroxysuccinimide) and 0.1 M EDC (3-(N,N-dimethylamino) propyl-N-ethylcarbodiimide) at a flow rate of 5 μl/min. The ligand at a concentration of 5 μg/ml in 10 mM sodium acetate, pH 5.0, was immobilized at a density of 200 RU on flow cell 2; flow cell 1 was left blank to serve as a reference surface. All the surfaces were blocked with a 7 min injection of 1 M ethanolamine, pH 8.0. To collect kinetic binding data, the analyte (34 kDa, >95% pure based on SDS–PAGE) in 10 mM HEPES, 150 mM NaCl, 0.005% P20, pH 7.4, was injected over the two flow cells at concentrations of 90, 30, 10, 3.3 and 1.1 nM at a flow rate of 60 μl/min and at a temperature of 20°C. The complex was allowed to associate and dissociate for 90 and 300s, respectively. The surfaces were regenerated with a 5 s injection of 10 mM H3PO4. Triplicate injections (in random order) of each sample and a buffer blank were flowed over the two surfaces. Data were collected at a rate of 1 Hz. The data were fit to a simple 1:1 interaction model using the global data analysis option available within Polaris Control & Analysis Software 1.7 software.
The above content is partially based on the information from the following website: https://www.sprpages.nl
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