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英拜生物 siRNA载体构建服务程序: 1. siRNA表达载体的选用: 本公司选用的siRNA表达载体含新霉素抗性基因和GFP绿色萤光标记,可以建立稳定表达系,同时可以实时监测载体在细胞中的转染效率。载体中还含有Amp 抗性基因,可以无限扩增。 2. 设计siRNA 靶序列 A、根据目的mRNA序列,设计3 条RNA干扰靶序列,靶序列一般为19-21nt长。 B、对于每条选定的siRNA靶序列,设计siRNA正义链和反义链,以loop(9nt)相连,称为shRNA(short hairpin RNA)。 3. 合成模板: 合成每条编码shRNA的DNA 模板的两条单链,退火DNA 单链得到shRNA的DNA双链模板。模板链后面接有RNA PolyIII聚合酶转录中止位点, 同时两端分别设计BamHI和HindIII酶切位点, 可以克隆到siRNA载体多克隆位点的BamHI 和 HindIII酶切位点之间。 4. siRNA空载体用BamHI 和 HindIII双酶切后,1%琼脂糖凝胶电泳,回收线性载体。 5. 连接与转化: 把退火的DNA 模板双链连接到线性载体中。采用T4连接酶,插入片断与载体的摩尔比约为3:1。连接产物转化DH5α 大肠杆菌,在LB Amp培养基上涂板,37℃培养过夜。 6. PCR鉴定: 挑取转化的菌落PCR,2%琼脂糖凝胶电泳鉴定具有shRNA编码序列的阳性克隆(图例)。 7.测序鉴定: 对PCR鉴定阳性的克隆再进行测序鉴定,确定shRNA编码框架和模板序列正确无误(图例)。 8. 柱抽提阳性克隆载体并定量。 siRNA 序列的siRNA™试剂盒包括: √ 3条编码shRNA的载体(各10µg),保证其中一条siRNA 序列的有效. √ 1条编码阴性对照shRNA的载体(10µg) 采用的阴性对照是通用序列,在人和小鼠的基因组中都没有同源位点; √ 大肠杆菌DH5α菌株 √ siRNA载体的构建、鉴定记录及使用说明。
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